MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 57898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018719	CGT	2	6	539381	539386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403324
11002	NC_018719	TCT	2	6	539483	539488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403324
11003	NC_018719	ACA	2	6	539532	539537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_018719	T	6	6	539557	539562	0 %	100 %	0 %	0 %	408403325
11005	NC_018719	GCCG	2	8	539616	539623	0 %	0 %	50 %	50 %	408403325
11006	NC_018719	CAA	2	6	539630	539635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408403325
11007	NC_018719	TAT	3	9	539649	539657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408403325
11008	NC_018719	GCT	2	6	539717	539722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403325
11009	NC_018719	CAG	2	6	539741	539746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403325
11010	NC_018719	TGC	2	6	539841	539846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403325
11011	NC_018719	GCA	2	6	539926	539931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403325
11012	NC_018719	GAT	2	6	539953	539958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403325
11013	NC_018719	TGC	3	9	540021	540029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403325
11014	NC_018719	CCGC	2	8	540030	540037	0 %	0 %	25 %	75 %	408403325
11015	NC_018719	CAGC	2	8	540110	540117	25 %	0 %	25 %	50 %	408403325
11016	NC_018719	GCC	2	6	540142	540147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408403325
11017	NC_018719	AAT	2	6	540236	540241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408403325
11018	NC_018719	AGA	2	6	540276	540281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408403325
11019	NC_018719	CAA	2	6	540317	540322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408403325
11020	NC_018719	CCA	2	6	540344	540349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408403325
11021	NC_018719	ATG	2	6	540423	540428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403325
11022	NC_018719	CCT	2	6	540448	540453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408403326
11023	NC_018719	GCC	2	6	540456	540461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408403326
11024	NC_018719	TCC	2	6	540522	540527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408403326
11025	NC_018719	TGC	2	6	540530	540535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403326
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11027	NC_018719	CTG	2	6	540808	540813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403326
11028	NC_018719	TAGA	2	8	540901	540908	50 %	25 %	25 %	0 %	408403326
11029	NC_018719	T	6	6	540924	540929	0 %	100 %	0 %	0 %	408403326
11030	NC_018719	GGT	2	6	541003	541008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408403326
11031	NC_018719	CCT	2	6	541020	541025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408403326
11032	NC_018719	TGA	2	6	541076	541081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403326
11033	NC_018719	ATC	2	6	541109	541114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408403326
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11035	NC_018719	TGA	2	6	541442	541447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403327
11036	NC_018719	CG	3	6	541455	541460	0 %	0 %	50 %	50 %	408403327
11037	NC_018719	TGT	3	9	541634	541642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408403327
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11039	NC_018719	CA	3	6	541849	541854	50 %	0 %	0 %	50 %	408403327
11040	NC_018719	CT	3	6	541880	541885	0 %	50 %	0 %	50 %	408403327
11041	NC_018719	AGT	2	6	541913	541918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403327
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11043	NC_018719	CAT	2	6	542003	542008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408403327
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11045	NC_018719	ATATGG	2	12	542032	542043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403327
11046	NC_018719	GGAA	2	8	542130	542137	50 %	0 %	50 %	0 %	408403328
11047	NC_018719	CAA	2	6	542142	542147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408403328
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11051	NC_018719	ATA	2	6	542195	542200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408403328
11052	NC_018719	ATG	2	6	542273	542278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403328
11053	NC_018719	TCC	2	6	542313	542318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408403328
11054	NC_018719	GT	3	6	542338	542343	0 %	50 %	50 %	0 %	408403328
11055	NC_018719	AAT	2	6	542415	542420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408403328
11056	NC_018719	TAG	2	6	542448	542453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408403328
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11059	NC_018719	AGG	2	6	542550	542555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408403328
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11072	NC_018719	TA	3	6	543245	543250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_018719	TTG	2	6	543256	543261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_018719	TTGG	2	8	543306	543313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11076	NC_018719	GACAG	2	10	543349	543358	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11086	NC_018719	TC	3	6	543812	543817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_018719	CCT	2	6	543852	543857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11089	NC_018719	TTG	2	6	543936	543941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_018719	TGC	2	6	543998	544003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11092	NC_018719	GCCC	2	8	544093	544100	0 %	0 %	25 %	75 %	408403329
11093	NC_018719	T	6	6	544123	544128	0 %	100 %	0 %	0 %	408403329
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11098	NC_018719	CA	3	6	544447	544452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11099	NC_018719	GTT	3	9	544459	544467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_018719	ATT	2	6	544484	544489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_018719	TAA	2	6	544510	544515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_018719	TAT	2	6	544518	544523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_018719	AAT	2	6	544540	544545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_018719	AGC	2	6	544557	544562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403330
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11107	NC_018719	ATT	2	6	544666	544671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408403330
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11109	NC_018719	A	6	6	544782	544787	100 %	0 %	0 %	0 %	408403330
11110	NC_018719	AAG	2	6	544861	544866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_018719	GA	4	8	544910	544917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_018719	CATAT	2	10	544955	544964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11113	NC_018719	GTT	2	6	545024	545029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_018719	TCT	2	6	545044	545049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_018719	TGA	2	6	545092	545097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_018719	AATCA	2	10	545176	545185	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11117	NC_018719	TAA	2	6	545214	545219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_018719	T	6	6	545227	545232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_018719	ATA	2	6	545263	545268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_018719	ACA	2	6	545279	545284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_018719	CA	3	6	545296	545301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_018719	GCA	2	6	545372	545377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11124	NC_018719	AAAG	2	8	545530	545537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11353	NC_018719	AAC	2	6	556395	556400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11354	NC_018719	A	6	6	556465	556470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11355	NC_018719	GAGC	2	8	556506	556513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11356	NC_018719	GC	3	6	556618	556623	0 %	0 %	50 %	50 %	408403343
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11491	NC_018719	GCA	2	6	563769	563774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408403348
11492	NC_018719	CTG	2	6	563861	563866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403349
11493	NC_018719	CTG	2	6	563942	563947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408403349
11494	NC_018719	TGGC	2	8	563960	563967	0 %	25 %	50 %	25 %	408403349
11495	NC_018719	CTT	2	6	563995	564000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408403349
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11499	NC_018719	CT	3	6	564323	564328	0 %	50 %	0 %	50 %	408403349
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