MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 chromosome

Total Repeats: 38713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018709	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	407941473
2	NC_018709	CTAT	2	8	63	70	25 %	50 %	0 %	25 %	407941473
3	NC_018709	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	407941473
4	NC_018709	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	407941473
5	NC_018709	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	407941473
6	NC_018709	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941473
7	NC_018709	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941473
8	NC_018709	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407941473
9	NC_018709	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	407941473
10	NC_018709	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	407941473
11	NC_018709	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941473
12	NC_018709	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941473
13	NC_018709	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941473
14	NC_018709	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941473
15	NC_018709	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	407941473
16	NC_018709	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941473
17	NC_018709	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941473
18	NC_018709	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941473
19	NC_018709	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941473
20	NC_018709	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	407941473
21	NC_018709	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	407941473
22	NC_018709	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	407941473
23	NC_018709	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941473
24	NC_018709	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	407941473
25	NC_018709	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	407941473
26	NC_018709	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941473
27	NC_018709	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941473
28	NC_018709	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941473
29	NC_018709	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018709	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018709	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018709	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018709	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018709	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018709	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
36	NC_018709	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
37	NC_018709	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	407941474
38	NC_018709	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941474
39	NC_018709	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941474
40	NC_018709	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
41	NC_018709	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407941474
42	NC_018709	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941474
43	NC_018709	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941474
44	NC_018709	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407941474
45	NC_018709	T	6	6	1764	1769	0 %	100 %	0 %	0 %	407941474
46	NC_018709	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
47	NC_018709	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
48	NC_018709	ACAA	2	8	1921	1928	75 %	0 %	0 %	25 %	407941474
49	NC_018709	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941474
50	NC_018709	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941474
51	NC_018709	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
52	NC_018709	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941474
53	NC_018709	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
54	NC_018709	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	407941474
55	NC_018709	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
56	NC_018709	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	407941474
57	NC_018709	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941474
58	NC_018709	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941474
59	NC_018709	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941474
60	NC_018709	ATT	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941474
61	NC_018709	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941474
62	NC_018709	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	407941475
63	NC_018709	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941475
64	NC_018709	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941475
65	NC_018709	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	407941475
66	NC_018709	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	407941475
67	NC_018709	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407941475
68	NC_018709	AGG	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407941475
69	NC_018709	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	407941475
70	NC_018709	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	407941475
71	NC_018709	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	407941475
72	NC_018709	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	407941475
73	NC_018709	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407941475
74	NC_018709	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941475
75	NC_018709	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	407941475
76	NC_018709	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	407941475
77	NC_018709	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941475
78	NC_018709	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	407941475
79	NC_018709	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	407941475
80	NC_018709	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941475
81	NC_018709	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407941475
82	NC_018709	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	407941475
83	NC_018709	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	407941475
84	NC_018709	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941475
85	NC_018709	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941475
86	NC_018709	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407941475
87	NC_018709	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941475
88	NC_018709	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407941475
89	NC_018709	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407941475
90	NC_018709	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	407941475
91	NC_018709	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	407941475
92	NC_018709	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407941475
93	NC_018709	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407941475
94	NC_018709	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941475
95	NC_018709	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941475
96	NC_018709	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	407941475
97	NC_018709	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407941475
98	NC_018709	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	407941475
99	NC_018709	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	407941475
100	NC_018709	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	407941475
101	NC_018709	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941475
102	NC_018709	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941475
103	NC_018709	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941475
104	NC_018709	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941475
105	NC_018709	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941475
106	NC_018709	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	407941475
107	NC_018709	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941475
108	NC_018709	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941475
109	NC_018709	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941475
110	NC_018709	GAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018709	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941476
112	NC_018709	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	407941476
113	NC_018709	TTC	3	9	4954	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941476
114	NC_018709	ATA	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941476
115	NC_018709	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	407941476
116	NC_018709	CATC	2	8	5057	5064	25 %	25 %	0 %	50 %	407941476
117	NC_018709	GCT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407941476
118	NC_018709	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	407941476
119	NC_018709	AATC	2	8	5171	5178	50 %	25 %	0 %	25 %	407941476
120	NC_018709	T	7	7	5248	5254	0 %	100 %	0 %	0 %	407941476
121	NC_018709	GCAT	2	8	5287	5294	25 %	25 %	25 %	25 %	407941477
122	NC_018709	AT	3	6	5300	5305	50 %	50 %	0 %	0 %	407941477
123	NC_018709	CCT	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407941477
124	NC_018709	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941477
125	NC_018709	TTG	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407941477
126	NC_018709	TA	3	6	5491	5496	50 %	50 %	0 %	0 %	407941477
127	NC_018709	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	407941477
128	NC_018709	T	6	6	5694	5699	0 %	100 %	0 %	0 %	407941477
129	NC_018709	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941477
130	NC_018709	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407941477
131	NC_018709	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	407941477
132	NC_018709	CTC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407941477
133	NC_018709	TTC	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941477
134	NC_018709	ATA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941477
135	NC_018709	CAT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941477
136	NC_018709	T	6	6	6119	6124	0 %	100 %	0 %	0 %	407941477
137	NC_018709	TCT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941477
138	NC_018709	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	407941477
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275	NC_018709	ATG	2	6	11485	11490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941479
276	NC_018709	GAT	2	6	11572	11577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941479
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280	NC_018709	A	6	6	11798	11803	100 %	0 %	0 %	0 %	407941479
281	NC_018709	GATT	2	8	11805	11812	25 %	50 %	25 %	0 %	407941479
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303	NC_018709	TAAA	2	8	13073	13080	75 %	25 %	0 %	0 %	407941480
304	NC_018709	A	7	7	13099	13105	100 %	0 %	0 %	0 %	407941480
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331	NC_018709	T	7	7	14389	14395	0 %	100 %	0 %	0 %	407941481
332	NC_018709	GAA	2	6	14432	14437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941481
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372	NC_018709	A	6	6	15784	15789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_018709	TTA	2	6	15790	15795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_018709	ATT	2	6	17065	17070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941484
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