MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 24738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13247	NC_018623	TCC	2	6	619733	619738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407459371
13248	NC_018623	TTA	2	6	619739	619744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459371
13249	NC_018623	GAA	2	6	619788	619793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459371
13250	NC_018623	TAT	2	6	619802	619807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459371
13251	NC_018623	TCCAC	2	10	619843	619852	20 %	20 %	0 %	60 %	407459371
13252	NC_018623	ATC	2	6	619924	619929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459371
13253	NC_018623	TTAA	2	8	620017	620024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_018623	CTT	2	6	620086	620091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13255	NC_018623	CTA	2	6	620120	620125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459372
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13258	NC_018623	GGC	2	6	620276	620281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13259	NC_018623	CTTC	2	8	620361	620368	0 %	50 %	0 %	50 %	407459373
13260	NC_018623	GTC	2	6	620392	620397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407459373
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13265	NC_018623	AATA	2	8	620709	620716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13266	NC_018623	ATT	2	6	620788	620793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459374
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13268	NC_018623	CAA	2	6	620849	620854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407459374
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13272	NC_018623	ATT	2	6	621001	621006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459374
13273	NC_018623	AAAG	2	8	621043	621050	75 %	0 %	25 %	0 %	407459374
13274	NC_018623	TAT	2	6	621163	621168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459374
13275	NC_018623	AGA	2	6	621276	621281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13276	NC_018623	CGT	2	6	621284	621289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13281	NC_018623	AC	3	6	621595	621600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13282	NC_018623	CTG	2	6	621693	621698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407459376
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13304	NC_018623	AT	3	6	622518	622523	50 %	50 %	0 %	0 %	407459378
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13324	NC_018623	A	7	7	623344	623350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13327	NC_018623	AGT	2	6	623422	623427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13350	NC_018623	CCA	2	6	624224	624229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407459379
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13352	NC_018623	GAAA	2	8	624388	624395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13353	NC_018623	GTTT	2	8	624423	624430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13354	NC_018623	T	6	6	624466	624471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13355	NC_018623	AGCT	2	8	624499	624506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13356	NC_018623	TTC	2	6	624524	624529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13357	NC_018623	AGGGG	2	10	624532	624541	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13358	NC_018623	TCT	2	6	624548	624553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13359	NC_018623	GTT	2	6	624598	624603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_018623	TCTT	2	8	624606	624613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13361	NC_018623	TTAC	2	8	624655	624662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13362	NC_018623	TAC	2	6	624693	624698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13363	NC_018623	A	6	6	624704	624709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13364	NC_018623	CTT	3	9	624732	624740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459380
13365	NC_018623	AAC	2	6	624763	624768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407459380
13366	NC_018623	CTA	2	6	624773	624778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459380
13367	NC_018623	TA	3	6	624783	624788	50 %	50 %	0 %	0 %	407459380
13368	NC_018623	TCA	2	6	624875	624880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459380
13369	NC_018623	AAT	2	6	624882	624887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407459380
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13494	NC_018623	ATG	2	6	630640	630645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459384
13495	NC_018623	GCTAA	2	10	630674	630683	40 %	20 %	20 %	20 %	407459384
13496	NC_018623	CT	3	6	630715	630720	0 %	50 %	0 %	50 %	407459384
13497	NC_018623	ATC	2	6	630748	630753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459384
13498	NC_018623	TAC	2	6	630810	630815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459384
13499	NC_018623	C	7	7	630825	630831	0 %	0 %	0 %	100 %	407459384
13500	NC_018623	AAAAT	2	10	630851	630860	80 %	20 %	0 %	0 %	407459384

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