MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_018622	TGA	2	6	966746	966751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458446
20503	NC_018622	GAA	2	6	966801	966806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
20504	NC_018622	CTAC	2	8	966815	966822	25 %	25 %	0 %	50 %	407458446
20505	NC_018622	GCA	2	6	966903	966908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458446
20506	NC_018622	AGC	2	6	966962	966967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458446
20507	NC_018622	TCC	2	6	966991	966996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458446
20508	NC_018622	GCT	2	6	967008	967013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458446
20509	NC_018622	TG	3	6	967027	967032	0 %	50 %	50 %	0 %	407458446
20510	NC_018622	GAG	2	6	967090	967095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458446
20511	NC_018622	CCT	2	6	967119	967124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458446
20512	NC_018622	A	6	6	967156	967161	100 %	0 %	0 %	0 %	407458446
20513	NC_018622	AGA	2	6	967178	967183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
20514	NC_018622	GAA	2	6	967184	967189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
20515	NC_018622	CAC	2	6	967217	967222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458446
20516	NC_018622	GAAA	2	8	967258	967265	75 %	0 %	25 %	0 %	407458446
20517	NC_018622	AGA	2	6	967329	967334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
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20519	NC_018622	ATC	2	6	967359	967364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458446
20520	NC_018622	GAAGG	2	10	967381	967390	40 %	0 %	60 %	0 %	407458446
20521	NC_018622	AGA	2	6	967436	967441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
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20529	NC_018622	TTTG	2	8	967995	968002	0 %	75 %	25 %	0 %	407458447
20530	NC_018622	TCC	2	6	968175	968180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458447
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20537	NC_018622	TCG	2	6	968541	968546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458447
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20539	NC_018622	AG	4	8	968570	968577	50 %	0 %	50 %	0 %	407458447
20540	NC_018622	GAAA	2	8	968589	968596	75 %	0 %	25 %	0 %	407458447
20541	NC_018622	TTC	2	6	968651	968656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458447
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20544	NC_018622	TAC	2	6	968702	968707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458447
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20551	NC_018622	CAT	2	6	969089	969094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458447
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20553	NC_018622	CCAG	2	8	969105	969112	25 %	0 %	25 %	50 %	407458447
20554	NC_018622	TC	3	6	969250	969255	0 %	50 %	0 %	50 %	407458447
20555	NC_018622	CAT	2	6	969322	969327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458447
20556	NC_018622	AGACA	2	10	969377	969386	60 %	0 %	20 %	20 %	407458447
20557	NC_018622	ATATCT	2	12	969558	969569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407458447
20558	NC_018622	ATAA	2	8	969617	969624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20559	NC_018622	GCAT	2	8	969637	969644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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20562	NC_018622	T	6	6	969733	969738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20563	NC_018622	TTCT	2	8	969760	969767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20564	NC_018622	TC	3	6	969795	969800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20565	NC_018622	T	6	6	969878	969883	0 %	100 %	0 %	0 %	407458448
20566	NC_018622	TCT	2	6	969918	969923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458448
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20594	NC_018622	TTCTG	2	10	971375	971384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20595	NC_018622	TAGT	2	8	971397	971404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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20995	NC_018622	TCC	2	6	989778	989783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20996	NC_018622	AACCT	2	10	989803	989812	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20997	NC_018622	CTA	2	6	989830	989835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20998	NC_018622	GGT	2	6	989914	989919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20999	NC_018622	CTG	2	6	990115	990120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21000	NC_018622	TAC	2	6	990123	990128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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