MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 24876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018625	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018625	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018625	CGA	2	6	169	174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591805
5	NC_018625	AGA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591805
6	NC_018625	CTT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
7	NC_018625	T	7	7	255	261	0 %	100 %	0 %	0 %	406591805
8	NC_018625	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	406591805
9	NC_018625	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	406591805
10	NC_018625	GT	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	406591805
11	NC_018625	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
12	NC_018625	A	7	7	477	483	100 %	0 %	0 %	0 %	406591805
13	NC_018625	TG	3	6	497	502	0 %	50 %	50 %	0 %	406591805
14	NC_018625	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591805
15	NC_018625	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591805
16	NC_018625	GCGT	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	406591805
17	NC_018625	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591805
18	NC_018625	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591805
19	NC_018625	TC	3	6	726	731	0 %	50 %	0 %	50 %	406591805
20	NC_018625	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
21	NC_018625	ACA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591805
22	NC_018625	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591805
23	NC_018625	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591805
24	NC_018625	AGC	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591805
25	NC_018625	CTA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591805
26	NC_018625	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591805
27	NC_018625	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591805
28	NC_018625	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018625	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018625	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
31	NC_018625	AC	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	406591806
32	NC_018625	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	406591806
33	NC_018625	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591806
34	NC_018625	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
35	NC_018625	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	406591806
36	NC_018625	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591806
37	NC_018625	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
38	NC_018625	TC	3	6	1583	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	406591806
39	NC_018625	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
40	NC_018625	CTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591806
41	NC_018625	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
42	NC_018625	TG	3	6	1887	1892	0 %	50 %	50 %	0 %	406591806
43	NC_018625	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591806
44	NC_018625	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
45	NC_018625	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591806
46	NC_018625	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
47	NC_018625	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591806
48	NC_018625	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591806
49	NC_018625	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591806
50	NC_018625	T	6	6	2209	2214	0 %	100 %	0 %	0 %	406591806
51	NC_018625	T	8	8	2288	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	406591806
52	NC_018625	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591806
53	NC_018625	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591806
54	NC_018625	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	406591806
55	NC_018625	T	7	7	2616	2622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018625	T	7	7	2627	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	406591807
57	NC_018625	AGT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591807
58	NC_018625	TTA	2	6	2652	2657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
59	NC_018625	TCC	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591807
60	NC_018625	T	6	6	2726	2731	0 %	100 %	0 %	0 %	406591807
61	NC_018625	TTC	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591807
62	NC_018625	GA	3	6	2782	2787	50 %	0 %	50 %	0 %	406591807
63	NC_018625	TTA	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
64	NC_018625	TGTT	2	8	2837	2844	0 %	75 %	25 %	0 %	406591807
65	NC_018625	T	6	6	2881	2886	0 %	100 %	0 %	0 %	406591807
66	NC_018625	T	6	6	2893	2898	0 %	100 %	0 %	0 %	406591807
67	NC_018625	AGA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591807
68	NC_018625	GAAG	2	8	2948	2955	50 %	0 %	50 %	0 %	406591807
69	NC_018625	TAT	2	6	2968	2973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
70	NC_018625	AGTA	2	8	2978	2985	50 %	25 %	25 %	0 %	406591807
71	NC_018625	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591807
72	NC_018625	T	6	6	3007	3012	0 %	100 %	0 %	0 %	406591807
73	NC_018625	TAT	2	6	3054	3059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018625	ATT	3	9	3069	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018625	TGT	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018625	T	6	6	3098	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018625	GAA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591808
78	NC_018625	TTTG	2	8	3296	3303	0 %	75 %	25 %	0 %	406591808
79	NC_018625	TCCT	2	8	3322	3329	0 %	50 %	0 %	50 %	406591808
80	NC_018625	GA	3	6	3336	3341	50 %	0 %	50 %	0 %	406591808
81	NC_018625	GAAAA	2	10	3352	3361	80 %	0 %	20 %	0 %	406591808
82	NC_018625	ATG	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591808
83	NC_018625	AGT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591808
84	NC_018625	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591808
85	NC_018625	G	6	6	3582	3587	0 %	0 %	100 %	0 %	406591808
86	NC_018625	CAA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591808
87	NC_018625	ATC	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591809
88	NC_018625	TGG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591809
89	NC_018625	AAG	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
90	NC_018625	AGA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
91	NC_018625	T	6	6	4188	4193	0 %	100 %	0 %	0 %	406591809
92	NC_018625	TAA	2	6	4206	4211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591809
93	NC_018625	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	406591809
94	NC_018625	GAA	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
95	NC_018625	AGC	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591809
96	NC_018625	TAA	2	6	4310	4315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591809
97	NC_018625	AGGAG	2	10	4410	4419	40 %	0 %	60 %	0 %	406591809
98	NC_018625	AGA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
99	NC_018625	CTT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591809
100	NC_018625	ATG	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591809
101	NC_018625	GAT	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591809
102	NC_018625	GCT	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591809
103	NC_018625	CT	3	6	4726	4731	0 %	50 %	0 %	50 %	406591809
104	NC_018625	GAA	2	6	4806	4811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
105	NC_018625	CTGTGG	2	12	4817	4828	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	406591809
106	NC_018625	AAG	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
107	NC_018625	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591809
108	NC_018625	AAG	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
109	NC_018625	AGA	2	6	5109	5114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591809
110	NC_018625	TTA	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591809
111	NC_018625	CAA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591809
112	NC_018625	GAAA	2	8	5252	5259	75 %	0 %	25 %	0 %	406591809
113	NC_018625	CAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018625	TTG	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018625	AATC	2	8	5411	5418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018625	T	7	7	5454	5460	0 %	100 %	0 %	0 %	406591810
117	NC_018625	AGA	2	6	5517	5522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591810
118	NC_018625	CGAG	2	8	5523	5530	25 %	0 %	50 %	25 %	406591810
119	NC_018625	TGG	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406591810
120	NC_018625	TAT	2	6	5618	5623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591810
121	NC_018625	GTT	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
122	NC_018625	CAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591810
123	NC_018625	GAT	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
124	NC_018625	TGT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
125	NC_018625	GGA	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591810
126	NC_018625	T	6	6	5783	5788	0 %	100 %	0 %	0 %	406591810
127	NC_018625	CAA	2	6	5860	5865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591810
128	NC_018625	TGA	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
129	NC_018625	GAT	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
130	NC_018625	TGT	3	9	5980	5988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
131	NC_018625	TGA	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
132	NC_018625	TGC	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591810
133	NC_018625	T	7	7	6069	6075	0 %	100 %	0 %	0 %	406591810
134	NC_018625	AC	3	6	6150	6155	50 %	0 %	0 %	50 %	406591810
135	NC_018625	TGC	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591810
136	NC_018625	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591810
137	NC_018625	GAA	2	6	6271	6276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591810
138	NC_018625	A	6	6	6275	6280	100 %	0 %	0 %	0 %	406591810
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142	NC_018625	CTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591810
143	NC_018625	GTT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591810
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145	NC_018625	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	406591810
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153	NC_018625	GAA	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_018625	TGA	2	6	7605	7610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591812
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404	NC_018625	T	6	6	18736	18741	0 %	100 %	0 %	0 %	406591821
405	NC_018625	GGA	2	6	18859	18864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591821
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472	NC_018625	TAA	2	6	21784	21789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_018625	TTA	2	6	21814	21819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591823
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