MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018656	TTG	3	9	649894	649902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464650
15002	NC_018656	ATG	2	6	650022	650027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464650
15003	NC_018656	TG	3	6	650026	650031	0 %	50 %	50 %	0 %	407464650
15004	NC_018656	CTG	2	6	650081	650086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464650
15005	NC_018656	T	6	6	650158	650163	0 %	100 %	0 %	0 %	407464650
15006	NC_018656	TGAT	2	8	650167	650174	25 %	50 %	25 %	0 %	407464650
15007	NC_018656	CTC	2	6	650183	650188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464650
15008	NC_018656	CTA	2	6	650224	650229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464650
15009	NC_018656	TCCT	2	8	650437	650444	0 %	50 %	0 %	50 %	407464651
15010	NC_018656	GAA	2	6	650506	650511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464651
15011	NC_018656	TGT	3	9	650526	650534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464651
15012	NC_018656	CTCTG	2	10	650556	650565	0 %	40 %	20 %	40 %	407464651
15013	NC_018656	T	7	7	650601	650607	0 %	100 %	0 %	0 %	407464651
15014	NC_018656	CAT	2	6	650670	650675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464651
15015	NC_018656	TA	3	6	650688	650693	50 %	50 %	0 %	0 %	407464651
15016	NC_018656	TTTG	2	8	650715	650722	0 %	75 %	25 %	0 %	407464651
15017	NC_018656	TAT	2	6	650827	650832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464651
15018	NC_018656	CTT	2	6	650869	650874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464651
15019	NC_018656	CAAT	2	8	650955	650962	50 %	25 %	0 %	25 %	407464651
15020	NC_018656	T	6	6	651008	651013	0 %	100 %	0 %	0 %	407464651
15021	NC_018656	TGA	2	6	651385	651390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464651
15022	NC_018656	AGA	2	6	651466	651471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464651
15023	NC_018656	CAT	2	6	651486	651491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464651
15024	NC_018656	ACTTT	2	10	651498	651507	20 %	60 %	0 %	20 %	407464651
15025	NC_018656	CAA	2	6	651543	651548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464651
15026	NC_018656	TGT	2	6	651609	651614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464651
15027	NC_018656	GGA	2	6	651617	651622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464651
15028	NC_018656	TCA	2	6	651746	651751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464651
15029	NC_018656	TGAA	2	8	651788	651795	50 %	25 %	25 %	0 %	407464651
15030	NC_018656	AGC	2	6	651803	651808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464651
15031	NC_018656	T	6	6	651829	651834	0 %	100 %	0 %	0 %	407464651
15032	NC_018656	CAT	2	6	651838	651843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464651
15033	NC_018656	TTA	2	6	651975	651980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_018656	AAT	2	6	651983	651988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_018656	ACTGAA	2	12	652074	652085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15036	NC_018656	T	8	8	652126	652133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_018656	TCA	2	6	652138	652143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_018656	ATA	2	6	652155	652160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_018656	TCT	2	6	652174	652179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15040	NC_018656	ATT	2	6	652209	652214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_018656	TAA	2	6	652258	652263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_018656	A	6	6	652269	652274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_018656	A	7	7	652276	652282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_018656	CTG	2	6	652288	652293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_018656	TAT	2	6	652322	652327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464652
15046	NC_018656	CTG	2	6	652377	652382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464652
15047	NC_018656	ATAGA	2	10	652403	652412	60 %	20 %	20 %	0 %	407464652
15048	NC_018656	TCC	2	6	652435	652440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464652
15049	NC_018656	TAT	2	6	652464	652469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464652
15050	NC_018656	TAT	2	6	652554	652559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464652
15051	NC_018656	CAT	2	6	652584	652589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464652
15052	NC_018656	TG	3	6	652591	652596	0 %	50 %	50 %	0 %	407464652
15053	NC_018656	CTTG	2	8	652602	652609	0 %	50 %	25 %	25 %	407464652
15054	NC_018656	CAT	2	6	652635	652640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464652
15055	NC_018656	A	6	6	652762	652767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_018656	TTTTCT	2	12	652818	652829	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407464653
15057	NC_018656	A	6	6	652836	652841	100 %	0 %	0 %	0 %	407464653
15058	NC_018656	AAG	2	6	652882	652887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464653
15059	NC_018656	TTC	2	6	652917	652922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464653
15060	NC_018656	TGTA	2	8	653073	653080	25 %	50 %	25 %	0 %	407464653
15061	NC_018656	CTG	2	6	653240	653245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464653
15062	NC_018656	A	6	6	653294	653299	100 %	0 %	0 %	0 %	407464653
15063	NC_018656	TCA	2	6	653338	653343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464653
15064	NC_018656	CAATTA	2	12	653384	653395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407464653
15065	NC_018656	AGTCT	2	10	653404	653413	20 %	40 %	20 %	20 %	407464653
15066	NC_018656	TAA	2	6	653435	653440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464654
15067	NC_018656	CCTT	3	12	653485	653496	0 %	50 %	0 %	50 %	407464654
15068	NC_018656	ATA	2	6	653572	653577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464654
15069	NC_018656	TAGAT	2	10	653606	653615	40 %	40 %	20 %	0 %	407464654
15070	NC_018656	ACT	2	6	653705	653710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464654
15071	NC_018656	GAA	2	6	653723	653728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464654
15072	NC_018656	TAA	2	6	653913	653918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464654
15073	NC_018656	TCA	2	6	653966	653971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464654
15074	NC_018656	GTAG	2	8	654046	654053	25 %	25 %	50 %	0 %	407464654
15075	NC_018656	TTG	2	6	654114	654119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464654
15076	NC_018656	TTCTA	2	10	654145	654154	20 %	60 %	0 %	20 %	407464654
15077	NC_018656	CAAA	2	8	654173	654180	75 %	0 %	0 %	25 %	407464654
15078	NC_018656	CAT	2	6	654231	654236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464654
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15080	NC_018656	GAT	2	6	654323	654328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464654
15081	NC_018656	TGGTG	2	10	654383	654392	0 %	40 %	60 %	0 %	407464654
15082	NC_018656	CTTT	2	8	654454	654461	0 %	75 %	0 %	25 %	407464654
15083	NC_018656	TCA	2	6	654464	654469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464654
15084	NC_018656	CAT	2	6	654514	654519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464654
15085	NC_018656	TTC	2	6	654531	654536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464654
15086	NC_018656	TCC	3	9	654781	654789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464654
15087	NC_018656	AATG	2	8	654820	654827	50 %	25 %	25 %	0 %	407464654
15088	NC_018656	CAA	2	6	654831	654836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464654
15089	NC_018656	ATA	2	6	654850	654855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464654
15090	NC_018656	TTTG	2	8	654905	654912	0 %	75 %	25 %	0 %	407464654
15091	NC_018656	AAAAT	2	10	654965	654974	80 %	20 %	0 %	0 %	407464654
15092	NC_018656	TCA	3	9	654980	654988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464654
15093	NC_018656	CAT	2	6	654999	655004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464654
15094	NC_018656	TTC	2	6	655099	655104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464654
15095	NC_018656	AAT	2	6	655195	655200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464654
15096	NC_018656	ATA	2	6	655211	655216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464654
15097	NC_018656	ATT	2	6	655275	655280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_018656	ATTC	2	8	655309	655316	25 %	50 %	0 %	25 %	407464655
15099	NC_018656	T	6	6	655329	655334	0 %	100 %	0 %	0 %	407464655
15100	NC_018656	TCA	2	6	655376	655381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464655
15101	NC_018656	GGA	2	6	655439	655444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464655
15102	NC_018656	TTGTC	2	10	655464	655473	0 %	60 %	20 %	20 %	407464655
15103	NC_018656	TGC	2	6	655504	655509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464655
15104	NC_018656	CAGAA	2	10	655554	655563	60 %	0 %	20 %	20 %	407464655
15105	NC_018656	A	6	6	655601	655606	100 %	0 %	0 %	0 %	407464655
15106	NC_018656	T	6	6	655649	655654	0 %	100 %	0 %	0 %	407464655
15107	NC_018656	ATA	2	6	655678	655683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464655
15108	NC_018656	CCATG	2	10	655851	655860	20 %	20 %	20 %	40 %	407464655
15109	NC_018656	CTT	2	6	655915	655920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464655
15110	NC_018656	GCA	2	6	656003	656008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464655
15111	NC_018656	ATG	2	6	656080	656085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464655
15112	NC_018656	GATG	2	8	656090	656097	25 %	25 %	50 %	0 %	407464655
15113	NC_018656	TCA	2	6	656213	656218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464655
15114	NC_018656	TCT	2	6	656364	656369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_018656	GCA	2	6	656403	656408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_018656	T	7	7	656426	656432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_018656	TAA	2	6	656437	656442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_018656	TTG	2	6	656489	656494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_018656	T	8	8	656552	656559	0 %	100 %	0 %	0 %	407464656
15120	NC_018656	TTCT	2	8	656593	656600	0 %	75 %	0 %	25 %	407464656
15121	NC_018656	ATT	2	6	656604	656609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464656
15122	NC_018656	ACT	2	6	656619	656624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464656
15123	NC_018656	TCA	2	6	656772	656777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464656
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15240	NC_018656	TG	3	6	662407	662412	0 %	50 %	50 %	0 %	407464662
15241	NC_018656	A	7	7	662413	662419	100 %	0 %	0 %	0 %	407464662
15242	NC_018656	AATG	2	8	662436	662443	50 %	25 %	25 %	0 %	407464662
15243	NC_018656	ACT	2	6	662517	662522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464662
15244	NC_018656	A	7	7	662554	662560	100 %	0 %	0 %	0 %	407464662
15245	NC_018656	AAT	2	6	662828	662833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464662
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15247	NC_018656	A	6	6	662883	662888	100 %	0 %	0 %	0 %	407464662
15248	NC_018656	GAA	2	6	662895	662900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464662
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15252	NC_018656	AGACT	2	10	663022	663031	40 %	20 %	20 %	20 %	407464663
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15257	NC_018656	ACA	2	6	663490	663495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464663
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15277	NC_018656	CA	3	6	664705	664710	50 %	0 %	0 %	50 %	407464664
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15332	NC_018656	ATGA	2	8	667868	667875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15333	NC_018656	ATTG	2	8	667904	667911	25 %	50 %	25 %	0 %	407464667
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15349	NC_018656	TAC	2	6	668687	668692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464668
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15351	NC_018656	TATC	2	8	668826	668833	25 %	50 %	0 %	25 %	407464669
15352	NC_018656	CT	3	6	668847	668852	0 %	50 %	0 %	50 %	407464669
15353	NC_018656	ATA	2	6	668860	668865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464669
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