MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018656	TTAT	2	8	21194	21201	25 %	75 %	0 %	0 %	407463896
502	NC_018656	CAA	2	6	21246	21251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463896
503	NC_018656	CCA	2	6	21255	21260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463896
504	NC_018656	TTTGT	2	10	21279	21288	0 %	80 %	20 %	0 %	407463896
505	NC_018656	T	6	6	21344	21349	0 %	100 %	0 %	0 %	407463896
506	NC_018656	T	7	7	21352	21358	0 %	100 %	0 %	0 %	407463896
507	NC_018656	A	6	6	21368	21373	100 %	0 %	0 %	0 %	407463896
508	NC_018656	TCT	2	6	21401	21406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463896
509	NC_018656	TGG	2	6	21439	21444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463896
510	NC_018656	TTC	2	6	21520	21525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463896
511	NC_018656	TTCTCT	2	12	21532	21543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463896
512	NC_018656	TAA	2	6	21562	21567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463896
513	NC_018656	CT	3	6	21570	21575	0 %	50 %	0 %	50 %	407463896
514	NC_018656	TGG	2	6	21612	21617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463897
515	NC_018656	CTA	2	6	21632	21637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463897
516	NC_018656	GCA	2	6	21664	21669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463897
517	NC_018656	TCT	2	6	21745	21750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463897
518	NC_018656	TCT	2	6	21781	21786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463897
519	NC_018656	T	7	7	21819	21825	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
520	NC_018656	GTA	2	6	21910	21915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463897
521	NC_018656	AATCC	2	10	21925	21934	40 %	20 %	0 %	40 %	407463897
522	NC_018656	GGA	2	6	21949	21954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463897
523	NC_018656	T	7	7	21969	21975	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
524	NC_018656	TCA	2	6	21982	21987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463897
525	NC_018656	GAT	2	6	21990	21995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463897
526	NC_018656	ATT	2	6	22006	22011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463897
527	NC_018656	T	7	7	22032	22038	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
528	NC_018656	ATC	2	6	22041	22046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463897
529	NC_018656	T	6	6	22069	22074	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
530	NC_018656	T	6	6	22080	22085	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
531	NC_018656	T	8	8	22093	22100	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
532	NC_018656	TTC	2	6	22128	22133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463897
533	NC_018656	TG	3	6	22142	22147	0 %	50 %	50 %	0 %	407463897
534	NC_018656	ATC	3	9	22170	22178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463897
535	NC_018656	CTG	2	6	22235	22240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463897
536	NC_018656	AGT	2	6	22242	22247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463897
537	NC_018656	T	6	6	22268	22273	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
538	NC_018656	TTC	2	6	22281	22286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463897
539	NC_018656	CTC	2	6	22301	22306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463897
540	NC_018656	TCA	2	6	22348	22353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463897
541	NC_018656	T	7	7	22376	22382	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
542	NC_018656	TAA	2	6	22409	22414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463897
543	NC_018656	CAA	2	6	22466	22471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463897
544	NC_018656	TGT	2	6	22479	22484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463897
545	NC_018656	TTC	2	6	22572	22577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463897
546	NC_018656	T	6	6	22619	22624	0 %	100 %	0 %	0 %	407463897
547	NC_018656	TAA	2	6	22648	22653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018656	ATA	2	6	22704	22709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463898
549	NC_018656	TTC	2	6	22729	22734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463898
550	NC_018656	A	6	6	22780	22785	100 %	0 %	0 %	0 %	407463898
551	NC_018656	CT	3	6	22799	22804	0 %	50 %	0 %	50 %	407463898
552	NC_018656	ATT	2	6	22808	22813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463898
553	NC_018656	T	6	6	22840	22845	0 %	100 %	0 %	0 %	407463898
554	NC_018656	GTTT	2	8	22934	22941	0 %	75 %	25 %	0 %	407463898
555	NC_018656	CTG	2	6	22947	22952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463898
556	NC_018656	ACA	2	6	22982	22987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463898
557	NC_018656	T	6	6	23003	23008	0 %	100 %	0 %	0 %	407463898
558	NC_018656	AACAA	2	10	23053	23062	80 %	0 %	0 %	20 %	407463898
559	NC_018656	CTT	2	6	23102	23107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463898
560	NC_018656	TGT	2	6	23113	23118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463898
561	NC_018656	ACA	2	6	23123	23128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463898
562	NC_018656	CTG	2	6	23139	23144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463898
563	NC_018656	TGC	2	6	23176	23181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463898
564	NC_018656	ATG	2	6	23184	23189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463898
565	NC_018656	ACT	2	6	23306	23311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463898
566	NC_018656	CT	3	6	23347	23352	0 %	50 %	0 %	50 %	407463898
567	NC_018656	AAT	2	6	23362	23367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463898
568	NC_018656	T	7	7	23370	23376	0 %	100 %	0 %	0 %	407463898
569	NC_018656	CCA	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463898
570	NC_018656	ATTT	2	8	23470	23477	25 %	75 %	0 %	0 %	407463898
571	NC_018656	T	6	6	23475	23480	0 %	100 %	0 %	0 %	407463898
572	NC_018656	AAT	2	6	23500	23505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463898
573	NC_018656	ATC	2	6	23530	23535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463898
574	NC_018656	TAA	2	6	23547	23552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463898
575	NC_018656	T	7	7	23614	23620	0 %	100 %	0 %	0 %	407463898
576	NC_018656	TAA	2	6	23623	23628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463898
577	NC_018656	T	7	7	23646	23652	0 %	100 %	0 %	0 %	407463898
578	NC_018656	ATTA	2	8	23656	23663	50 %	50 %	0 %	0 %	407463898
579	NC_018656	ATA	2	6	23667	23672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463898
580	NC_018656	TGC	2	6	23674	23679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463898
581	NC_018656	TGC	2	6	23686	23691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463898
582	NC_018656	GTA	2	6	23708	23713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463898
583	NC_018656	TCT	2	6	23738	23743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463898
584	NC_018656	ATT	2	6	23800	23805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018656	TTAAAA	2	12	23815	23826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018656	TAT	2	6	23839	23844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463899
587	NC_018656	TTG	2	6	23862	23867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463899
588	NC_018656	A	6	6	23893	23898	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
589	NC_018656	A	7	7	23919	23925	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
590	NC_018656	AATATC	2	12	23935	23946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407463899
591	NC_018656	AAT	2	6	23951	23956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463899
592	NC_018656	ATT	2	6	23984	23989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463899
593	NC_018656	A	6	6	23992	23997	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
594	NC_018656	ATG	2	6	24000	24005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463899
595	NC_018656	A	7	7	24006	24012	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
596	NC_018656	A	8	8	24019	24026	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
597	NC_018656	AAT	2	6	24043	24048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463899
598	NC_018656	TAG	2	6	24054	24059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463899
599	NC_018656	ATG	2	6	24090	24095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463899
600	NC_018656	A	6	6	24137	24142	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
601	NC_018656	A	7	7	24152	24158	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
602	NC_018656	TTAT	2	8	24159	24166	25 %	75 %	0 %	0 %	407463899
603	NC_018656	TATTT	2	10	24206	24215	20 %	80 %	0 %	0 %	407463899
604	NC_018656	TAAT	2	8	24240	24247	50 %	50 %	0 %	0 %	407463899
605	NC_018656	ATT	2	6	24284	24289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463899
606	NC_018656	GAT	2	6	24296	24301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463899
607	NC_018656	A	7	7	24319	24325	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
608	NC_018656	ATTCA	2	10	24369	24378	40 %	40 %	0 %	20 %	407463899
609	NC_018656	TGT	2	6	24397	24402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463899
610	NC_018656	TAA	3	9	24439	24447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463899
611	NC_018656	TTG	2	6	24450	24455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463899
612	NC_018656	AATC	2	8	24535	24542	50 %	25 %	0 %	25 %	407463899
613	NC_018656	ATG	2	6	24558	24563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463899
614	NC_018656	AAT	2	6	24565	24570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463899
615	NC_018656	TGA	2	6	24595	24600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463899
616	NC_018656	A	6	6	24638	24643	100 %	0 %	0 %	0 %	407463899
617	NC_018656	AAATT	2	10	24660	24669	60 %	40 %	0 %	0 %	407463899
618	NC_018656	TAC	2	6	24687	24692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463899
619	NC_018656	T	6	6	24730	24735	0 %	100 %	0 %	0 %	407463900
620	NC_018656	TTC	2	6	24757	24762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463900
621	NC_018656	T	7	7	24784	24790	0 %	100 %	0 %	0 %	407463900
622	NC_018656	AAT	2	6	24821	24826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463900
623	NC_018656	TTCT	2	8	24849	24856	0 %	75 %	0 %	25 %	407463900
624	NC_018656	TTC	2	6	24863	24868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463900
625	NC_018656	CTG	2	6	24979	24984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463900
626	NC_018656	T	6	6	24993	24998	0 %	100 %	0 %	0 %	407463900
627	NC_018656	AT	3	6	25002	25007	50 %	50 %	0 %	0 %	407463900
628	NC_018656	ATCT	2	8	25027	25034	25 %	50 %	0 %	25 %	407463900
629	NC_018656	TGGA	2	8	25039	25046	25 %	25 %	50 %	0 %	407463900
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631	NC_018656	CCA	2	6	25086	25091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463900
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