MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018622	ATG	2	6	190741	190746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457735
4002	NC_018622	GAT	2	6	190800	190805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457735
4003	NC_018622	GT	3	6	190830	190835	0 %	50 %	50 %	0 %	407457735
4004	NC_018622	GGT	2	6	190885	190890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457735
4005	NC_018622	GCA	2	6	190946	190951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457735
4006	NC_018622	TTC	2	6	191016	191021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457735
4007	NC_018622	GATAA	2	10	191023	191032	60 %	20 %	20 %	0 %	407457735
4008	NC_018622	ATTT	2	8	191035	191042	25 %	75 %	0 %	0 %	407457735
4009	NC_018622	CTAT	2	8	191110	191117	25 %	50 %	0 %	25 %	407457735
4010	NC_018622	TGA	2	6	191120	191125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457735
4011	NC_018622	TCT	2	6	191155	191160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457735
4012	NC_018622	TAA	2	6	191214	191219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457735
4013	NC_018622	ACA	2	6	191226	191231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457735
4014	NC_018622	TTA	2	6	191257	191262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457735
4015	NC_018622	TCT	2	6	191337	191342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457735
4016	NC_018622	CTT	3	9	191373	191381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457735
4017	NC_018622	A	6	6	191384	191389	100 %	0 %	0 %	0 %	407457735
4018	NC_018622	ATA	2	6	191447	191452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457735
4019	NC_018622	TCA	2	6	191456	191461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457735
4020	NC_018622	ATT	2	6	191496	191501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457735
4021	NC_018622	TTAA	2	8	191518	191525	50 %	50 %	0 %	0 %	407457735
4022	NC_018622	A	6	6	191537	191542	100 %	0 %	0 %	0 %	407457735
4023	NC_018622	GAA	2	6	191549	191554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457735
4024	NC_018622	CAA	2	6	191570	191575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457735
4025	NC_018622	ATT	3	9	191595	191603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457735
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4030	NC_018622	GAAA	2	8	191722	191729	75 %	0 %	25 %	0 %	407457735
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4032	NC_018622	TTG	2	6	191750	191755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018622	AGAT	2	8	191793	191800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018622	ACG	2	6	191816	191821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_018622	TTC	2	6	191848	191853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457736
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4041	NC_018622	T	6	6	192190	192195	0 %	100 %	0 %	0 %	407457736
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4050	NC_018622	TGC	2	6	192771	192776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457736
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4057	NC_018622	AGC	2	6	192913	192918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457736
4058	NC_018622	ATC	2	6	192928	192933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457736
4059	NC_018622	ATT	2	6	192962	192967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457736
4060	NC_018622	ATA	2	6	192990	192995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457736
4061	NC_018622	TAT	2	6	193006	193011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457736
4062	NC_018622	AGGG	2	8	193020	193027	25 %	0 %	75 %	0 %	407457736
4063	NC_018622	CTT	2	6	193067	193072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457736
4064	NC_018622	TTCA	2	8	193178	193185	25 %	50 %	0 %	25 %	407457736
4065	NC_018622	TCA	2	6	193196	193201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457736
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4108	NC_018622	ACA	2	6	195192	195197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457737
4109	NC_018622	GCTA	2	8	195204	195211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_018622	TGT	2	6	195282	195287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018622	CCCTA	2	10	195288	195297	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4112	NC_018622	ATT	2	6	195399	195404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018622	GTCT	2	8	195428	195435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_018622	AGT	2	6	195447	195452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018622	TAAA	3	12	195466	195477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018622	CA	3	6	195509	195514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_018622	GAG	2	6	195549	195554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_018622	TAA	2	6	195616	195621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_018622	AGT	2	6	195629	195634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_018622	TTA	2	6	195641	195646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018622	A	7	7	195681	195687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018622	TAA	2	6	195694	195699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_018622	A	6	6	195736	195741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018622	GAA	2	6	195746	195751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018622	CTA	2	6	195752	195757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_018622	GTT	2	6	195767	195772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_018622	G	6	6	195793	195798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4249	NC_018622	TTA	2	6	200915	200920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457743
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4251	NC_018622	T	6	6	200991	200996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_018622	ATTAA	2	10	201053	201062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_018622	TAAT	2	8	201069	201076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_018622	ATC	2	6	201283	201288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457744
4255	NC_018622	CTTA	2	8	201343	201350	25 %	50 %	0 %	25 %	407457744
4256	NC_018622	TTGGT	2	10	201429	201438	0 %	60 %	40 %	0 %	407457744
4257	NC_018622	CAA	2	6	201516	201521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457744
4258	NC_018622	GAT	2	6	201536	201541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457744
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4261	NC_018622	CCT	2	6	201667	201672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457745
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4269	NC_018622	A	6	6	202122	202127	100 %	0 %	0 %	0 %	407457745
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4315	NC_018622	TTG	2	6	204103	204108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4364	NC_018622	CTA	2	6	206086	206091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457751
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4366	NC_018622	ATA	2	6	206161	206166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4367	NC_018622	AGAA	2	8	206284	206291	75 %	0 %	25 %	0 %	407457752
4368	NC_018622	TTA	2	6	206296	206301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457752
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4372	NC_018622	AAGA	2	8	206373	206380	75 %	0 %	25 %	0 %	407457752
4373	NC_018622	TATTAC	2	12	206383	206394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407457752
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