MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 24827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_018627	TGT	2	6	613284	613289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594173
13003	NC_018627	ATC	2	6	613376	613381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594173
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13005	NC_018627	TGG	2	6	613482	613487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406594173
13006	NC_018627	AG	3	6	613520	613525	50 %	0 %	50 %	0 %	406594173
13007	NC_018627	ACG	2	6	613573	613578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594173
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13009	NC_018627	AT	3	6	613748	613753	50 %	50 %	0 %	0 %	406594173
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13013	NC_018627	TGAA	2	8	614096	614103	50 %	25 %	25 %	0 %	406594173
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13015	NC_018627	TAGA	2	8	614176	614183	50 %	25 %	25 %	0 %	406594173
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13018	NC_018627	ATCG	2	8	614270	614277	25 %	25 %	25 %	25 %	406594173
13019	NC_018627	TCT	2	6	614355	614360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594173
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13021	NC_018627	AACT	2	8	614444	614451	50 %	25 %	0 %	25 %	406594173
13022	NC_018627	GGA	2	6	614453	614458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594173
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13030	NC_018627	CTAT	2	8	614955	614962	25 %	50 %	0 %	25 %	406594173
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13106	NC_018627	CT	3	6	618340	618345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13107	NC_018627	T	7	7	618349	618355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_018627	AT	3	6	618384	618389	50 %	50 %	0 %	0 %	406594044
13109	NC_018627	ATC	2	6	618402	618407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594044
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13124	NC_018627	TGA	2	6	619120	619125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594044
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13132	NC_018627	TGA	2	6	619395	619400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594044
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13237	NC_018627	AC	3	6	624698	624703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13242	NC_018627	ATC	2	6	624854	624859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594699
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13366	NC_018627	TTAA	2	8	630023	630030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_018627	TAAT	2	8	630038	630045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13368	NC_018627	GAGC	2	8	630090	630097	25 %	0 %	50 %	25 %	406594299
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13370	NC_018627	GTC	2	6	630165	630170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594299
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13476	NC_018627	TACC	2	8	635158	635165	25 %	25 %	0 %	50 %	406594418
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13490	NC_018627	TGTT	2	8	635837	635844	0 %	75 %	25 %	0 %	406594418
13491	NC_018627	CA	3	6	635907	635912	50 %	0 %	0 %	50 %	406594418
13492	NC_018627	GTA	2	6	635979	635984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594418
13493	NC_018627	GAT	2	6	636118	636123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594418
13494	NC_018627	GATC	2	8	636150	636157	25 %	25 %	25 %	25 %	406594418
13495	NC_018627	GGA	2	6	636171	636176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594418
13496	NC_018627	CGTGA	2	10	636310	636319	20 %	20 %	40 %	20 %	406594418
13497	NC_018627	GCT	2	6	636351	636356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594418
13498	NC_018627	CTG	2	6	636382	636387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594418
13499	NC_018627	GCG	2	6	636405	636410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406594418
13500	NC_018627	AGA	2	6	636413	636418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594418

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