MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018656	ATT	2	6	147260	147265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464041
3502	NC_018656	AAT	2	6	147319	147324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464041
3503	NC_018656	CAT	2	6	147375	147380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464041
3504	NC_018656	CAA	2	6	147414	147419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464041
3505	NC_018656	CCGACA	2	12	147479	147490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407464041
3506	NC_018656	CAT	2	6	147556	147561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_018656	TTC	2	6	147599	147604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464042
3508	NC_018656	CTT	2	6	147619	147624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464042
3509	NC_018656	TCT	2	6	147666	147671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464042
3510	NC_018656	T	7	7	147703	147709	0 %	100 %	0 %	0 %	407464042
3511	NC_018656	TCT	2	6	147744	147749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464042
3512	NC_018656	TAA	2	6	147754	147759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464042
3513	NC_018656	ATTG	2	8	147768	147775	25 %	50 %	25 %	0 %	407464042
3514	NC_018656	TTTG	2	8	147812	147819	0 %	75 %	25 %	0 %	407464042
3515	NC_018656	TCA	2	6	147825	147830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464042
3516	NC_018656	TAC	2	6	147914	147919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464042
3517	NC_018656	TTG	2	6	147920	147925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464042
3518	NC_018656	TCT	2	6	148002	148007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464042
3519	NC_018656	T	6	6	148007	148012	0 %	100 %	0 %	0 %	407464042
3520	NC_018656	CTT	2	6	148096	148101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464042
3521	NC_018656	GGA	2	6	148128	148133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464042
3522	NC_018656	T	6	6	148177	148182	0 %	100 %	0 %	0 %	407464042
3523	NC_018656	CCT	2	6	148224	148229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464042
3524	NC_018656	TTG	2	6	148244	148249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464042
3525	NC_018656	CATAA	2	10	148268	148277	60 %	20 %	0 %	20 %	407464042
3526	NC_018656	T	6	6	148295	148300	0 %	100 %	0 %	0 %	407464042
3527	NC_018656	TA	3	6	148351	148356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_018656	CAA	2	6	148372	148377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_018656	A	6	6	148376	148381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_018656	AAT	2	6	148425	148430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_018656	AGT	2	6	148556	148561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464043
3532	NC_018656	GAA	2	6	148563	148568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464043
3533	NC_018656	TGA	2	6	148616	148621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464043
3534	NC_018656	ATC	2	6	148671	148676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464043
3535	NC_018656	TAAA	2	8	148678	148685	75 %	25 %	0 %	0 %	407464043
3536	NC_018656	TAGT	2	8	148693	148700	25 %	50 %	25 %	0 %	407464043
3537	NC_018656	TGC	2	6	148712	148717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464043
3538	NC_018656	TGAT	2	8	148741	148748	25 %	50 %	25 %	0 %	407464043
3539	NC_018656	AC	3	6	148770	148775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_018656	T	6	6	148786	148791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_018656	TAAT	2	8	148802	148809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_018656	GTTT	2	8	148884	148891	0 %	75 %	25 %	0 %	407464044
3543	NC_018656	A	6	6	148943	148948	100 %	0 %	0 %	0 %	407464044
3544	NC_018656	TTC	2	6	148970	148975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464044
3545	NC_018656	A	7	7	149047	149053	100 %	0 %	0 %	0 %	407464044
3546	NC_018656	GAT	2	6	149119	149124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464044
3547	NC_018656	ACC	2	6	149143	149148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464044
3548	NC_018656	ACAA	2	8	149266	149273	75 %	0 %	0 %	25 %	407464044
3549	NC_018656	TTC	2	6	149299	149304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464044
3550	NC_018656	T	8	8	149379	149386	0 %	100 %	0 %	0 %	407464045
3551	NC_018656	CAA	2	6	149495	149500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464045
3552	NC_018656	TCA	3	9	149539	149547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464045
3553	NC_018656	TCA	2	6	149585	149590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464045
3554	NC_018656	TTCCTT	2	12	149600	149611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464045
3555	NC_018656	T	6	6	149614	149619	0 %	100 %	0 %	0 %	407464045
3556	NC_018656	T	6	6	149721	149726	0 %	100 %	0 %	0 %	407464045
3557	NC_018656	ATG	2	6	149746	149751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_018656	T	6	6	149755	149760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_018656	GGGA	2	8	149794	149801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_018656	ACC	2	6	149849	149854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_018656	GTT	2	6	149878	149883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_018656	ATA	2	6	149906	149911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_018656	TCCT	2	8	149973	149980	0 %	50 %	0 %	50 %	407464046
3564	NC_018656	GAT	2	6	149986	149991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
3565	NC_018656	TGA	2	6	150010	150015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
3566	NC_018656	TTG	2	6	150024	150029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464046
3567	NC_018656	TGC	2	6	150166	150171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464046
3568	NC_018656	GGT	2	6	150179	150184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464046
3569	NC_018656	TAC	2	6	150187	150192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464046
3570	NC_018656	ATG	2	6	150194	150199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
3571	NC_018656	CAC	2	6	150306	150311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464046
3572	NC_018656	TG	3	6	150333	150338	0 %	50 %	50 %	0 %	407464046
3573	NC_018656	TGG	2	6	150379	150384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464046
3574	NC_018656	CCA	2	6	150413	150418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464046
3575	NC_018656	TTG	2	6	150432	150437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464046
3576	NC_018656	TGA	2	6	150457	150462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
3577	NC_018656	ATGTGG	2	12	150538	150549	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407464046
3578	NC_018656	TCT	2	6	150596	150601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464046
3579	NC_018656	GAA	2	6	150719	150724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464046
3580	NC_018656	A	6	6	150728	150733	100 %	0 %	0 %	0 %	407464046
3581	NC_018656	GCC	2	6	150820	150825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407464046
3582	NC_018656	GAT	2	6	150839	150844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
3583	NC_018656	TGA	2	6	150867	150872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
3584	NC_018656	AACTCA	2	12	150915	150926	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407464046
3585	NC_018656	GAT	2	6	150938	150943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
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3587	NC_018656	CAAAA	2	10	151016	151025	80 %	0 %	0 %	20 %	407464046
3588	NC_018656	GCT	2	6	151064	151069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464046
3589	NC_018656	A	6	6	151145	151150	100 %	0 %	0 %	0 %	407464046
3590	NC_018656	A	6	6	151152	151157	100 %	0 %	0 %	0 %	407464046
3591	NC_018656	GAA	2	6	151209	151214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464046
3592	NC_018656	TAG	2	6	151305	151310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464046
3593	NC_018656	T	6	6	151357	151362	0 %	100 %	0 %	0 %	407464047
3594	NC_018656	T	6	6	151419	151424	0 %	100 %	0 %	0 %	407464047
3595	NC_018656	TTG	2	6	151431	151436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464047
3596	NC_018656	TTA	2	6	151444	151449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464047
3597	NC_018656	CAA	2	6	151482	151487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464047
3598	NC_018656	CTC	3	9	151492	151500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464047
3599	NC_018656	A	6	6	151509	151514	100 %	0 %	0 %	0 %	407464047
3600	NC_018656	TGATAT	2	12	151520	151531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407464047
3601	NC_018656	TAT	2	6	151555	151560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464047
3602	NC_018656	A	6	6	151564	151569	100 %	0 %	0 %	0 %	407464047
3603	NC_018656	AATC	2	8	151641	151648	50 %	25 %	0 %	25 %	407464047
3604	NC_018656	ATG	2	6	151650	151655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3605	NC_018656	ATG	2	6	151671	151676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3606	NC_018656	TGA	2	6	151684	151689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3607	NC_018656	CAA	2	6	151699	151704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464047
3608	NC_018656	ATG	2	6	151734	151739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3609	NC_018656	ATG	3	9	151755	151763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3610	NC_018656	ATGA	2	8	151770	151777	50 %	25 %	25 %	0 %	407464047
3611	NC_018656	TCAAA	2	10	151787	151796	60 %	20 %	0 %	20 %	407464047
3612	NC_018656	A	6	6	151858	151863	100 %	0 %	0 %	0 %	407464047
3613	NC_018656	GAA	2	6	151877	151882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464047
3614	NC_018656	ATC	2	6	151900	151905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464047
3615	NC_018656	ATGG	2	8	151922	151929	25 %	25 %	50 %	0 %	407464047
3616	NC_018656	TCA	2	6	151937	151942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464047
3617	NC_018656	ATG	2	6	151947	151952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3618	NC_018656	ATCA	2	8	151978	151985	50 %	25 %	0 %	25 %	407464047
3619	NC_018656	ATGT	2	8	151988	151995	25 %	50 %	25 %	0 %	407464047
3620	NC_018656	ATG	3	9	152037	152045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3621	NC_018656	ATG	2	6	152061	152066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
3622	NC_018656	TCA	2	6	152075	152080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464047
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3624	NC_018656	ATG	2	6	152151	152156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464047
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3999	NC_018656	AAT	2	6	168526	168531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464069
4000	NC_018656	TCA	2	6	168542	168547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464069

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