MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018656	CAA	2	6	540806	540811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464515
12502	NC_018656	ATT	2	6	540819	540824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464515
12503	NC_018656	CAT	2	6	540848	540853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464515
12504	NC_018656	CTT	2	6	540881	540886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464515
12505	NC_018656	T	6	6	540900	540905	0 %	100 %	0 %	0 %	407464515
12506	NC_018656	T	6	6	540918	540923	0 %	100 %	0 %	0 %	407464515
12507	NC_018656	ATT	2	6	540928	540933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464515
12508	NC_018656	TG	3	6	540946	540951	0 %	50 %	50 %	0 %	407464515
12509	NC_018656	TTG	2	6	541047	541052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464515
12510	NC_018656	ACC	2	6	541064	541069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464515
12511	NC_018656	TTTCA	2	10	541095	541104	20 %	60 %	0 %	20 %	407464515
12512	NC_018656	TGG	2	6	541163	541168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464515
12513	NC_018656	ATCA	2	8	541185	541192	50 %	25 %	0 %	25 %	407464515
12514	NC_018656	TGAA	2	8	541200	541207	50 %	25 %	25 %	0 %	407464515
12515	NC_018656	CAA	2	6	541244	541249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464515
12516	NC_018656	T	6	6	541264	541269	0 %	100 %	0 %	0 %	407464515
12517	NC_018656	GCT	2	6	541366	541371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
12518	NC_018656	ATT	2	6	541401	541406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464515
12519	NC_018656	T	6	6	541425	541430	0 %	100 %	0 %	0 %	407464515
12520	NC_018656	ATC	2	6	541446	541451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464515
12521	NC_018656	GCT	2	6	541561	541566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
12522	NC_018656	TGC	2	6	541572	541577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
12523	NC_018656	CTG	2	6	541586	541591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
12524	NC_018656	TCC	2	6	541593	541598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464515
12525	NC_018656	ATCATA	2	12	541614	541625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407464515
12526	NC_018656	TTC	2	6	541626	541631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464515
12527	NC_018656	AATT	2	8	541636	541643	50 %	50 %	0 %	0 %	407464515
12528	NC_018656	CAA	2	6	541645	541650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_018656	ATT	2	6	541685	541690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464516
12530	NC_018656	T	7	7	541689	541695	0 %	100 %	0 %	0 %	407464516
12531	NC_018656	TC	3	6	541721	541726	0 %	50 %	0 %	50 %	407464516
12532	NC_018656	TTTCAT	2	12	541841	541852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407464516
12533	NC_018656	AAT	2	6	541943	541948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_018656	TAA	2	6	541976	541981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_018656	AAT	2	6	542045	542050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_018656	A	6	6	542087	542092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_018656	TCATT	2	10	542129	542138	20 %	60 %	0 %	20 %	407464517
12538	NC_018656	GTT	2	6	542146	542151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464517
12539	NC_018656	GTT	2	6	542193	542198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464517
12540	NC_018656	CATT	2	8	542209	542216	25 %	50 %	0 %	25 %	407464517
12541	NC_018656	TGT	2	6	542271	542276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464517
12542	NC_018656	TCT	2	6	542277	542282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464517
12543	NC_018656	TCT	2	6	542310	542315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464517
12544	NC_018656	ATTT	2	8	542356	542363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_018656	ATC	2	6	542380	542385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464518
12546	NC_018656	TGC	2	6	542465	542470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464518
12547	NC_018656	TCT	2	6	542481	542486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464518
12548	NC_018656	TCTT	2	8	542513	542520	0 %	75 %	0 %	25 %	407464518
12549	NC_018656	CTTG	2	8	542532	542539	0 %	50 %	25 %	25 %	407464518
12550	NC_018656	ATC	2	6	542543	542548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464518
12551	NC_018656	TGA	2	6	542575	542580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464518
12552	NC_018656	CTT	2	6	542613	542618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464518
12553	NC_018656	TGG	2	6	542665	542670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464518
12554	NC_018656	CAG	2	6	542798	542803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464518
12555	NC_018656	AATT	2	8	542813	542820	50 %	50 %	0 %	0 %	407464518
12556	NC_018656	T	6	6	542819	542824	0 %	100 %	0 %	0 %	407464518
12557	NC_018656	TCA	2	6	542949	542954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464518
12558	NC_018656	GAC	2	6	543044	543049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464518
12559	NC_018656	TCCT	2	8	543056	543063	0 %	50 %	0 %	50 %	407464518
12560	NC_018656	TAT	2	6	543150	543155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_018656	GTTT	2	8	543201	543208	0 %	75 %	25 %	0 %	407464519
12562	NC_018656	ATTT	2	8	543214	543221	25 %	75 %	0 %	0 %	407464519
12563	NC_018656	T	7	7	543219	543225	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
12564	NC_018656	CTT	2	6	543267	543272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464519
12565	NC_018656	CTT	2	6	543291	543296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464519
12566	NC_018656	TGG	2	6	543351	543356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464519
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12568	NC_018656	GTA	2	6	543389	543394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464519
12569	NC_018656	T	8	8	543424	543431	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
12570	NC_018656	T	6	6	543499	543504	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
12571	NC_018656	A	6	6	543601	543606	100 %	0 %	0 %	0 %	407464519
12572	NC_018656	TTTG	2	8	543610	543617	0 %	75 %	25 %	0 %	407464519
12573	NC_018656	AATTG	2	10	543619	543628	40 %	40 %	20 %	0 %	407464519
12574	NC_018656	CAT	2	6	543673	543678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464519
12575	NC_018656	T	6	6	543770	543775	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
12576	NC_018656	AATT	2	8	543811	543818	50 %	50 %	0 %	0 %	407464519
12577	NC_018656	ATT	2	6	543941	543946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464519
12578	NC_018656	T	6	6	543972	543977	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
12579	NC_018656	AAATCT	2	12	544007	544018	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407464519
12580	NC_018656	T	6	6	544071	544076	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
12581	NC_018656	TC	3	6	544088	544093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12582	NC_018656	TTC	2	6	544114	544119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464520
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12584	NC_018656	CTT	2	6	544216	544221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464520
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12587	NC_018656	TCC	2	6	544252	544257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464520
12588	NC_018656	TGA	2	6	544293	544298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464520
12589	NC_018656	TCTT	2	8	544302	544309	0 %	75 %	0 %	25 %	407464520
12590	NC_018656	CTT	2	6	544443	544448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464520
12591	NC_018656	ATT	2	6	544495	544500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_018656	ATA	2	6	544517	544522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_018656	ATTG	2	8	544584	544591	25 %	50 %	25 %	0 %	407464521
12594	NC_018656	A	6	6	544610	544615	100 %	0 %	0 %	0 %	407464521
12595	NC_018656	TGC	2	6	544646	544651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464521
12596	NC_018656	ATC	2	6	544669	544674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464521
12597	NC_018656	TGA	3	9	544694	544702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464521
12598	NC_018656	AAT	2	6	544703	544708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464521
12599	NC_018656	TAA	2	6	544787	544792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464521
12600	NC_018656	TAA	2	6	544798	544803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464521
12601	NC_018656	ACATC	2	10	544804	544813	40 %	20 %	0 %	40 %	407464521
12602	NC_018656	T	6	6	544947	544952	0 %	100 %	0 %	0 %	407464522
12603	NC_018656	TG	4	8	545062	545069	0 %	50 %	50 %	0 %	407464522
12604	NC_018656	CAT	2	6	545116	545121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464522
12605	NC_018656	A	6	6	545288	545293	100 %	0 %	0 %	0 %	407464523
12606	NC_018656	A	6	6	545299	545304	100 %	0 %	0 %	0 %	407464523
12607	NC_018656	TTC	2	6	545386	545391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464523
12608	NC_018656	ATTGCA	2	12	545423	545434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407464523
12609	NC_018656	T	7	7	545484	545490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_018656	TAT	2	6	545509	545514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_018656	A	6	6	545521	545526	100 %	0 %	0 %	0 %	407464524
12612	NC_018656	CTT	2	6	545591	545596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464524
12613	NC_018656	TAG	2	6	545759	545764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464524
12614	NC_018656	TTG	2	6	545801	545806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464524
12615	NC_018656	T	6	6	545814	545819	0 %	100 %	0 %	0 %	407464524
12616	NC_018656	AGC	2	6	545838	545843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464524
12617	NC_018656	CAT	2	6	545849	545854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464524
12618	NC_018656	AGA	2	6	545862	545867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464524
12619	NC_018656	ATGG	2	8	545927	545934	25 %	25 %	50 %	0 %	407464524
12620	NC_018656	GCATTT	2	12	545956	545967	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407464524
12621	NC_018656	CAA	2	6	546046	546051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464524
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12995	NC_018656	TTC	2	6	562083	562088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464541
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12997	NC_018656	TCA	2	6	562117	562122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464541
12998	NC_018656	ACT	2	6	562144	562149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464541
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