MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018656	TGA	2	6	212299	212304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464123
5002	NC_018656	TAA	2	6	212338	212343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464123
5003	NC_018656	A	7	7	212375	212381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_018656	TGT	2	6	212415	212420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018656	AAT	2	6	212505	212510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464124
5006	NC_018656	GGT	2	6	212523	212528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5007	NC_018656	TCT	2	6	212591	212596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464124
5008	NC_018656	TGA	2	6	212600	212605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464124
5009	NC_018656	CA	3	6	212636	212641	50 %	0 %	0 %	50 %	407464124
5010	NC_018656	ATATG	2	10	212654	212663	40 %	40 %	20 %	0 %	407464124
5011	NC_018656	TGG	2	6	212696	212701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5012	NC_018656	TGG	2	6	212759	212764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5013	NC_018656	A	7	7	212787	212793	100 %	0 %	0 %	0 %	407464124
5014	NC_018656	AAT	2	6	212834	212839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464124
5015	NC_018656	TGG	2	6	212855	212860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5016	NC_018656	AAG	2	6	212872	212877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464124
5017	NC_018656	GGT	2	6	212976	212981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5018	NC_018656	TGTT	2	8	213040	213047	0 %	75 %	25 %	0 %	407464124
5019	NC_018656	GAA	2	6	213081	213086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464124
5020	NC_018656	TGA	2	6	213095	213100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464124
5021	NC_018656	TGG	2	6	213104	213109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5022	NC_018656	GTG	2	6	213133	213138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5023	NC_018656	TTG	2	6	213148	213153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464124
5024	NC_018656	A	6	6	213186	213191	100 %	0 %	0 %	0 %	407464124
5025	NC_018656	ATA	2	6	213214	213219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464124
5026	NC_018656	CAC	2	6	213226	213231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464124
5027	NC_018656	TGA	3	9	213245	213253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464124
5028	NC_018656	ATT	2	6	213285	213290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464124
5029	NC_018656	GAAA	2	8	213320	213327	75 %	0 %	25 %	0 %	407464124
5030	NC_018656	TTG	2	6	213340	213345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464124
5031	NC_018656	ATT	2	6	213390	213395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464124
5032	NC_018656	GAAT	2	8	213409	213416	50 %	25 %	25 %	0 %	407464124
5033	NC_018656	GTT	2	6	213423	213428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464124
5034	NC_018656	TTG	2	6	213433	213438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464124
5035	NC_018656	TCA	2	6	213480	213485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464124
5036	NC_018656	AAT	2	6	213533	213538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464124
5037	NC_018656	TAG	2	6	213544	213549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464124
5038	NC_018656	TGG	2	6	213677	213682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464124
5039	NC_018656	ATTA	2	8	213723	213730	50 %	50 %	0 %	0 %	407464124
5040	NC_018656	GCT	2	6	213771	213776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464124
5041	NC_018656	TGA	2	6	213812	213817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464124
5042	NC_018656	GCA	2	6	213882	213887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464124
5043	NC_018656	CTG	2	6	213919	213924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464124
5044	NC_018656	TTAA	2	8	213939	213946	50 %	50 %	0 %	0 %	407464124
5045	NC_018656	ATG	2	6	214020	214025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464125
5046	NC_018656	TTA	2	6	214072	214077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464125
5047	NC_018656	TGA	2	6	214121	214126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464125
5048	NC_018656	CATAT	2	10	214165	214174	40 %	40 %	0 %	20 %	407464125
5049	NC_018656	GCT	2	6	214182	214187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464125
5050	NC_018656	CTTT	2	8	214271	214278	0 %	75 %	0 %	25 %	407464125
5051	NC_018656	ATG	2	6	214285	214290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464125
5052	NC_018656	A	7	7	214309	214315	100 %	0 %	0 %	0 %	407464125
5053	NC_018656	AAATG	2	10	214369	214378	60 %	20 %	20 %	0 %	407464125
5054	NC_018656	TGA	2	6	214445	214450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464125
5055	NC_018656	A	6	6	214456	214461	100 %	0 %	0 %	0 %	407464125
5056	NC_018656	TGG	2	6	214505	214510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464125
5057	NC_018656	AAT	2	6	214536	214541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464125
5058	NC_018656	GCA	2	6	214590	214595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464125
5059	NC_018656	A	6	6	214633	214638	100 %	0 %	0 %	0 %	407464125
5060	NC_018656	AACA	2	8	214741	214748	75 %	0 %	0 %	25 %	407464125
5061	NC_018656	GAA	2	6	214767	214772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464125
5062	NC_018656	CAAA	2	8	214991	214998	75 %	0 %	0 %	25 %	407464125
5063	NC_018656	GCTAT	2	10	215017	215026	20 %	40 %	20 %	20 %	407464125
5064	NC_018656	AGA	2	6	215045	215050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464125
5065	NC_018656	TGT	2	6	215093	215098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464125
5066	NC_018656	CAG	2	6	215104	215109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464125
5067	NC_018656	CT	3	6	215171	215176	0 %	50 %	0 %	50 %	407464125
5068	NC_018656	GAA	2	6	215211	215216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464125
5069	NC_018656	TGCT	2	8	215230	215237	0 %	50 %	25 %	25 %	407464125
5070	NC_018656	GAA	2	6	215307	215312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464125
5071	NC_018656	TGAT	2	8	215359	215366	25 %	50 %	25 %	0 %	407464125
5072	NC_018656	A	6	6	215385	215390	100 %	0 %	0 %	0 %	407464125
5073	NC_018656	AGA	2	6	215396	215401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464125
5074	NC_018656	ATT	2	6	215430	215435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464125
5075	NC_018656	TAA	2	6	215477	215482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464125
5076	NC_018656	TGA	2	6	215508	215513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464125
5077	NC_018656	TTA	2	6	215593	215598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464126
5078	NC_018656	GAATT	2	10	215650	215659	40 %	40 %	20 %	0 %	407464126
5079	NC_018656	AAATG	2	10	215708	215717	60 %	20 %	20 %	0 %	407464126
5080	NC_018656	AC	3	6	215756	215761	50 %	0 %	0 %	50 %	407464126
5081	NC_018656	TGA	2	6	215768	215773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464126
5082	NC_018656	GTG	2	6	215800	215805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464126
5083	NC_018656	AAAG	2	8	215885	215892	75 %	0 %	25 %	0 %	407464126
5084	NC_018656	AATCAA	2	12	215969	215980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407464126
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5086	NC_018656	TTC	2	6	216055	216060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464127
5087	NC_018656	TCT	2	6	216083	216088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464127
5088	NC_018656	TGC	2	6	216145	216150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464127
5089	NC_018656	CAT	2	6	216189	216194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464127
5090	NC_018656	ATA	2	6	216225	216230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464127
5091	NC_018656	TTTG	2	8	216265	216272	0 %	75 %	25 %	0 %	407464127
5092	NC_018656	CAT	2	6	216282	216287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464127
5093	NC_018656	TTTC	2	8	216324	216331	0 %	75 %	0 %	25 %	407464127
5094	NC_018656	GACAA	2	10	216395	216404	60 %	0 %	20 %	20 %	407464127
5095	NC_018656	T	6	6	216405	216410	0 %	100 %	0 %	0 %	407464127
5096	NC_018656	ATT	2	6	216539	216544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_018656	T	7	7	216543	216549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_018656	TAG	2	6	216669	216674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464128
5099	NC_018656	AAG	2	6	216721	216726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464128
5100	NC_018656	GAAG	2	8	216776	216783	50 %	0 %	50 %	0 %	407464128
5101	NC_018656	ATG	2	6	216794	216799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464128
5102	NC_018656	TAT	2	6	216803	216808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464128
5103	NC_018656	TGATG	2	10	216835	216844	20 %	40 %	40 %	0 %	407464128
5104	NC_018656	ATG	2	6	216908	216913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464128
5105	NC_018656	ATCA	2	8	216957	216964	50 %	25 %	0 %	25 %	407464128
5106	NC_018656	GAA	3	9	216969	216977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464128
5107	NC_018656	T	6	6	216986	216991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_018656	TTG	2	6	217175	217180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464129
5109	NC_018656	GCA	2	6	217197	217202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464129
5110	NC_018656	ATG	2	6	217216	217221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464129
5111	NC_018656	TTG	3	9	217273	217281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464129
5112	NC_018656	CAC	2	6	217309	217314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464129
5113	NC_018656	ATGT	2	8	217496	217503	25 %	50 %	25 %	0 %	407464129
5114	NC_018656	A	6	6	217513	217518	100 %	0 %	0 %	0 %	407464129
5115	NC_018656	ACTGAA	2	12	217556	217567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407464130
5116	NC_018656	TCC	2	6	217570	217575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464130
5117	NC_018656	A	6	6	217625	217630	100 %	0 %	0 %	0 %	407464130
5118	NC_018656	TTG	2	6	217686	217691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464130
5119	NC_018656	A	7	7	217726	217732	100 %	0 %	0 %	0 %	407464130
5120	NC_018656	ACG	2	6	217770	217775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464130
5121	NC_018656	GTT	2	6	217862	217867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464130
5122	NC_018656	TCA	2	6	217892	217897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464130
5123	NC_018656	AAAC	2	8	217941	217948	75 %	0 %	0 %	25 %	407464130
5124	NC_018656	ATG	2	6	217962	217967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464130
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5243	NC_018656	ATT	2	6	223512	223517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
5244	NC_018656	GTTGCA	2	12	223557	223568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407464137
5245	NC_018656	GCA	2	6	223593	223598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464137
5246	NC_018656	CAT	2	6	223635	223640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
5247	NC_018656	ATT	2	6	223701	223706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
5248	NC_018656	GAT	2	6	223802	223807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464137
5249	NC_018656	AATT	2	8	223828	223835	50 %	50 %	0 %	0 %	407464137
5250	NC_018656	TAT	2	6	223837	223842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
5251	NC_018656	ACTT	2	8	223849	223856	25 %	50 %	0 %	25 %	407464137
5252	NC_018656	TCT	2	6	223861	223866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464137
5253	NC_018656	CAT	2	6	223891	223896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
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5259	NC_018656	GCT	2	6	224133	224138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464137
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5262	NC_018656	TGG	2	6	224299	224304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464137
5263	NC_018656	TGC	2	6	224336	224341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464137
5264	NC_018656	TTG	2	6	224371	224376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464137
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5270	NC_018656	G	6	6	224642	224647	0 %	0 %	100 %	0 %	407464137
5271	NC_018656	GAA	2	6	224663	224668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464137
5272	NC_018656	GCT	2	6	224757	224762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464137
5273	NC_018656	AATG	2	8	224778	224785	50 %	25 %	25 %	0 %	407464137
5274	NC_018656	ATT	2	6	224802	224807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
5275	NC_018656	CTG	2	6	224818	224823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464137
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5280	NC_018656	CAT	2	6	224913	224918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
5281	NC_018656	CAT	2	6	224929	224934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
5282	NC_018656	ATTGGT	2	12	224976	224987	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407464137
5283	NC_018656	AGA	2	6	225005	225010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464137
5284	NC_018656	CAT	2	6	225018	225023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
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5287	NC_018656	TAG	2	6	225142	225147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464137
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5290	NC_018656	ATGA	2	8	225369	225376	50 %	25 %	25 %	0 %	407464137
5291	NC_018656	TGGA	2	8	225395	225402	25 %	25 %	50 %	0 %	407464137
5292	NC_018656	GTT	2	6	225411	225416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464137
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5299	NC_018656	TGC	2	6	225644	225649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464138
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5301	NC_018656	TCA	2	6	225705	225710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464138
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5303	NC_018656	GAT	2	6	225738	225743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464138
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5305	NC_018656	TGCAAT	2	12	225761	225772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407464138
5306	NC_018656	TTG	2	6	225778	225783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464138
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5309	NC_018656	TTG	2	6	225916	225921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464138
5310	NC_018656	ACAT	2	8	225945	225952	50 %	25 %	0 %	25 %	407464138
5311	NC_018656	GCT	2	6	225993	225998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464138
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5313	NC_018656	AATTTC	2	12	226049	226060	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407464138
5314	NC_018656	TCA	2	6	226202	226207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464138
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5320	NC_018656	TGA	2	6	226366	226371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464138
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5322	NC_018656	TGA	2	6	226537	226542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464138
5323	NC_018656	TGC	2	6	226547	226552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464138
5324	NC_018656	GAA	3	9	226621	226629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464138
5325	NC_018656	TGG	2	6	226752	226757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464138
5326	NC_018656	AAGA	2	8	226826	226833	75 %	0 %	25 %	0 %	407464138
5327	NC_018656	AG	3	6	226858	226863	50 %	0 %	50 %	0 %	407464138
5328	NC_018656	CAA	2	6	226903	226908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464138
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5330	NC_018656	AATTA	2	10	227014	227023	60 %	40 %	0 %	0 %	407464139
5331	NC_018656	CAT	2	6	227040	227045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464139
5332	NC_018656	TTC	2	6	227101	227106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464139
5333	NC_018656	T	7	7	227139	227145	0 %	100 %	0 %	0 %	407464139
5334	NC_018656	TTC	2	6	227174	227179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464139
5335	NC_018656	ATC	2	6	227191	227196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464139
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5338	NC_018656	TGC	2	6	227290	227295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464139
5339	NC_018656	CTG	2	6	227310	227315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464139
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5341	NC_018656	ATC	2	6	227384	227389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464139
5342	NC_018656	TGA	2	6	227455	227460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464139
5343	NC_018656	AATC	2	8	227470	227477	50 %	25 %	0 %	25 %	407464139
5344	NC_018656	TCT	2	6	227545	227550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464139
5345	NC_018656	ATC	2	6	227572	227577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464139
5346	NC_018656	TGAT	2	8	227583	227590	25 %	50 %	25 %	0 %	407464139
5347	NC_018656	ATG	2	6	227616	227621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464139
5348	NC_018656	TCA	2	6	227636	227641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464139
5349	NC_018656	ATA	2	6	227675	227680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464139
5350	NC_018656	CCT	2	6	227696	227701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464139
5351	NC_018656	AT	3	6	227786	227791	50 %	50 %	0 %	0 %	407464139
5352	NC_018656	A	6	6	227855	227860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_018656	TAAA	2	8	227873	227880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_018656	ATC	2	6	227981	227986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5355	NC_018656	T	7	7	228013	228019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_018656	ATA	2	6	228049	228054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464140
5357	NC_018656	TGA	2	6	228063	228068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464140
5358	NC_018656	GAA	2	6	228076	228081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464140
5359	NC_018656	AAT	2	6	228207	228212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464140
5360	NC_018656	AGT	2	6	228231	228236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464140
5361	NC_018656	AATT	2	8	228326	228333	50 %	50 %	0 %	0 %	407464140
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5363	NC_018656	TGG	2	6	228402	228407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464140
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5485	NC_018656	GAT	2	6	233470	233475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5488	NC_018656	TGA	2	6	233630	233635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5492	NC_018656	TCA	2	6	233707	233712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464151
5493	NC_018656	CCCAAT	2	12	233779	233790	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407464151
5494	NC_018656	CTCC	2	8	233804	233811	0 %	25 %	0 %	75 %	407464151
5495	NC_018656	CTT	2	6	233855	233860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464151
5496	NC_018656	GTG	2	6	233896	233901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464151
5497	NC_018656	CAT	2	6	233906	233911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464151
5498	NC_018656	GAC	2	6	233919	233924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464151
5499	NC_018656	ATT	2	6	233931	233936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464151
5500	NC_018656	CCT	2	6	234046	234051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464151

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