MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_018622	AGA	2	6	1060462	1060467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458520
22502	NC_018622	CGTG	2	8	1060503	1060510	0 %	25 %	50 %	25 %	407458520
22503	NC_018622	AGC	3	9	1060527	1060535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458520
22504	NC_018622	ATC	2	6	1060681	1060686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458520
22505	NC_018622	GAA	2	6	1060709	1060714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458520
22506	NC_018622	GCA	2	6	1060748	1060753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458520
22507	NC_018622	T	6	6	1060818	1060823	0 %	100 %	0 %	0 %	407458520
22508	NC_018622	C	6	6	1060824	1060829	0 %	0 %	0 %	100 %	407458520
22509	NC_018622	T	6	6	1060845	1060850	0 %	100 %	0 %	0 %	407458520
22510	NC_018622	AGA	2	6	1060987	1060992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458520
22511	NC_018622	GTT	2	6	1061013	1061018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458520
22512	NC_018622	GGT	2	6	1061020	1061025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458520
22513	NC_018622	T	6	6	1061061	1061066	0 %	100 %	0 %	0 %	407458520
22514	NC_018622	T	6	6	1061089	1061094	0 %	100 %	0 %	0 %	407458520
22515	NC_018622	T	7	7	1061141	1061147	0 %	100 %	0 %	0 %	407458520
22516	NC_018622	AAG	2	6	1061282	1061287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458520
22517	NC_018622	GATG	2	8	1061383	1061390	25 %	25 %	50 %	0 %	407458521
22518	NC_018622	CTC	2	6	1061528	1061533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458521
22519	NC_018622	AG	3	6	1061547	1061552	50 %	0 %	50 %	0 %	407458521
22520	NC_018622	TA	3	6	1061704	1061709	50 %	50 %	0 %	0 %	407458521
22521	NC_018622	AAG	2	6	1061810	1061815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22522	NC_018622	T	7	7	1061831	1061837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22523	NC_018622	TAC	3	9	1061848	1061856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458522
22524	NC_018622	TGT	2	6	1061878	1061883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458522
22525	NC_018622	ACA	2	6	1062023	1062028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458522
22526	NC_018622	A	7	7	1062103	1062109	100 %	0 %	0 %	0 %	407458522
22527	NC_018622	AAT	2	6	1062111	1062116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458522
22528	NC_018622	CAT	2	6	1062147	1062152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458522
22529	NC_018622	TCT	2	6	1062261	1062266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22530	NC_018622	CTG	2	6	1062314	1062319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458523
22531	NC_018622	A	6	6	1062329	1062334	100 %	0 %	0 %	0 %	407458523
22532	NC_018622	TCA	2	6	1062343	1062348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458523
22533	NC_018622	TTC	2	6	1062375	1062380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458523
22534	NC_018622	AAT	2	6	1062397	1062402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458523
22535	NC_018622	T	6	6	1062402	1062407	0 %	100 %	0 %	0 %	407458523
22536	NC_018622	CTT	2	6	1062410	1062415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458523
22537	NC_018622	AGA	2	6	1062471	1062476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458523
22538	NC_018622	TCC	2	6	1062477	1062482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458523
22539	NC_018622	CAT	2	6	1062495	1062500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458523
22540	NC_018622	CCA	2	6	1062589	1062594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458523
22541	NC_018622	CAT	2	6	1062621	1062626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458523
22542	NC_018622	TCAA	2	8	1062628	1062635	50 %	25 %	0 %	25 %	407458523
22543	NC_018622	GTTTTT	2	12	1062653	1062664	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407458523
22544	NC_018622	CTGG	2	8	1062773	1062780	0 %	25 %	50 %	25 %	407458524
22545	NC_018622	CAC	2	6	1062781	1062786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458524
22546	NC_018622	T	6	6	1062806	1062811	0 %	100 %	0 %	0 %	407458524
22547	NC_018622	TCC	2	6	1062871	1062876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458524
22548	NC_018622	GTA	2	6	1062989	1062994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458524
22549	NC_018622	CCA	3	9	1063045	1063053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458524
22550	NC_018622	GAA	2	6	1063055	1063060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458524
22551	NC_018622	CTA	2	6	1063084	1063089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458524
22552	NC_018622	TTC	2	6	1063111	1063116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458524
22553	NC_018622	CGT	2	6	1063171	1063176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458524
22554	NC_018622	ATG	2	6	1063183	1063188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458524
22555	NC_018622	AC	3	6	1063236	1063241	50 %	0 %	0 %	50 %	407458524
22556	NC_018622	TTC	2	6	1063419	1063424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458524
22557	NC_018622	ATG	3	9	1063432	1063440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458524
22558	NC_018622	CATTGC	2	12	1063524	1063535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407458524
22559	NC_018622	TCC	3	9	1063548	1063556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458524
22560	NC_018622	CGAA	2	8	1063653	1063660	50 %	0 %	25 %	25 %	407458524
22561	NC_018622	GAA	3	9	1063658	1063666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458524
22562	NC_018622	T	6	6	1063702	1063707	0 %	100 %	0 %	0 %	407458524
22563	NC_018622	ACG	2	6	1063716	1063721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458524
22564	NC_018622	AGG	2	6	1063722	1063727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458524
22565	NC_018622	TC	3	6	1063774	1063779	0 %	50 %	0 %	50 %	407458524
22566	NC_018622	CTT	2	6	1063781	1063786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458524
22567	NC_018622	CGC	2	6	1063819	1063824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458524
22568	NC_018622	AGGT	2	8	1063837	1063844	25 %	25 %	50 %	0 %	407458524
22569	NC_018622	CCT	2	6	1063874	1063879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458525
22570	NC_018622	GTC	2	6	1063919	1063924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458525
22571	NC_018622	TC	3	6	1063923	1063928	0 %	50 %	0 %	50 %	407458525
22572	NC_018622	TGT	2	6	1063952	1063957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458525
22573	NC_018622	GAC	2	6	1064073	1064078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458525
22574	NC_018622	TGC	2	6	1064182	1064187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458525
22575	NC_018622	ACA	2	6	1064237	1064242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458525
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22577	NC_018622	CGT	2	6	1064313	1064318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458525
22578	NC_018622	AAC	2	6	1064335	1064340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458525
22579	NC_018622	CTG	2	6	1064376	1064381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458525
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22582	NC_018622	TTC	2	6	1064808	1064813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458525
22583	NC_018622	CGATA	2	10	1064928	1064937	40 %	20 %	20 %	20 %	407458525
22584	NC_018622	CTT	2	6	1065000	1065005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458525
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22586	NC_018622	ACTT	2	8	1065073	1065080	25 %	50 %	0 %	25 %	407458525
22587	NC_018622	GA	3	6	1065081	1065086	50 %	0 %	50 %	0 %	407458525
22588	NC_018622	CTT	2	6	1065093	1065098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458525
22589	NC_018622	CCTTC	2	10	1065123	1065132	0 %	40 %	0 %	60 %	407458525
22590	NC_018622	CTT	2	6	1065202	1065207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458525
22591	NC_018622	AGC	2	6	1065212	1065217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458525
22592	NC_018622	AG	3	6	1065239	1065244	50 %	0 %	50 %	0 %	407458525
22593	NC_018622	T	7	7	1065307	1065313	0 %	100 %	0 %	0 %	407458525
22594	NC_018622	AAG	2	6	1065337	1065342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458525
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22596	NC_018622	T	6	6	1065431	1065436	0 %	100 %	0 %	0 %	407458526
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22600	NC_018622	GAA	2	6	1065507	1065512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458526
22601	NC_018622	CTT	2	6	1065520	1065525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458526
22602	NC_018622	T	8	8	1065536	1065543	0 %	100 %	0 %	0 %	407458526
22603	NC_018622	TAA	2	6	1065571	1065576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458526
22604	NC_018622	CTG	2	6	1065601	1065606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458526
22605	NC_018622	TCC	2	6	1065698	1065703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458526
22606	NC_018622	GAT	2	6	1065704	1065709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458526
22607	NC_018622	TC	3	6	1065715	1065720	0 %	50 %	0 %	50 %	407458526
22608	NC_018622	TTG	2	6	1065738	1065743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458526
22609	NC_018622	TGTC	2	8	1065808	1065815	0 %	50 %	25 %	25 %	407458526
22610	NC_018622	TCT	2	6	1065945	1065950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458526
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22615	NC_018622	CTT	2	6	1066150	1066155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458526
22616	NC_018622	CTTT	2	8	1066202	1066209	0 %	75 %	0 %	25 %	407458526
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22973	NC_018622	ATA	2	6	1082533	1082538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458540
22974	NC_018622	TTC	2	6	1082577	1082582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458540
22975	NC_018622	TAA	2	6	1082585	1082590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458540
22976	NC_018622	CTA	2	6	1082612	1082617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458540
22977	NC_018622	TAC	2	6	1082622	1082627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458540
22978	NC_018622	AT	3	6	1082639	1082644	50 %	50 %	0 %	0 %	407458540
22979	NC_018622	A	6	6	1082668	1082673	100 %	0 %	0 %	0 %	407458540
22980	NC_018622	TCT	2	6	1082757	1082762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458540
22981	NC_018622	TCT	2	6	1083000	1083005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458540
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22988	NC_018622	ATT	2	6	1083310	1083315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458540
22989	NC_018622	TGA	2	6	1083341	1083346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458540
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22992	NC_018622	GA	3	6	1083520	1083525	50 %	0 %	50 %	0 %	407458540
22993	NC_018622	TTG	2	6	1083553	1083558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458540
22994	NC_018622	TCCG	2	8	1083604	1083611	0 %	25 %	25 %	50 %	407458540
22995	NC_018622	AGA	2	6	1083638	1083643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458540
22996	NC_018622	CTTTC	2	10	1083724	1083733	0 %	60 %	0 %	40 %	407458540
22997	NC_018622	GCT	2	6	1083747	1083752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458540
22998	NC_018622	CAG	2	6	1083778	1083783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458540
22999	NC_018622	CT	3	6	1083798	1083803	0 %	50 %	0 %	50 %	407458540
23000	NC_018622	AAG	2	6	1083907	1083912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458540

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