MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 24827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_018627	CCG	2	6	282705	282710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406594203
6003	NC_018627	TTC	2	6	282724	282729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594203
6004	NC_018627	CTT	3	9	282766	282774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594203
6005	NC_018627	TCA	2	6	282859	282864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594348
6006	NC_018627	TTC	2	6	282963	282968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594348
6007	NC_018627	ATA	2	6	283043	283048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594348
6008	NC_018627	GAT	2	6	283108	283113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594348
6009	NC_018627	CAG	2	6	283138	283143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594348
6010	NC_018627	TC	3	6	283144	283149	0 %	50 %	0 %	50 %	406594348
6011	NC_018627	CTG	2	6	283238	283243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594348
6012	NC_018627	ATC	2	6	283319	283324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594348
6013	NC_018627	TC	3	6	283437	283442	0 %	50 %	0 %	50 %	406594348
6014	NC_018627	TCT	2	6	283447	283452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594348
6015	NC_018627	CCT	2	6	283459	283464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594348
6016	NC_018627	A	7	7	283539	283545	100 %	0 %	0 %	0 %	406594348
6017	NC_018627	ATG	2	6	283616	283621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594348
6018	NC_018627	TCGT	2	8	283639	283646	0 %	50 %	25 %	25 %	406594348
6019	NC_018627	A	8	8	283660	283667	100 %	0 %	0 %	0 %	406594858
6020	NC_018627	AGA	2	6	283674	283679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594858
6021	NC_018627	AG	3	6	283692	283697	50 %	0 %	50 %	0 %	406594858
6022	NC_018627	GAA	2	6	283798	283803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594858
6023	NC_018627	TCT	2	6	283885	283890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594858
6024	NC_018627	ATTG	2	8	283962	283969	25 %	50 %	25 %	0 %	406594858
6025	NC_018627	TGA	2	6	283971	283976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594858
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6027	NC_018627	AGCACG	2	12	284109	284120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594858
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6029	NC_018627	GGA	2	6	284191	284196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594858
6030	NC_018627	TAGA	2	8	284231	284238	50 %	25 %	25 %	0 %	406594858
6031	NC_018627	GAT	2	6	284241	284246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594858
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6033	NC_018627	GCG	2	6	284307	284312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406594858
6034	NC_018627	CTG	2	6	284383	284388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594858
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6041	NC_018627	ATG	2	6	284894	284899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594858
6042	NC_018627	TCG	2	6	284919	284924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594858
6043	NC_018627	GAT	2	6	284929	284934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594858
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6045	NC_018627	A	6	6	285070	285075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_018627	TTA	2	6	285084	285089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_018627	T	7	7	285130	285136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_018627	TTGT	2	8	285190	285197	0 %	75 %	25 %	0 %	406594023
6049	NC_018627	CTT	2	6	285251	285256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594023
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6051	NC_018627	GTT	2	6	285396	285401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594023
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6054	NC_018627	AGAC	2	8	285446	285453	50 %	0 %	25 %	25 %	406594023
6055	NC_018627	TCT	2	6	285458	285463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594023
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6057	NC_018627	CTTA	2	8	285619	285626	25 %	50 %	0 %	25 %	406594023
6058	NC_018627	TCCCG	2	10	285642	285651	0 %	20 %	20 %	60 %	406594023
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6061	NC_018627	AGAA	2	8	285797	285804	75 %	0 %	25 %	0 %	406594023
6062	NC_018627	TTC	2	6	285812	285817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594023
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6065	NC_018627	TAT	3	9	285856	285864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594023
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6106	NC_018627	TGGA	2	8	288113	288120	25 %	25 %	50 %	0 %	406594566
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6495	NC_018627	TGT	2	6	307415	307420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594826
6496	NC_018627	GAAT	2	8	307517	307524	50 %	25 %	25 %	0 %	406594826
6497	NC_018627	CAA	2	6	307592	307597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_018627	GATT	2	8	307598	307605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_018627	A	7	7	307628	307634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_018627	ATAGG	2	10	307637	307646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

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