MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_018622	TA	4	8	990143	990150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21002	NC_018622	ATT	3	9	990190	990198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_018622	TGC	2	6	990247	990252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21004	NC_018622	ATC	2	6	990282	990287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21005	NC_018622	CGG	2	6	990327	990332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21006	NC_018622	GA	3	6	990504	990509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_018622	TCC	2	6	990590	990595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21008	NC_018622	TCGCTT	2	12	990683	990694	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21009	NC_018622	TAACT	2	10	990730	990739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21010	NC_018622	TCA	2	6	990747	990752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21011	NC_018622	AAG	2	6	990785	990790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21012	NC_018622	T	6	6	990991	990996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21013	NC_018622	TCT	2	6	991106	991111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21014	NC_018622	TCGC	2	8	991118	991125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21015	NC_018622	ATTT	2	8	991148	991155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_018622	CAG	2	6	991183	991188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21017	NC_018622	GAT	2	6	991229	991234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21018	NC_018622	CCA	2	6	991346	991351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21019	NC_018622	TAA	2	6	991360	991365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21020	NC_018622	ATT	2	6	991378	991383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_018622	AT	3	6	991414	991419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21022	NC_018622	TAT	3	9	991431	991439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21023	NC_018622	ATT	2	6	991462	991467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21024	NC_018622	ACATA	2	10	991469	991478	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21025	NC_018622	AAC	2	6	991505	991510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21026	NC_018622	A	7	7	991545	991551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21027	NC_018622	TTATCC	2	12	991587	991598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21033	NC_018622	GT	3	6	991916	991921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21037	NC_018622	TTC	2	6	992167	992172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21038	NC_018622	CTC	2	6	992255	992260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21039	NC_018622	GGC	2	6	992262	992267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21040	NC_018622	TTC	2	6	992430	992435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21041	NC_018622	TCCA	2	8	992480	992487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21042	NC_018622	CTTTC	2	10	992549	992558	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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21045	NC_018622	TC	3	6	992688	992693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21046	NC_018622	TCA	2	6	992732	992737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21047	NC_018622	CA	3	6	992736	992741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21048	NC_018622	TC	3	6	992844	992849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21049	NC_018622	CAA	2	6	992892	992897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21050	NC_018622	CTT	2	6	992945	992950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21051	NC_018622	ATA	2	6	993064	993069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21052	NC_018622	ATT	2	6	993079	993084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_018622	CGC	2	6	993110	993115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21054	NC_018622	A	7	7	993150	993156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21055	NC_018622	T	7	7	993198	993204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_018622	AAG	2	6	993237	993242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_018622	CGA	2	6	993250	993255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21059	NC_018622	GAA	3	9	993322	993330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21060	NC_018622	TA	3	6	993341	993346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21061	NC_018622	ATTT	2	8	993353	993360	25 %	75 %	0 %	0 %	407458460
21062	NC_018622	T	7	7	993382	993388	0 %	100 %	0 %	0 %	407458460
21063	NC_018622	T	8	8	993458	993465	0 %	100 %	0 %	0 %	407458460
21064	NC_018622	T	7	7	993468	993474	0 %	100 %	0 %	0 %	407458460
21065	NC_018622	T	6	6	993477	993482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21066	NC_018622	TAT	2	6	993575	993580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_018622	T	8	8	993583	993590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21068	NC_018622	TTAA	2	8	993626	993633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21069	NC_018622	CTTCT	2	10	993666	993675	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21070	NC_018622	TCCT	2	8	993702	993709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21071	NC_018622	AAATTT	2	12	993738	993749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21072	NC_018622	TCG	2	6	993937	993942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21076	NC_018622	TCT	2	6	994059	994064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21077	NC_018622	CTA	2	6	994117	994122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21082	NC_018622	T	6	6	994364	994369	0 %	100 %	0 %	0 %	407458461
21083	NC_018622	AGCATT	2	12	994424	994435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407458461
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21091	NC_018622	TGG	2	6	994685	994690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458462
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21099	NC_018622	TAC	2	6	995040	995045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458463
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21101	NC_018622	ATC	2	6	995136	995141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458463
21102	NC_018622	TAAG	2	8	995145	995152	50 %	25 %	25 %	0 %	407458463
21103	NC_018622	GAA	2	6	995183	995188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458463
21104	NC_018622	A	7	7	995193	995199	100 %	0 %	0 %	0 %	407458463
21105	NC_018622	A	6	6	995319	995324	100 %	0 %	0 %	0 %	407458463
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21109	NC_018622	ATT	2	6	995570	995575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458463
21110	NC_018622	ACC	2	6	995582	995587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458463
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21112	NC_018622	TTG	2	6	995670	995675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458463
21113	NC_018622	A	6	6	995681	995686	100 %	0 %	0 %	0 %	407458463
21114	NC_018622	TCT	2	6	995873	995878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458463
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21167	NC_018622	TA	3	6	998261	998266	50 %	50 %	0 %	0 %	407458466
21168	NC_018622	TCT	2	6	998290	998295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458466
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21241	NC_018622	A	6	6	1002090	1002095	100 %	0 %	0 %	0 %	407458470
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21243	NC_018622	AGT	2	6	1002443	1002448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458471
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21246	NC_018622	CTT	3	9	1002733	1002741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458472
21247	NC_018622	AAG	2	6	1002745	1002750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458472
21248	NC_018622	T	7	7	1002779	1002785	0 %	100 %	0 %	0 %	407458472
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21252	NC_018622	AT	3	6	1003110	1003115	50 %	50 %	0 %	0 %	407458472
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21360	NC_018622	AGA	2	6	1008684	1008689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458476
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21365	NC_018622	AC	3	6	1008773	1008778	50 %	0 %	0 %	50 %	407458476
21366	NC_018622	GGGAT	2	10	1008980	1008989	20 %	20 %	60 %	0 %	407458476
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21368	NC_018622	ATG	2	6	1009088	1009093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458476
21369	NC_018622	CTA	2	6	1009102	1009107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458476
21370	NC_018622	TAT	2	6	1009176	1009181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458476
21371	NC_018622	TCT	2	6	1009182	1009187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458476
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21376	NC_018622	CTG	2	6	1009479	1009484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458477
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21380	NC_018622	A	6	6	1009899	1009904	100 %	0 %	0 %	0 %	407458477
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21387	NC_018622	TTAT	2	8	1010482	1010489	25 %	75 %	0 %	0 %	407458478
21388	NC_018622	CATG	2	8	1010537	1010544	25 %	25 %	25 %	25 %	407458478
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21393	NC_018622	TTA	2	6	1010691	1010696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458478
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21489	NC_018622	AG	3	6	1014149	1014154	50 %	0 %	50 %	0 %	407458482
21490	NC_018622	TAC	2	6	1014173	1014178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458482
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21499	NC_018622	AAT	2	6	1015083	1015088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21500	NC_018622	AAT	2	6	1015107	1015112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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