MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_018622	T	6	6	1083985	1083990	0 %	100 %	0 %	0 %	407458540
23003	NC_018622	CT	4	8	1084006	1084013	0 %	50 %	0 %	50 %	407458540
23004	NC_018622	CGT	2	6	1084041	1084046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458540
23005	NC_018622	AGG	2	6	1084133	1084138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458540
23006	NC_018622	CAA	2	6	1084164	1084169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458540
23007	NC_018622	A	7	7	1084202	1084208	100 %	0 %	0 %	0 %	407458540
23008	NC_018622	GCA	2	6	1084223	1084228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458540
23009	NC_018622	TGA	2	6	1084250	1084255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458540
23010	NC_018622	GCT	2	6	1084257	1084262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458540
23011	NC_018622	GCT	2	6	1084284	1084289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458540
23012	NC_018622	AAC	2	6	1084294	1084299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458540
23013	NC_018622	TC	3	6	1084307	1084312	0 %	50 %	0 %	50 %	407458540
23014	NC_018622	TG	3	6	1084601	1084606	0 %	50 %	50 %	0 %	407458541
23015	NC_018622	AAG	2	6	1084632	1084637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458541
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23017	NC_018622	AAG	2	6	1084710	1084715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458541
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23019	NC_018622	AGC	2	6	1084843	1084848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458541
23020	NC_018622	AGC	3	9	1084855	1084863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458541
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23022	NC_018622	TTC	2	6	1084917	1084922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458541
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23037	NC_018622	ACA	2	6	1085600	1085605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458541
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23039	NC_018622	TAG	2	6	1085893	1085898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23040	NC_018622	TA	3	6	1085922	1085927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23041	NC_018622	A	6	6	1085931	1085936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23042	NC_018622	AAG	2	6	1085955	1085960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_018622	TCT	2	6	1085980	1085985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23044	NC_018622	ACT	2	6	1086002	1086007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23045	NC_018622	GAT	2	6	1086019	1086024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23046	NC_018622	AGC	2	6	1086070	1086075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458542
23047	NC_018622	TAC	2	6	1086130	1086135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458542
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23055	NC_018622	CTAT	2	8	1086785	1086792	25 %	50 %	0 %	25 %	407458543
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23060	NC_018622	TCA	2	6	1087029	1087034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458543
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23090	NC_018622	CTA	2	6	1088292	1088297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458544
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23092	NC_018622	GCAT	2	8	1088350	1088357	25 %	25 %	25 %	25 %	407458544
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23102	NC_018622	ATA	2	6	1088946	1088951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458545
23103	NC_018622	TTCT	2	8	1089096	1089103	0 %	75 %	0 %	25 %	407458545
23104	NC_018622	AAG	2	6	1089111	1089116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458545
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23109	NC_018622	AGACA	2	10	1089497	1089506	60 %	0 %	20 %	20 %	407458545
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23111	NC_018622	TAAA	2	8	1089687	1089694	75 %	25 %	0 %	0 %	407458545
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23117	NC_018622	TCA	2	6	1090043	1090048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23119	NC_018622	AAG	2	6	1090128	1090133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23120	NC_018622	T	6	6	1090135	1090140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23121	NC_018622	TTG	2	6	1090145	1090150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23355	NC_018622	CATA	2	8	1102133	1102140	50 %	25 %	0 %	25 %	407458556
23356	NC_018622	CAA	2	6	1102173	1102178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458556
23357	NC_018622	TAC	2	6	1102199	1102204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458556
23358	NC_018622	CT	3	6	1102358	1102363	0 %	50 %	0 %	50 %	407458556
23359	NC_018622	AGA	2	6	1102373	1102378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458556
23360	NC_018622	GCT	2	6	1102410	1102415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458556
23361	NC_018622	T	6	6	1102471	1102476	0 %	100 %	0 %	0 %	407458556
23362	NC_018622	ATG	2	6	1102537	1102542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458556
23363	NC_018622	ATTT	2	8	1102789	1102796	25 %	75 %	0 %	0 %	407458556
23364	NC_018622	CTT	2	6	1102879	1102884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458556
23365	NC_018622	AGTT	2	8	1102903	1102910	25 %	50 %	25 %	0 %	407458556
23366	NC_018622	ATT	2	6	1102982	1102987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458556
23367	NC_018622	A	6	6	1102992	1102997	100 %	0 %	0 %	0 %	407458556
23368	NC_018622	A	7	7	1103037	1103043	100 %	0 %	0 %	0 %	407458556
23369	NC_018622	AAC	3	9	1103120	1103128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458556
23370	NC_018622	AAGG	2	8	1103139	1103146	50 %	0 %	50 %	0 %	407458556
23371	NC_018622	TTTA	2	8	1103212	1103219	25 %	75 %	0 %	0 %	407458556
23372	NC_018622	A	6	6	1103236	1103241	100 %	0 %	0 %	0 %	407458556
23373	NC_018622	CTT	2	6	1103281	1103286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458556
23374	NC_018622	GTT	2	6	1103351	1103356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458557
23375	NC_018622	TAC	2	6	1103357	1103362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458557
23376	NC_018622	AGA	3	9	1103440	1103448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458557
23377	NC_018622	CT	3	6	1103471	1103476	0 %	50 %	0 %	50 %	407458557
23378	NC_018622	AGA	2	6	1103526	1103531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458557
23379	NC_018622	TA	3	6	1103537	1103542	50 %	50 %	0 %	0 %	407458557
23380	NC_018622	CAGT	2	8	1103550	1103557	25 %	25 %	25 %	25 %	407458557
23381	NC_018622	GAA	2	6	1103611	1103616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458557
23382	NC_018622	TGA	2	6	1103694	1103699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458557
23383	NC_018622	CGC	2	6	1103737	1103742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458557
23384	NC_018622	TTAA	2	8	1103764	1103771	50 %	50 %	0 %	0 %	407458557
23385	NC_018622	CAG	2	6	1103783	1103788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458557
23386	NC_018622	CTTG	2	8	1103848	1103855	0 %	50 %	25 %	25 %	407458557
23387	NC_018622	CAA	2	6	1103857	1103862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458557
23388	NC_018622	TCG	2	6	1103865	1103870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458557
23389	NC_018622	GTTA	2	8	1103894	1103901	25 %	50 %	25 %	0 %	407458557
23390	NC_018622	T	6	6	1103908	1103913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23391	NC_018622	TGC	2	6	1103930	1103935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23392	NC_018622	AC	3	6	1103954	1103959	50 %	0 %	0 %	50 %	407458558
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23397	NC_018622	ACAAA	2	10	1104122	1104131	80 %	0 %	0 %	20 %	407458558
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23400	NC_018622	ACG	2	6	1104280	1104285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458558
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23402	NC_018622	TGT	2	6	1104364	1104369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458558
23403	NC_018622	TGC	2	6	1104397	1104402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458558
23404	NC_018622	A	7	7	1104430	1104436	100 %	0 %	0 %	0 %	407458558
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23408	NC_018622	GTA	2	6	1104671	1104676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458559
23409	NC_018622	CAG	2	6	1104677	1104682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458559
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23412	NC_018622	ACTTC	2	10	1104825	1104834	20 %	40 %	0 %	40 %	407458559
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23415	NC_018622	CAT	2	6	1104900	1104905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458559
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23422	NC_018622	TGA	2	6	1105181	1105186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458560
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23424	NC_018622	ATCA	2	8	1105197	1105204	50 %	25 %	0 %	25 %	407458560
23425	NC_018622	AGT	2	6	1105272	1105277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458560
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23432	NC_018622	T	6	6	1105516	1105521	0 %	100 %	0 %	0 %	407458560
23433	NC_018622	AATA	2	8	1105572	1105579	75 %	25 %	0 %	0 %	407458560
23434	NC_018622	ACC	2	6	1105593	1105598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23435	NC_018622	T	6	6	1105602	1105607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23436	NC_018622	AG	3	6	1105625	1105630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23437	NC_018622	ACC	2	6	1105645	1105650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23438	NC_018622	A	6	6	1105759	1105764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23439	NC_018622	A	6	6	1105778	1105783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23440	NC_018622	TCA	2	6	1105791	1105796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23441	NC_018622	ATTT	2	8	1105810	1105817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23442	NC_018622	ATC	2	6	1105828	1105833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458561
23443	NC_018622	GA	3	6	1105837	1105842	50 %	0 %	50 %	0 %	407458561
23444	NC_018622	A	6	6	1105891	1105896	100 %	0 %	0 %	0 %	407458561
23445	NC_018622	AT	3	6	1105943	1105948	50 %	50 %	0 %	0 %	407458561
23446	NC_018622	CTG	2	6	1105977	1105982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458561
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23448	NC_018622	CTG	2	6	1106112	1106117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458561
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23453	NC_018622	TTTTC	2	10	1106274	1106283	0 %	80 %	0 %	20 %	407458561
23454	NC_018622	CAA	2	6	1106334	1106339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458561
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23456	NC_018622	AAT	2	6	1106409	1106414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458561
23457	NC_018622	TCT	2	6	1106428	1106433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458561
23458	NC_018622	TTCC	2	8	1106448	1106455	0 %	50 %	0 %	50 %	407458561
23459	NC_018622	CTTC	2	8	1106516	1106523	0 %	50 %	0 %	50 %	407458561
23460	NC_018622	ACA	2	6	1106552	1106557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458561
23461	NC_018622	TTA	2	6	1106657	1106662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458561
23462	NC_018622	AGAA	2	8	1106674	1106681	75 %	0 %	25 %	0 %	407458561
23463	NC_018622	A	6	6	1106747	1106752	100 %	0 %	0 %	0 %	407458561
23464	NC_018622	CAA	2	6	1106794	1106799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458561
23465	NC_018622	AGT	2	6	1106887	1106892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458561
23466	NC_018622	CGT	2	6	1106902	1106907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458561
23467	NC_018622	TGT	2	6	1107010	1107015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458561
23468	NC_018622	TCT	2	6	1107032	1107037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458561
23469	NC_018622	GTA	2	6	1107188	1107193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458561
23470	NC_018622	CTT	2	6	1107231	1107236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458561
23471	NC_018622	CTT	2	6	1107282	1107287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458561
23472	NC_018622	T	6	6	1107334	1107339	0 %	100 %	0 %	0 %	407458561
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