MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_018656	TTGT	2	8	1236369	1236376	0 %	75 %	25 %	0 %	407465327
28503	NC_018656	T	6	6	1236376	1236381	0 %	100 %	0 %	0 %	407465327
28504	NC_018656	ATA	2	6	1236383	1236388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465327
28505	NC_018656	CCT	2	6	1236406	1236411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407465327
28506	NC_018656	ATACA	2	10	1236493	1236502	60 %	20 %	0 %	20 %	407465328
28507	NC_018656	GAT	2	6	1236531	1236536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407465328
28508	NC_018656	ATCAGG	2	12	1236568	1236579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407465328
28509	NC_018656	ATT	2	6	1236632	1236637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465328
28510	NC_018656	ATT	2	6	1236734	1236739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28511	NC_018656	T	6	6	1236782	1236787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28512	NC_018656	TCA	2	6	1236835	1236840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28513	NC_018656	GTC	2	6	1236842	1236847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28514	NC_018656	TTA	2	6	1236878	1236883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28515	NC_018656	ACC	2	6	1236898	1236903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28516	NC_018656	T	6	6	1236963	1236968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28517	NC_018656	TAA	3	9	1236992	1237000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28518	NC_018656	AAT	2	6	1237007	1237012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28519	NC_018656	TAT	2	6	1237098	1237103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465329
28520	NC_018656	ATTT	2	8	1237171	1237178	25 %	75 %	0 %	0 %	407465329
28521	NC_018656	A	6	6	1237224	1237229	100 %	0 %	0 %	0 %	407465329
28522	NC_018656	ATC	3	9	1237231	1237239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465329
28523	NC_018656	TCT	2	6	1237252	1237257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407465329
28524	NC_018656	ATT	2	6	1237348	1237353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465329
28525	NC_018656	AT	3	6	1237360	1237365	50 %	50 %	0 %	0 %	407465329
28526	NC_018656	ATTT	2	8	1237476	1237483	25 %	75 %	0 %	0 %	407465329
28527	NC_018656	ATGT	2	8	1237544	1237551	25 %	50 %	25 %	0 %	407465329
28528	NC_018656	CAAAA	2	10	1237585	1237594	80 %	0 %	0 %	20 %	407465329
28529	NC_018656	AAT	2	6	1237610	1237615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465329
28530	NC_018656	TCA	2	6	1237637	1237642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465329
28531	NC_018656	TCT	2	6	1237651	1237656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407465329
28532	NC_018656	TTTTCT	2	12	1237680	1237691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407465329
28533	NC_018656	ATA	2	6	1237703	1237708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465329
28534	NC_018656	AAT	2	6	1237718	1237723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407465329
28535	NC_018656	GTTT	2	8	1237742	1237749	0 %	75 %	25 %	0 %	407465329
28536	NC_018656	ATT	2	6	1237759	1237764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465329
28537	NC_018656	TTC	2	6	1237777	1237782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407465329
28538	NC_018656	TCTA	2	8	1237824	1237831	25 %	50 %	0 %	25 %	407465330
28539	NC_018656	TCTTTT	2	12	1237835	1237846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407465330
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28541	NC_018656	A	7	7	1237977	1237983	100 %	0 %	0 %	0 %	407465330
28542	NC_018656	T	7	7	1237994	1238000	0 %	100 %	0 %	0 %	407465330
28543	NC_018656	T	7	7	1238032	1238038	0 %	100 %	0 %	0 %	407465330
28544	NC_018656	TAT	2	6	1238120	1238125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407465330
28545	NC_018656	CAT	2	6	1238207	1238212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465330
28546	NC_018656	T	8	8	1238230	1238237	0 %	100 %	0 %	0 %	407465330
28547	NC_018656	GACTT	2	10	1238260	1238269	20 %	40 %	20 %	20 %	407465330
28548	NC_018656	T	6	6	1238268	1238273	0 %	100 %	0 %	0 %	407465330
28549	NC_018656	AT	3	6	1238281	1238286	50 %	50 %	0 %	0 %	407465330
28550	NC_018656	TAT	2	6	1238314	1238319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28551	NC_018656	AT	3	6	1238328	1238333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28552	NC_018656	TTATC	2	10	1238372	1238381	20 %	60 %	0 %	20 %	407465331
28553	NC_018656	TCCAAC	2	12	1238382	1238393	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407465331
28554	NC_018656	GAT	2	6	1238409	1238414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407465331
28555	NC_018656	TTGT	2	8	1238455	1238462	0 %	75 %	25 %	0 %	407465331
28556	NC_018656	TCTACA	2	12	1238509	1238520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465331
28557	NC_018656	GAATT	2	10	1238543	1238552	40 %	40 %	20 %	0 %	407465331
28558	NC_018656	ATC	2	6	1238565	1238570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465331
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28560	NC_018656	ATTT	2	8	1238759	1238766	25 %	75 %	0 %	0 %	407465331
28561	NC_018656	AAC	2	6	1238816	1238821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28562	NC_018656	ATTC	2	8	1238843	1238850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28563	NC_018656	ATTA	2	8	1238881	1238888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28564	NC_018656	A	6	6	1238894	1238899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28565	NC_018656	CAAA	2	8	1238921	1238928	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28566	NC_018656	GAA	2	6	1238974	1238979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407465332
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28569	NC_018656	AT	3	6	1239166	1239171	50 %	50 %	0 %	0 %	407465332
28570	NC_018656	AAC	2	6	1239215	1239220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407465332
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28592	NC_018656	TGAAT	2	10	1240345	1240354	40 %	40 %	20 %	0 %	407465333
28593	NC_018656	T	6	6	1240391	1240396	0 %	100 %	0 %	0 %	407465333
28594	NC_018656	TG	3	6	1240413	1240418	0 %	50 %	50 %	0 %	407465333
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28604	NC_018656	T	8	8	1240700	1240707	0 %	100 %	0 %	0 %	407465333
28605	NC_018656	ATCT	2	8	1240787	1240794	25 %	50 %	0 %	25 %	407465333
28606	NC_018656	CAT	2	6	1240799	1240804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407465333
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28610	NC_018656	TCTT	2	8	1240878	1240885	0 %	75 %	0 %	25 %	407465333
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28615	NC_018656	TGA	2	6	1241067	1241072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407465333
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28618	NC_018656	CA	4	8	1241177	1241184	50 %	0 %	0 %	50 %	407465333
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29000	NC_018656	AT	3	6	1256281	1256286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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