MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018624	T	6	6	658898	658903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_018624	TCC	2	6	658935	658940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_018624	TGT	2	6	658999	659004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460769
14004	NC_018624	AATGA	2	10	659009	659018	60 %	20 %	20 %	0 %	407460769
14005	NC_018624	T	7	7	659060	659066	0 %	100 %	0 %	0 %	407460769
14006	NC_018624	CTGG	2	8	659079	659086	0 %	25 %	50 %	25 %	407460769
14007	NC_018624	CAG	2	6	659172	659177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460769
14008	NC_018624	TCTTG	2	10	659196	659205	0 %	60 %	20 %	20 %	407460769
14009	NC_018624	AAAGT	2	10	659235	659244	60 %	20 %	20 %	0 %	407460769
14010	NC_018624	CTT	2	6	659391	659396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460769
14011	NC_018624	CCTA	2	8	659442	659449	25 %	25 %	0 %	50 %	407460769
14012	NC_018624	TCT	2	6	659504	659509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460769
14013	NC_018624	TTTTC	2	10	659531	659540	0 %	80 %	0 %	20 %	407460769
14014	NC_018624	TGTC	2	8	659619	659626	0 %	50 %	25 %	25 %	407460769
14015	NC_018624	GTT	2	6	659630	659635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460769
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14017	NC_018624	TCC	2	6	659767	659772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14018	NC_018624	AGT	2	6	659831	659836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_018624	TCC	2	6	659870	659875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460770
14020	NC_018624	A	6	6	659884	659889	100 %	0 %	0 %	0 %	407460770
14021	NC_018624	TACC	2	8	660021	660028	25 %	25 %	0 %	50 %	407460770
14022	NC_018624	CGC	2	6	660060	660065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407460770
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14027	NC_018624	CATC	2	8	660199	660206	25 %	25 %	0 %	50 %	407460770
14028	NC_018624	TGA	2	6	660218	660223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_018624	GCA	2	6	660253	660258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_018624	CTT	2	6	660263	660268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_018624	ACA	2	6	660357	660362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_018624	ATC	2	6	660371	660376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_018624	GCAC	2	8	660381	660388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14034	NC_018624	A	6	6	660423	660428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_018624	TATG	2	8	660446	660453	25 %	50 %	25 %	0 %	407460771
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14045	NC_018624	CATC	2	8	660892	660899	25 %	25 %	0 %	50 %	407460771
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14048	NC_018624	ATT	2	6	661011	661016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_018624	ATAA	2	8	661026	661033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_018624	TTTA	2	8	661047	661054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_018624	ATTCT	2	10	661156	661165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14052	NC_018624	TCT	2	6	661181	661186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_018624	CATA	2	8	661187	661194	50 %	25 %	0 %	25 %	407460772
14054	NC_018624	T	6	6	661202	661207	0 %	100 %	0 %	0 %	407460772
14055	NC_018624	AAC	2	6	661218	661223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460772
14056	NC_018624	ATCAG	2	10	661281	661290	40 %	20 %	20 %	20 %	407460772
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14059	NC_018624	CT	3	6	661471	661476	0 %	50 %	0 %	50 %	407460772
14060	NC_018624	CTT	2	6	661550	661555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460772
14061	NC_018624	CTT	2	6	661588	661593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460772
14062	NC_018624	TTC	2	6	661597	661602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460772
14063	NC_018624	CAGA	2	8	661618	661625	50 %	0 %	25 %	25 %	407460772
14064	NC_018624	CTT	2	6	661631	661636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460772
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14067	NC_018624	ATT	2	6	661735	661740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_018624	TAT	2	6	661748	661753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_018624	AAT	2	6	661757	661762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_018624	GTC	2	6	661910	661915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_018624	A	6	6	661927	661932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_018624	AG	3	6	661944	661949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_018624	TA	3	6	662000	662005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14076	NC_018624	TGA	2	6	662171	662176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460773
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14082	NC_018624	TGC	2	6	662450	662455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460773
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14084	NC_018624	A	6	6	662511	662516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_018624	AAT	2	6	662528	662533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_018624	TTA	2	6	662551	662556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14088	NC_018624	CAATCT	2	12	662597	662608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_018624	TAG	2	6	662611	662616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_018624	CATT	2	8	662626	662633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14093	NC_018624	CAA	2	6	662699	662704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460774
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14098	NC_018624	TTC	2	6	662975	662980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460774
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14107	NC_018624	TC	3	6	663332	663337	0 %	50 %	0 %	50 %	407460774
14108	NC_018624	TAG	2	6	663350	663355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460774
14109	NC_018624	GAGTA	2	10	663381	663390	40 %	20 %	40 %	0 %	407460774
14110	NC_018624	ACT	2	6	663394	663399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460774
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14112	NC_018624	TAT	2	6	663519	663524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_018624	TGA	2	6	663527	663532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_018624	AAGAG	2	10	663545	663554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_018624	TAA	2	6	663659	663664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460775
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14247	NC_018624	TAA	2	6	669618	669623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14251	NC_018624	A	6	6	669694	669699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14498	NC_018624	GAA	2	6	681639	681644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_018624	CCG	2	6	681671	681676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14500	NC_018624	CAT	2	6	681688	681693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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