MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 24738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018623	CAT	2	6	258279	258284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459049
5502	NC_018623	T	7	7	258355	258361	0 %	100 %	0 %	0 %	407459049
5503	NC_018623	TTG	2	6	258393	258398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459049
5504	NC_018623	AGA	2	6	258503	258508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459050
5505	NC_018623	TAA	2	6	258518	258523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407459050
5506	NC_018623	TCT	2	6	258563	258568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459050
5507	NC_018623	AATTTA	2	12	258576	258587	50 %	50 %	0 %	0 %	407459050
5508	NC_018623	CTTT	2	8	258606	258613	0 %	75 %	0 %	25 %	407459050
5509	NC_018623	AC	3	6	258679	258684	50 %	0 %	0 %	50 %	407459050
5510	NC_018623	GTA	2	6	258713	258718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459050
5511	NC_018623	GGC	2	6	258796	258801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407459050
5512	NC_018623	CGA	2	6	258840	258845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407459050
5513	NC_018623	CGT	2	6	258895	258900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407459050
5514	NC_018623	TCT	2	6	258936	258941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459050
5515	NC_018623	TA	3	6	258988	258993	50 %	50 %	0 %	0 %	407459050
5516	NC_018623	TCT	3	9	259008	259016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459050
5517	NC_018623	GA	3	6	259023	259028	50 %	0 %	50 %	0 %	407459050
5518	NC_018623	GAGG	2	8	259035	259042	25 %	0 %	75 %	0 %	407459050
5519	NC_018623	GAA	2	6	259063	259068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459050
5520	NC_018623	TAGA	2	8	259150	259157	50 %	25 %	25 %	0 %	407459050
5521	NC_018623	AAC	3	9	259160	259168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407459050
5522	NC_018623	GTT	2	6	259171	259176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459050
5523	NC_018623	AAAG	2	8	259185	259192	75 %	0 %	25 %	0 %	407459050
5524	NC_018623	GAGAA	2	10	259228	259237	60 %	0 %	40 %	0 %	407459050
5525	NC_018623	GTAG	2	8	259242	259249	25 %	25 %	50 %	0 %	407459050
5526	NC_018623	TTC	2	6	259310	259315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459050
5527	NC_018623	ATA	2	6	259388	259393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407459050
5528	NC_018623	TTC	2	6	259417	259422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459050
5529	NC_018623	AAT	2	6	259474	259479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407459050
5530	NC_018623	GTT	2	6	259572	259577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459050
5531	NC_018623	GAA	2	6	259720	259725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_018623	A	6	6	259794	259799	100 %	0 %	0 %	0 %	407459051
5533	NC_018623	TTTAA	2	10	259917	259926	40 %	60 %	0 %	0 %	407459051
5534	NC_018623	ATC	2	6	259946	259951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459051
5535	NC_018623	T	6	6	259993	259998	0 %	100 %	0 %	0 %	407459051
5536	NC_018623	CAG	2	6	259999	260004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407459051
5537	NC_018623	CTT	2	6	260005	260010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459051
5538	NC_018623	ATC	2	6	260087	260092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459051
5539	NC_018623	GTT	2	6	260098	260103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459051
5540	NC_018623	TTG	2	6	260274	260279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459051
5541	NC_018623	AAG	2	6	260309	260314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459051
5542	NC_018623	GTT	2	6	260418	260423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459051
5543	NC_018623	TCA	2	6	260424	260429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459051
5544	NC_018623	CTT	2	6	260710	260715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459051
5545	NC_018623	GAG	2	6	260749	260754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407459051
5546	NC_018623	GCT	2	6	260766	260771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407459051
5547	NC_018623	TCT	2	6	260811	260816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459051
5548	NC_018623	TTC	2	6	260840	260845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459051
5549	NC_018623	TCC	2	6	260867	260872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407459051
5550	NC_018623	TTCA	2	8	260951	260958	25 %	50 %	0 %	25 %	407459051
5551	NC_018623	TCC	2	6	260991	260996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407459051
5552	NC_018623	ATCTC	2	10	261039	261048	20 %	40 %	0 %	40 %	407459051
5553	NC_018623	GATG	2	8	261073	261080	25 %	25 %	50 %	0 %	407459051
5554	NC_018623	TTC	2	6	261091	261096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459051
5555	NC_018623	AAAC	2	8	261112	261119	75 %	0 %	0 %	25 %	407459051
5556	NC_018623	GTGG	2	8	261137	261144	0 %	25 %	75 %	0 %	407459051
5557	NC_018623	TCT	2	6	261165	261170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459051
5558	NC_018623	AGA	2	6	261189	261194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459051
5559	NC_018623	T	6	6	261226	261231	0 %	100 %	0 %	0 %	407459051
5560	NC_018623	GAA	2	6	261259	261264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459051
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5563	NC_018623	CAT	2	6	261311	261316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459051
5564	NC_018623	AGTGTA	2	12	261344	261355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459051
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5568	NC_018623	TAT	2	6	261527	261532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_018623	ATT	2	6	261639	261644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_018623	TTTTG	2	10	261655	261664	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_018623	A	6	6	261665	261670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_018623	ATATAA	2	12	261686	261697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_018623	T	6	6	261714	261719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_018623	AATCCT	2	12	261769	261780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459052
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5578	NC_018623	AGT	2	6	262017	262022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459052
5579	NC_018623	AG	3	6	262038	262043	50 %	0 %	50 %	0 %	407459052
5580	NC_018623	TGA	2	6	262125	262130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459052
5581	NC_018623	TGA	2	6	262203	262208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459052
5582	NC_018623	CGT	2	6	262243	262248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407459052
5583	NC_018623	AG	3	6	262284	262289	50 %	0 %	50 %	0 %	407459052
5584	NC_018623	TTA	2	6	262303	262308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459052
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5586	NC_018623	CGA	2	6	262431	262436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407459052
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5588	NC_018623	AGA	3	9	262530	262538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459052
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5591	NC_018623	TAT	2	6	262584	262589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459052
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5594	NC_018623	A	7	7	262677	262683	100 %	0 %	0 %	0 %	407459052
5595	NC_018623	CTT	3	9	262790	262798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459052
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5599	NC_018623	TGA	2	6	262923	262928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459052
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5601	NC_018623	TTA	2	6	262953	262958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_018623	GTT	2	6	262973	262978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_018623	T	8	8	262977	262984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_018623	TTTA	2	8	263035	263042	25 %	75 %	0 %	0 %	407459053
5605	NC_018623	GT	3	6	263072	263077	0 %	50 %	50 %	0 %	407459053
5606	NC_018623	GTT	2	6	263106	263111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459053
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5608	NC_018623	TAG	2	6	263223	263228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459053
5609	NC_018623	ATTT	2	8	263241	263248	25 %	75 %	0 %	0 %	407459053
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5613	NC_018623	TCTT	2	8	263323	263330	0 %	75 %	0 %	25 %	407459053
5614	NC_018623	GTT	2	6	263348	263353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459053
5615	NC_018623	TGT	2	6	263383	263388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459053
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5619	NC_018623	AGA	2	6	263602	263607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459053
5620	NC_018623	TTTG	2	8	263621	263628	0 %	75 %	25 %	0 %	407459053
5621	NC_018623	GTT	2	6	263639	263644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459053
5622	NC_018623	CTT	3	9	263646	263654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459053
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