MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_018656	GAC	2	6	519711	519716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464497
12002	NC_018656	ATT	2	6	519770	519775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464497
12003	NC_018656	A	6	6	519779	519784	100 %	0 %	0 %	0 %	407464497
12004	NC_018656	ATC	2	6	519842	519847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_018656	AT	3	6	519869	519874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_018656	AAC	2	6	519881	519886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_018656	TTGGA	2	10	519891	519900	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_018656	TAC	2	6	519968	519973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464498
12009	NC_018656	TCT	2	6	520035	520040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464498
12010	NC_018656	TGT	2	6	520056	520061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464498
12011	NC_018656	ATC	2	6	520082	520087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464498
12012	NC_018656	TGT	2	6	520119	520124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464498
12013	NC_018656	TCT	2	6	520170	520175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464498
12014	NC_018656	A	6	6	520211	520216	100 %	0 %	0 %	0 %	407464498
12015	NC_018656	CTT	2	6	520234	520239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464498
12016	NC_018656	AGT	2	6	520275	520280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464498
12017	NC_018656	TCC	2	6	520317	520322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464498
12018	NC_018656	TTTG	2	8	520343	520350	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_018656	TAT	2	6	520361	520366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464499
12020	NC_018656	TCA	2	6	520508	520513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464499
12021	NC_018656	TCT	2	6	520556	520561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464499
12022	NC_018656	TTC	2	6	520576	520581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464499
12023	NC_018656	T	6	6	520585	520590	0 %	100 %	0 %	0 %	407464499
12024	NC_018656	TCT	2	6	520634	520639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464499
12025	NC_018656	TGA	2	6	520751	520756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464499
12026	NC_018656	CAT	2	6	520765	520770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464499
12027	NC_018656	TTC	2	6	520774	520779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464499
12028	NC_018656	TC	4	8	520784	520791	0 %	50 %	0 %	50 %	407464499
12029	NC_018656	T	6	6	520803	520808	0 %	100 %	0 %	0 %	407464499
12030	NC_018656	TTC	3	9	520816	520824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464499
12031	NC_018656	TTC	2	6	520849	520854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464499
12032	NC_018656	ATC	2	6	520870	520875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464499
12033	NC_018656	TGCT	2	8	520938	520945	0 %	50 %	25 %	25 %	407464499
12034	NC_018656	TCTT	2	8	521035	521042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12035	NC_018656	AAC	2	6	521135	521140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12036	NC_018656	TCAAT	2	10	521156	521165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12037	NC_018656	AATCA	2	10	521187	521196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12038	NC_018656	TCC	2	6	521238	521243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464500
12039	NC_018656	CTG	2	6	521280	521285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464500
12040	NC_018656	TGT	2	6	521290	521295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464500
12041	NC_018656	TGA	2	6	521326	521331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464500
12042	NC_018656	TGGA	2	8	521395	521402	25 %	25 %	50 %	0 %	407464500
12043	NC_018656	CTA	2	6	521412	521417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464500
12044	NC_018656	A	7	7	521426	521432	100 %	0 %	0 %	0 %	407464500
12045	NC_018656	CCATT	2	10	521439	521448	20 %	40 %	0 %	40 %	407464500
12046	NC_018656	TGT	2	6	521548	521553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464500
12047	NC_018656	CTT	2	6	521598	521603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464500
12048	NC_018656	ATG	2	6	521616	521621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464500
12049	NC_018656	CTG	2	6	521667	521672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464500
12050	NC_018656	TCT	2	6	521675	521680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464500
12051	NC_018656	CAA	2	6	521769	521774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464500
12052	NC_018656	TGT	2	6	521803	521808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464500
12053	NC_018656	CTTT	2	8	521814	521821	0 %	75 %	0 %	25 %	407464500
12054	NC_018656	TAG	2	6	521835	521840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464500
12055	NC_018656	AAC	2	6	521908	521913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464500
12056	NC_018656	TGG	2	6	521974	521979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464500
12057	NC_018656	AAT	2	6	522016	522021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464500
12058	NC_018656	AT	3	6	522076	522081	50 %	50 %	0 %	0 %	407464500
12059	NC_018656	TGA	2	6	522115	522120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464500
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12061	NC_018656	CAA	2	6	522198	522203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464500
12062	NC_018656	ACT	2	6	522233	522238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464500
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12065	NC_018656	AGA	2	6	522328	522333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464500
12066	NC_018656	ACAAA	2	10	522449	522458	80 %	0 %	0 %	20 %	407464500
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12073	NC_018656	CTG	2	6	522855	522860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464500
12074	NC_018656	GA	3	6	523071	523076	50 %	0 %	50 %	0 %	407464500
12075	NC_018656	ACA	2	6	523169	523174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464500
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12079	NC_018656	CAA	2	6	523454	523459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464500
12080	NC_018656	GTA	2	6	523475	523480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464500
12081	NC_018656	CAAA	2	8	523525	523532	75 %	0 %	0 %	25 %	407464500
12082	NC_018656	TCT	2	6	523541	523546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464500
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12088	NC_018656	CA	3	6	523915	523920	50 %	0 %	0 %	50 %	407464500
12089	NC_018656	A	6	6	523991	523996	100 %	0 %	0 %	0 %	407464500
12090	NC_018656	TGT	2	6	524011	524016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464500
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12100	NC_018656	GAT	2	6	524543	524548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464501
12101	NC_018656	A	6	6	524552	524557	100 %	0 %	0 %	0 %	407464501
12102	NC_018656	GCT	2	6	524564	524569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464501
12103	NC_018656	A	7	7	524603	524609	100 %	0 %	0 %	0 %	407464501
12104	NC_018656	A	6	6	524646	524651	100 %	0 %	0 %	0 %	407464501
12105	NC_018656	ATC	2	6	524671	524676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464501
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12107	NC_018656	ATTG	2	8	524696	524703	25 %	50 %	25 %	0 %	407464501
12108	NC_018656	A	6	6	524735	524740	100 %	0 %	0 %	0 %	407464501
12109	NC_018656	TCC	2	6	524764	524769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464501
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12112	NC_018656	CAT	2	6	524838	524843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464501
12113	NC_018656	TATT	2	8	524844	524851	25 %	75 %	0 %	0 %	407464501
12114	NC_018656	TCAA	2	8	524919	524926	50 %	25 %	0 %	25 %	407464501
12115	NC_018656	TCT	2	6	524929	524934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464501
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12117	NC_018656	TAC	2	6	525022	525027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464502
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12121	NC_018656	TGT	2	6	525129	525134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464502
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12125	NC_018656	ATT	2	6	525310	525315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464502
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12129	NC_018656	T	6	6	525405	525410	0 %	100 %	0 %	0 %	407464502
12130	NC_018656	ATT	2	6	525413	525418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464502
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12134	NC_018656	TTA	2	6	525546	525551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464502
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12231	NC_018656	T	6	6	529487	529492	0 %	100 %	0 %	0 %	407464504
12232	NC_018656	TGT	2	6	529508	529513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464504
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12235	NC_018656	TTC	2	6	529757	529762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464504
12236	NC_018656	AT	3	6	529790	529795	50 %	50 %	0 %	0 %	407464504
12237	NC_018656	ACTGAA	2	12	529803	529814	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407464504
12238	NC_018656	CTA	2	6	529816	529821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464504
12239	NC_018656	TGA	2	6	529850	529855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464504
12240	NC_018656	AAAT	2	8	529941	529948	75 %	25 %	0 %	0 %	407464505
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12490	NC_018656	ATT	2	6	540422	540427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464514
12491	NC_018656	T	7	7	540426	540432	0 %	100 %	0 %	0 %	407464515
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