MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 57898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018719	TAATA	2	10	22600	22609	60 %	40 %	0 %	0 %	408402649
502	NC_018719	CGC	2	6	22614	22619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_018719	C	6	6	22619	22624	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
504	NC_018719	CTCTTT	2	12	22629	22640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_018719	CAAG	2	8	22656	22663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_018719	TGA	2	6	22854	22859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402650
507	NC_018719	T	6	6	22895	22900	0 %	100 %	0 %	0 %	408402650
508	NC_018719	GGC	2	6	22901	22906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402650
509	NC_018719	GCT	2	6	22945	22950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402650
510	NC_018719	AAG	2	6	22958	22963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402650
511	NC_018719	GCA	2	6	22984	22989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402650
512	NC_018719	ACA	2	6	22993	22998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402650
513	NC_018719	ACA	3	9	23043	23051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402650
514	NC_018719	GAT	2	6	23065	23070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402650
515	NC_018719	CAT	2	6	23083	23088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402650
516	NC_018719	TTC	2	6	23099	23104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402650
517	NC_018719	ATG	2	6	23111	23116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402650
518	NC_018719	GGC	2	6	23162	23167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402650
519	NC_018719	GAGG	2	8	23168	23175	25 %	0 %	75 %	0 %	408402650
520	NC_018719	CGG	2	6	23188	23193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402650
521	NC_018719	GGT	2	6	23201	23206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402650
522	NC_018719	CGG	2	6	23221	23226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402650
523	NC_018719	GGC	2	6	23243	23248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402650
524	NC_018719	GGC	2	6	23255	23260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402650
525	NC_018719	TCT	3	9	23297	23305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402651
526	NC_018719	GAA	2	6	23308	23313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402651
527	NC_018719	GGC	2	6	23319	23324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402651
528	NC_018719	CAAG	2	8	23471	23478	50 %	0 %	25 %	25 %	408402651
529	NC_018719	CAAG	2	8	23516	23523	50 %	0 %	25 %	25 %	408402651
530	NC_018719	TGAC	2	8	23549	23556	25 %	25 %	25 %	25 %	408402651
531	NC_018719	CTC	2	6	23622	23627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402651
532	NC_018719	GAC	2	6	23724	23729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_018719	CCA	2	6	23758	23763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_018719	CAG	2	6	23789	23794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_018719	GCC	2	6	23810	23815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_018719	GCAA	2	8	23817	23824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_018719	CAA	2	6	23935	23940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_018719	GC	3	6	24064	24069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_018719	CTA	2	6	24107	24112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_018719	CAT	2	6	24113	24118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402652
541	NC_018719	GTG	2	6	24142	24147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402652
542	NC_018719	GTGCAT	2	12	24154	24165	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408402652
543	NC_018719	GAA	2	6	24241	24246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402652
544	NC_018719	GCT	2	6	24271	24276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402652
545	NC_018719	T	6	6	24346	24351	0 %	100 %	0 %	0 %	408402652
546	NC_018719	GCT	2	6	24459	24464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402652
547	NC_018719	CCT	2	6	24487	24492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402652
548	NC_018719	CAA	2	6	24505	24510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402652
549	NC_018719	TTG	2	6	24554	24559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402652
550	NC_018719	TCT	2	6	24587	24592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402652
551	NC_018719	CTT	2	6	24657	24662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402652
552	NC_018719	GCAT	2	8	24729	24736	25 %	25 %	25 %	25 %	408402652
553	NC_018719	CAG	2	6	24781	24786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402652
554	NC_018719	TGT	2	6	24813	24818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402652
555	NC_018719	CAC	2	6	24823	24828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402652
556	NC_018719	ACT	3	9	24869	24877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402652
557	NC_018719	GTT	2	6	24878	24883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402652
558	NC_018719	TGC	2	6	24955	24960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402653
559	NC_018719	CGAT	2	8	24967	24974	25 %	25 %	25 %	25 %	408402653
560	NC_018719	TCT	2	6	25057	25062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402653
561	NC_018719	ATT	2	6	25102	25107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402653
562	NC_018719	TGCTG	2	10	25157	25166	0 %	40 %	40 %	20 %	408402653
563	NC_018719	CGT	2	6	25202	25207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402653
564	NC_018719	AGCTCT	2	12	25243	25254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408402653
565	NC_018719	GCA	2	6	25282	25287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402653
566	NC_018719	TCGCG	2	10	25343	25352	0 %	20 %	40 %	40 %	408402653
567	NC_018719	TCA	2	6	25429	25434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402653
568	NC_018719	TCT	4	12	25438	25449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402653
569	NC_018719	TCA	3	9	25459	25467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402653
570	NC_018719	ATC	2	6	25518	25523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402653
571	NC_018719	TGA	2	6	25550	25555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402653
572	NC_018719	GCG	2	6	25592	25597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402653
573	NC_018719	GCCG	2	8	25623	25630	0 %	0 %	50 %	50 %	408402653
574	NC_018719	CCT	2	6	25660	25665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402653
575	NC_018719	CTA	2	6	25732	25737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402653
576	NC_018719	TGT	3	9	25741	25749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402653
577	NC_018719	GCTCT	2	10	25822	25831	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
578	NC_018719	CCT	2	6	25850	25855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_018719	ATT	2	6	25861	25866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018719	AT	3	6	25871	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018719	TAA	2	6	25885	25890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018719	TAA	3	9	25918	25926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018719	ACG	2	6	25961	25966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402654
584	NC_018719	CTG	2	6	26050	26055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402654
585	NC_018719	CGA	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402654
586	NC_018719	ACG	2	6	26176	26181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402654
587	NC_018719	ACA	2	6	26189	26194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402654
588	NC_018719	GGA	2	6	26244	26249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402654
589	NC_018719	CAAA	2	8	26279	26286	75 %	0 %	0 %	25 %	408402654
590	NC_018719	T	6	6	26328	26333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018719	ACGCG	2	10	26356	26365	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
592	NC_018719	AGC	2	6	26383	26388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018719	AAAG	2	8	26447	26454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018719	GTA	2	6	26493	26498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402655
595	NC_018719	TAT	2	6	26541	26546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402655
596	NC_018719	TAC	2	6	26550	26555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402655
597	NC_018719	GC	3	6	26594	26599	0 %	0 %	50 %	50 %	408402655
598	NC_018719	CGA	2	6	26615	26620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402655
599	NC_018719	CCGGC	2	10	26704	26713	0 %	0 %	40 %	60 %	408402655
600	NC_018719	AG	3	6	26723	26728	50 %	0 %	50 %	0 %	408402655
601	NC_018719	TCA	2	6	26776	26781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402655
602	NC_018719	AGGC	2	8	26835	26842	25 %	0 %	50 %	25 %	408402655
603	NC_018719	GCCG	2	8	26847	26854	0 %	0 %	50 %	50 %	408402655
604	NC_018719	CGG	2	6	26909	26914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402655
605	NC_018719	ATCG	2	8	27131	27138	25 %	25 %	25 %	25 %	408402655
606	NC_018719	GCGCG	2	10	27196	27205	0 %	0 %	60 %	40 %	408402655
607	NC_018719	TTG	2	6	27247	27252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402655
608	NC_018719	GCC	2	6	27265	27270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402655
609	NC_018719	AAT	3	9	27276	27284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402655
610	NC_018719	CGG	2	6	27299	27304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402655
611	NC_018719	GATA	2	8	27342	27349	50 %	25 %	25 %	0 %	408402655
612	NC_018719	AATA	2	8	27350	27357	75 %	25 %	0 %	0 %	408402655
613	NC_018719	GC	3	6	27403	27408	0 %	0 %	50 %	50 %	408402656
614	NC_018719	CAG	2	6	27443	27448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402656
615	NC_018719	GCC	2	6	27451	27456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
616	NC_018719	CTG	2	6	27512	27517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
617	NC_018719	ATA	2	6	27604	27609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402656
618	NC_018719	GGA	2	6	27610	27615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402656
619	NC_018719	GCG	2	6	27721	27726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
620	NC_018719	GGC	2	6	27754	27759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
621	NC_018719	CAAA	2	8	27782	27789	75 %	0 %	0 %	25 %	408402656
622	NC_018719	CTG	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
623	NC_018719	AATG	2	8	27814	27821	50 %	25 %	25 %	0 %	408402656
624	NC_018719	GC	3	6	27854	27859	0 %	0 %	50 %	50 %	408402656
625	NC_018719	GCC	2	6	27928	27933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
626	NC_018719	AGAC	2	8	27965	27972	50 %	0 %	25 %	25 %	408402656
627	NC_018719	CGC	2	6	28001	28006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
628	NC_018719	GGA	2	6	28051	28056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402656
629	NC_018719	GTC	2	6	28071	28076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
630	NC_018719	GAT	2	6	28102	28107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402656
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654	NC_018719	T	6	6	28940	28945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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750	NC_018719	TTTG	2	8	33459	33466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
751	NC_018719	TGTAT	2	10	33473	33482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
752	NC_018719	CTG	2	6	33499	33504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_018719	CTTG	2	8	33539	33546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
754	NC_018719	CGT	2	6	33637	33642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_018719	GCC	2	6	33695	33700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
756	NC_018719	TCC	2	6	33701	33706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
757	NC_018719	CAAC	2	8	33735	33742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
758	NC_018719	ACT	2	6	33748	33753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
759	NC_018719	TCG	2	6	33792	33797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402668
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