MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 24827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018627	ATG	2	6	143218	143223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_018627	TG	3	6	143301	143306	0 %	50 %	50 %	0 %	406594403
3003	NC_018627	TCCT	2	8	143309	143316	0 %	50 %	0 %	50 %	406594403
3004	NC_018627	GTT	2	6	143330	143335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594403
3005	NC_018627	AGAAA	2	10	143340	143349	80 %	0 %	20 %	0 %	406594403
3006	NC_018627	ATT	2	6	143352	143357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594403
3007	NC_018627	TAC	2	6	143370	143375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594403
3008	NC_018627	TGA	2	6	143514	143519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594403
3009	NC_018627	TAC	2	6	143549	143554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594403
3010	NC_018627	CAG	2	6	143558	143563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594403
3011	NC_018627	TTG	3	9	143618	143626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594403
3012	NC_018627	TA	3	6	143681	143686	50 %	50 %	0 %	0 %	406594403
3013	NC_018627	ATG	2	6	143789	143794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594403
3014	NC_018627	TAT	2	6	143808	143813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594403
3015	NC_018627	ATT	2	6	143860	143865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594403
3016	NC_018627	TAG	2	6	143897	143902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594403
3017	NC_018627	TTC	2	6	143903	143908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594403
3018	NC_018627	GTG	2	6	143909	143914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594403
3019	NC_018627	AGA	2	6	143915	143920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594403
3020	NC_018627	TTA	2	6	144025	144030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594000
3021	NC_018627	AAT	2	6	144062	144067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594000
3022	NC_018627	GAG	2	6	144091	144096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594000
3023	NC_018627	TCTA	2	8	144134	144141	25 %	50 %	0 %	25 %	406594000
3024	NC_018627	T	6	6	144227	144232	0 %	100 %	0 %	0 %	406594000
3025	NC_018627	TTG	2	6	144262	144267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594000
3026	NC_018627	ATA	2	6	144427	144432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594000
3027	NC_018627	CAG	2	6	144435	144440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594000
3028	NC_018627	TAG	2	6	144445	144450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594000
3029	NC_018627	ATCA	2	8	144485	144492	50 %	25 %	0 %	25 %	406594000
3030	NC_018627	CAA	2	6	144625	144630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594000
3031	NC_018627	TGT	2	6	144657	144662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594000
3032	NC_018627	AT	3	6	144761	144766	50 %	50 %	0 %	0 %	406594000
3033	NC_018627	T	6	6	144818	144823	0 %	100 %	0 %	0 %	406594000
3034	NC_018627	AAT	2	6	144837	144842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594000
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3036	NC_018627	GGAA	3	12	144857	144868	50 %	0 %	50 %	0 %	406594000
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3039	NC_018627	A	7	7	144906	144912	100 %	0 %	0 %	0 %	406594000
3040	NC_018627	TAT	2	6	144983	144988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_018627	TAA	2	6	144990	144995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_018627	AAT	2	6	145076	145081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594802
3043	NC_018627	A	7	7	145109	145115	100 %	0 %	0 %	0 %	406594802
3044	NC_018627	TAT	2	6	145173	145178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594802
3045	NC_018627	T	7	7	145210	145216	0 %	100 %	0 %	0 %	406594802
3046	NC_018627	T	7	7	145261	145267	0 %	100 %	0 %	0 %	406594802
3047	NC_018627	TGTC	2	8	145279	145286	0 %	50 %	25 %	25 %	406594802
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3050	NC_018627	TTTA	2	8	145369	145376	25 %	75 %	0 %	0 %	406594802
3051	NC_018627	TTG	2	6	145392	145397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594802
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3055	NC_018627	ACT	2	6	145542	145547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594802
3056	NC_018627	TTA	2	6	145565	145570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594802
3057	NC_018627	CT	4	8	145659	145666	0 %	50 %	0 %	50 %	406594802
3058	NC_018627	TCC	2	6	145720	145725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594802
3059	NC_018627	T	6	6	145757	145762	0 %	100 %	0 %	0 %	406594802
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3062	NC_018627	TA	3	6	145990	145995	50 %	50 %	0 %	0 %	406594802
3063	NC_018627	AAAGA	2	10	146005	146014	80 %	0 %	20 %	0 %	406594802
3064	NC_018627	AAG	2	6	146021	146026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594802
3065	NC_018627	ATA	2	6	146061	146066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594802
3066	NC_018627	TTAT	2	8	146087	146094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_018627	TTAT	2	8	146122	146129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_018627	GTAA	2	8	146143	146150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3071	NC_018627	CTTT	2	8	146380	146387	0 %	75 %	0 %	25 %	406594658
3072	NC_018627	CTT	2	6	146407	146412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594658
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3081	NC_018627	AAG	2	6	146799	146804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_018627	T	6	6	146809	146814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_018627	TCA	2	6	146859	146864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594811
3084	NC_018627	ATAGGC	2	12	146925	146936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406594811
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3086	NC_018627	CTG	2	6	147062	147067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_018627	T	6	6	147085	147090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_018627	TCT	2	6	147108	147113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_018627	CA	3	6	147141	147146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_018627	CTC	2	6	147151	147156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_018627	GAG	2	6	147186	147191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_018627	T	6	6	147195	147200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_018627	AT	3	6	147206	147211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_018627	A	6	6	147231	147236	100 %	0 %	0 %	0 %	406594133
3095	NC_018627	TTG	2	6	147252	147257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594133
3096	NC_018627	TGA	2	6	147293	147298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594133
3097	NC_018627	TAC	2	6	147375	147380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594133
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3099	NC_018627	AATA	2	8	147472	147479	75 %	25 %	0 %	0 %	406594090
3100	NC_018627	AGT	2	6	147489	147494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018627	ATTT	3	12	147530	147541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_018627	T	6	6	147586	147591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_018627	ATT	2	6	147600	147605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_018627	T	6	6	147610	147615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_018627	T	7	7	147694	147700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018627	ACA	2	6	147710	147715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_018627	A	6	6	147731	147736	100 %	0 %	0 %	0 %	406594516
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3110	NC_018627	TGA	2	6	147793	147798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594516
3111	NC_018627	AAGTAA	2	12	147807	147818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406594516
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3113	NC_018627	CAT	3	9	147875	147883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594516
3114	NC_018627	TGA	2	6	147902	147907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_018627	G	6	6	147912	147917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018627	C	6	6	147918	147923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3117	NC_018627	CAT	2	6	147940	147945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_018627	TTCCGT	2	12	148020	148031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_018627	T	6	6	148073	148078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018627	TTTTA	2	10	148184	148193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_018627	T	6	6	148196	148201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_018627	ATT	2	6	148257	148262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_018627	TAA	2	6	148267	148272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018627	AGA	2	6	148273	148278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_018627	T	6	6	148345	148350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_018627	GAA	2	6	148407	148412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_018627	AAAG	2	8	148627	148634	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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