MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_018622	TAA	2	6	919971	919976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19502	NC_018622	TAA	2	6	919988	919993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19503	NC_018622	AT	3	6	919995	920000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19504	NC_018622	ATTA	2	8	920019	920026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19505	NC_018622	AGCGT	2	10	920070	920079	20 %	20 %	40 %	20 %	407458399
19506	NC_018622	AAC	2	6	920112	920117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458399
19507	NC_018622	TAA	2	6	920153	920158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458399
19508	NC_018622	ACA	2	6	920219	920224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458399
19509	NC_018622	ATA	2	6	920244	920249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458399
19510	NC_018622	GAA	2	6	920276	920281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458399
19511	NC_018622	CAA	2	6	920282	920287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458399
19512	NC_018622	ACA	2	6	920385	920390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458399
19513	NC_018622	T	6	6	920398	920403	0 %	100 %	0 %	0 %	407458399
19514	NC_018622	CGT	2	6	920420	920425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458399
19515	NC_018622	AGA	2	6	920544	920549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458399
19516	NC_018622	CAA	2	6	920556	920561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458399
19517	NC_018622	AACAA	2	10	920565	920574	80 %	0 %	0 %	20 %	407458399
19518	NC_018622	A	6	6	920664	920669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_018622	ACA	2	6	920676	920681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19520	NC_018622	TTA	2	6	920711	920716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19521	NC_018622	CTGC	2	8	920777	920784	0 %	25 %	25 %	50 %	407458400
19522	NC_018622	CAG	2	6	920831	920836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458400
19523	NC_018622	AAG	2	6	920867	920872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458400
19524	NC_018622	C	6	6	920946	920951	0 %	0 %	0 %	100 %	407458400
19525	NC_018622	GA	3	6	920968	920973	50 %	0 %	50 %	0 %	407458400
19526	NC_018622	CAA	2	6	921009	921014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19527	NC_018622	GTA	2	6	921033	921038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_018622	TTA	2	6	921052	921057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_018622	TAAT	2	8	921085	921092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_018622	A	8	8	921102	921109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_018622	TTC	2	6	921205	921210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458401
19532	NC_018622	TCT	2	6	921356	921361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458401
19533	NC_018622	GATGA	2	10	921418	921427	40 %	20 %	40 %	0 %	407458401
19534	NC_018622	AAT	2	6	921474	921479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458401
19535	NC_018622	TG	3	6	921487	921492	0 %	50 %	50 %	0 %	407458401
19536	NC_018622	GTG	2	6	921505	921510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458401
19537	NC_018622	AAT	2	6	921550	921555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458401
19538	NC_018622	GAAT	2	8	921563	921570	50 %	25 %	25 %	0 %	407458401
19539	NC_018622	TC	3	6	921580	921585	0 %	50 %	0 %	50 %	407458401
19540	NC_018622	TTA	2	6	921587	921592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458401
19541	NC_018622	AGA	2	6	921598	921603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458401
19542	NC_018622	ATC	2	6	921662	921667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458401
19543	NC_018622	AAG	2	6	921672	921677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458401
19544	NC_018622	ACA	2	6	921701	921706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458401
19545	NC_018622	T	6	6	921721	921726	0 %	100 %	0 %	0 %	407458401
19546	NC_018622	TG	3	6	921731	921736	0 %	50 %	50 %	0 %	407458401
19547	NC_018622	T	6	6	921795	921800	0 %	100 %	0 %	0 %	407458401
19548	NC_018622	A	6	6	921875	921880	100 %	0 %	0 %	0 %	407458401
19549	NC_018622	TCT	2	6	921890	921895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458401
19550	NC_018622	AGC	2	6	921919	921924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458401
19551	NC_018622	GCT	2	6	921962	921967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458401
19552	NC_018622	CAT	2	6	921978	921983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458401
19553	NC_018622	GGC	2	6	922066	922071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458401
19554	NC_018622	GCAA	2	8	922104	922111	50 %	0 %	25 %	25 %	407458401
19555	NC_018622	TTC	3	9	922155	922163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458401
19556	NC_018622	T	6	6	922195	922200	0 %	100 %	0 %	0 %	407458401
19557	NC_018622	TACT	2	8	922229	922236	25 %	50 %	0 %	25 %	407458401
19558	NC_018622	TGA	2	6	922264	922269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458401
19559	NC_018622	GA	3	6	922288	922293	50 %	0 %	50 %	0 %	407458401
19560	NC_018622	GAT	2	6	922309	922314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458401
19561	NC_018622	GTT	2	6	922365	922370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458401
19562	NC_018622	CGA	2	6	922469	922474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458401
19563	NC_018622	CCTC	2	8	922491	922498	0 %	25 %	0 %	75 %	407458401
19564	NC_018622	TAA	2	6	922611	922616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458401
19565	NC_018622	T	7	7	922633	922639	0 %	100 %	0 %	0 %	407458401
19566	NC_018622	GAT	2	6	922677	922682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458401
19567	NC_018622	ATA	2	6	922732	922737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458401
19568	NC_018622	T	6	6	922770	922775	0 %	100 %	0 %	0 %	407458401
19569	NC_018622	ACA	2	6	922789	922794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458401
19570	NC_018622	CTT	2	6	922814	922819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458401
19571	NC_018622	ATA	2	6	922850	922855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458401
19572	NC_018622	TTC	2	6	922885	922890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458401
19573	NC_018622	GTT	2	6	922914	922919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19574	NC_018622	AAAG	2	8	922948	922955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19575	NC_018622	CAA	2	6	922981	922986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19576	NC_018622	GAA	2	6	923015	923020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19577	NC_018622	CAG	2	6	923104	923109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19578	NC_018622	TTA	2	6	923110	923115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19579	NC_018622	ACTAG	2	10	923153	923162	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19580	NC_018622	AGA	2	6	923192	923197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19581	NC_018622	A	8	8	923209	923216	100 %	0 %	0 %	0 %	407458402
19582	NC_018622	ATG	2	6	923225	923230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458402
19583	NC_018622	ATG	3	9	923310	923318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458402
19584	NC_018622	CT	3	6	923327	923332	0 %	50 %	0 %	50 %	407458402
19585	NC_018622	AT	3	6	923407	923412	50 %	50 %	0 %	0 %	407458402
19586	NC_018622	TTGCTG	2	12	923442	923453	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407458402
19587	NC_018622	GA	3	6	923503	923508	50 %	0 %	50 %	0 %	407458402
19588	NC_018622	TTA	2	6	923520	923525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458402
19589	NC_018622	CAA	2	6	923569	923574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458402
19590	NC_018622	TATC	2	8	923583	923590	25 %	50 %	0 %	25 %	407458402
19591	NC_018622	CTA	2	6	923648	923653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458402
19592	NC_018622	A	6	6	923738	923743	100 %	0 %	0 %	0 %	407458402
19593	NC_018622	ATC	2	6	923753	923758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458402
19594	NC_018622	CAA	2	6	923768	923773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458402
19595	NC_018622	CAAT	2	8	923901	923908	50 %	25 %	0 %	25 %	407458402
19596	NC_018622	CTG	2	6	923910	923915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458402
19597	NC_018622	TTA	2	6	924122	924127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458402
19598	NC_018622	CAA	2	6	924158	924163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458402
19599	NC_018622	TAC	2	6	924168	924173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458402
19600	NC_018622	A	6	6	924220	924225	100 %	0 %	0 %	0 %	407458402
19601	NC_018622	TCTTT	2	10	924233	924242	0 %	80 %	0 %	20 %	407458402
19602	NC_018622	TAC	2	6	924280	924285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458402
19603	NC_018622	TTTAC	2	10	924398	924407	20 %	60 %	0 %	20 %	407458402
19604	NC_018622	CT	4	8	924421	924428	0 %	50 %	0 %	50 %	407458402
19605	NC_018622	CT	3	6	924437	924442	0 %	50 %	0 %	50 %	407458402
19606	NC_018622	T	6	6	924489	924494	0 %	100 %	0 %	0 %	407458402
19607	NC_018622	ATC	3	9	924501	924509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458402
19608	NC_018622	GCAA	2	8	924582	924589	50 %	0 %	25 %	25 %	407458402
19609	NC_018622	A	6	6	924599	924604	100 %	0 %	0 %	0 %	407458402
19610	NC_018622	CTA	2	6	924634	924639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458402
19611	NC_018622	TA	3	6	924638	924643	50 %	50 %	0 %	0 %	407458402
19612	NC_018622	AAGT	2	8	924645	924652	50 %	25 %	25 %	0 %	407458402
19613	NC_018622	TTA	2	6	924668	924673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458402
19614	NC_018622	CGT	2	6	924689	924694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458402
19615	NC_018622	GAT	2	6	924749	924754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458402
19616	NC_018622	TTC	2	6	924822	924827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458402
19617	NC_018622	AAC	2	6	924828	924833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458402
19618	NC_018622	TCTG	2	8	924889	924896	0 %	50 %	25 %	25 %	407458402
19619	NC_018622	GCA	2	6	924902	924907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458402
19620	NC_018622	GTC	2	6	924921	924926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458402
19621	NC_018622	CT	3	6	924946	924951	0 %	50 %	0 %	50 %	407458402
19622	NC_018622	AC	3	6	925035	925040	50 %	0 %	0 %	50 %	407458402
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19624	NC_018622	TGAT	2	8	925170	925177	25 %	50 %	25 %	0 %	407458402
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19998	NC_018622	TCT	2	6	942801	942806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458417
19999	NC_018622	CAA	2	6	942950	942955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458417
20000	NC_018622	CCA	2	6	942957	942962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458417

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