MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 57898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_018719	ATT	2	6	1017431	1017436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21002	NC_018719	AGA	2	6	1017492	1017497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408403912
21003	NC_018719	GTT	2	6	1017514	1017519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408403912
21004	NC_018719	TCT	2	6	1017528	1017533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403912
21005	NC_018719	ACA	2	6	1017543	1017548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408403912
21006	NC_018719	GAG	2	6	1017720	1017725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408403912
21007	NC_018719	TC	3	6	1017729	1017734	0 %	50 %	0 %	50 %	408403912
21008	NC_018719	T	6	6	1017741	1017746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21009	NC_018719	TGC	2	6	1017777	1017782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403913
21010	NC_018719	CTG	2	6	1017801	1017806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403913
21011	NC_018719	CT	3	6	1017840	1017845	0 %	50 %	0 %	50 %	408403913
21012	NC_018719	TTG	2	6	1017850	1017855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408403913
21013	NC_018719	CTT	2	6	1017860	1017865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403913
21014	NC_018719	TGAGC	2	10	1017885	1017894	20 %	20 %	40 %	20 %	408403913
21015	NC_018719	GCCGA	2	10	1017895	1017904	20 %	0 %	40 %	40 %	408403913
21016	NC_018719	GCA	2	6	1017962	1017967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403913
21017	NC_018719	CTTT	2	8	1018031	1018038	0 %	75 %	0 %	25 %	408403913
21018	NC_018719	TCT	2	6	1018063	1018068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403913
21019	NC_018719	GTAT	2	8	1018208	1018215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21020	NC_018719	AT	4	8	1018273	1018280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_018719	TGG	2	6	1018387	1018392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408403914
21022	NC_018719	GGACA	2	10	1018434	1018443	40 %	0 %	40 %	20 %	408403914
21023	NC_018719	TAA	2	6	1018466	1018471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408403914
21024	NC_018719	GAC	2	6	1018496	1018501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403914
21025	NC_018719	TGC	2	6	1018537	1018542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403914
21026	NC_018719	ATT	2	6	1018572	1018577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408403914
21027	NC_018719	AT	3	6	1018637	1018642	50 %	50 %	0 %	0 %	408403914
21028	NC_018719	GTA	2	6	1018716	1018721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_018719	AGC	2	6	1018734	1018739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21030	NC_018719	TCG	2	6	1018764	1018769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21031	NC_018719	AGC	2	6	1018806	1018811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21032	NC_018719	CGT	2	6	1018840	1018845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21033	NC_018719	CTT	2	6	1018859	1018864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403915
21034	NC_018719	AGG	2	6	1018964	1018969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408403915
21035	NC_018719	TTC	2	6	1019006	1019011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403915
21036	NC_018719	GCT	2	6	1019017	1019022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21037	NC_018719	GCT	2	6	1019083	1019088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21038	NC_018719	CAG	2	6	1019149	1019154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21039	NC_018719	TCA	2	6	1019184	1019189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408403915
21040	NC_018719	ATC	2	6	1019219	1019224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408403915
21041	NC_018719	ATAC	2	8	1019231	1019238	50 %	25 %	0 %	25 %	408403915
21042	NC_018719	GC	3	6	1019253	1019258	0 %	0 %	50 %	50 %	408403915
21043	NC_018719	GGT	2	6	1019280	1019285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408403915
21044	NC_018719	AT	3	6	1019331	1019336	50 %	50 %	0 %	0 %	408403915
21045	NC_018719	GCTG	2	8	1019355	1019362	0 %	25 %	50 %	25 %	408403915
21046	NC_018719	TTC	2	6	1019381	1019386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403915
21047	NC_018719	AGC	2	6	1019410	1019415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21048	NC_018719	TTG	2	6	1019426	1019431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408403915
21049	NC_018719	TTC	2	6	1019495	1019500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403915
21050	NC_018719	GAT	2	6	1019524	1019529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403915
21051	NC_018719	AGGC	2	8	1019530	1019537	25 %	0 %	50 %	25 %	408403915
21052	NC_018719	TCA	2	6	1019640	1019645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408403915
21053	NC_018719	GCG	2	6	1019699	1019704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408403915
21054	NC_018719	TGG	2	6	1019724	1019729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408403915
21055	NC_018719	TGC	2	6	1019815	1019820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403915
21056	NC_018719	GAAGC	2	10	1019931	1019940	40 %	0 %	40 %	20 %	408403915
21057	NC_018719	GCC	2	6	1019956	1019961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408403915
21058	NC_018719	CAA	2	6	1019969	1019974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408403915
21059	NC_018719	GCG	2	6	1019995	1020000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408403915
21060	NC_018719	CTTT	2	8	1020006	1020013	0 %	75 %	0 %	25 %	408403916
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21062	NC_018719	GCT	2	6	1020055	1020060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403916
21063	NC_018719	CGCC	2	8	1020121	1020128	0 %	0 %	25 %	75 %	408403916
21064	NC_018719	TGTAT	2	10	1020244	1020253	20 %	60 %	20 %	0 %	408403916
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21069	NC_018719	C	6	6	1020337	1020342	0 %	0 %	0 %	100 %	408403916
21070	NC_018719	T	6	6	1020348	1020353	0 %	100 %	0 %	0 %	408403916
21071	NC_018719	AC	3	6	1020454	1020459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21072	NC_018719	TAAA	2	8	1020499	1020506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21073	NC_018719	GCA	2	6	1020535	1020540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403917
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21076	NC_018719	TCATGA	2	12	1020774	1020785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408403917
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21079	NC_018719	TAAC	2	8	1020951	1020958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21086	NC_018719	CATT	2	8	1021215	1021222	25 %	50 %	0 %	25 %	408403918
21087	NC_018719	GCG	2	6	1021223	1021228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408403918
21088	NC_018719	GTG	2	6	1021229	1021234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408403918
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21091	NC_018719	CG	3	6	1021358	1021363	0 %	0 %	50 %	50 %	408403918
21092	NC_018719	TCAA	2	8	1021427	1021434	50 %	25 %	0 %	25 %	408403918
21093	NC_018719	CGT	2	6	1021446	1021451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403918
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21100	NC_018719	AAAG	2	8	1021966	1021973	75 %	0 %	25 %	0 %	408403919
21101	NC_018719	TGA	2	6	1022024	1022029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403920
21102	NC_018719	CAGTG	2	10	1022075	1022084	20 %	20 %	40 %	20 %	408403920
21103	NC_018719	GAC	2	6	1022142	1022147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403920
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21105	NC_018719	CACC	2	8	1022368	1022375	25 %	0 %	0 %	75 %	408403920
21106	NC_018719	CAG	2	6	1022387	1022392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403920
21107	NC_018719	CTTT	2	8	1022567	1022574	0 %	75 %	0 %	25 %	408403920
21108	NC_018719	AGC	2	6	1022658	1022663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403920
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21110	NC_018719	CT	3	6	1022869	1022874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21111	NC_018719	GCA	2	6	1022896	1022901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21112	NC_018719	TCTT	2	8	1022908	1022915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21113	NC_018719	AGCGG	2	10	1022919	1022928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21114	NC_018719	ATG	2	6	1022935	1022940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21115	NC_018719	TA	3	6	1023024	1023029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21116	NC_018719	AT	3	6	1023040	1023045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21117	NC_018719	T	6	6	1023066	1023071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21118	NC_018719	TATT	2	8	1023079	1023086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_018719	ATT	2	6	1023104	1023109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_018719	GCT	2	6	1023258	1023263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403921
21121	NC_018719	GCCT	2	8	1023280	1023287	0 %	25 %	25 %	50 %	408403921
21122	NC_018719	CGC	2	6	1023341	1023346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408403921
21123	NC_018719	GGCT	2	8	1023406	1023413	0 %	25 %	50 %	25 %	408403921
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21125	NC_018719	TG	3	6	1023485	1023490	0 %	50 %	50 %	0 %	408403921
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21477	NC_018719	GGCT	2	8	1040331	1040338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21478	NC_018719	GCA	2	6	1040352	1040357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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