MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_018622	ATC	2	6	872999	873004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458352
18503	NC_018622	AAG	2	6	873029	873034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458352
18504	NC_018622	CTT	2	6	873040	873045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458352
18505	NC_018622	AAG	2	6	873076	873081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458352
18506	NC_018622	ATC	2	6	873168	873173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458352
18507	NC_018622	TA	4	8	873190	873197	50 %	50 %	0 %	0 %	407458352
18508	NC_018622	TCA	2	6	873456	873461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458352
18509	NC_018622	CAA	2	6	873472	873477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458352
18510	NC_018622	ACC	2	6	873482	873487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458352
18511	NC_018622	TGTACT	2	12	873510	873521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407458352
18512	NC_018622	CTT	2	6	873568	873573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458352
18513	NC_018622	AGG	2	6	873596	873601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458352
18514	NC_018622	ATAA	2	8	873657	873664	75 %	25 %	0 %	0 %	407458352
18515	NC_018622	TCC	2	6	873677	873682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18516	NC_018622	AACT	2	8	873709	873716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18517	NC_018622	TAG	2	6	873743	873748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458353
18518	NC_018622	A	7	7	873768	873774	100 %	0 %	0 %	0 %	407458353
18519	NC_018622	CT	3	6	873775	873780	0 %	50 %	0 %	50 %	407458353
18520	NC_018622	ACT	2	6	874042	874047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458353
18521	NC_018622	TGA	2	6	874069	874074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458353
18522	NC_018622	TTG	2	6	874075	874080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458353
18523	NC_018622	GTT	2	6	874120	874125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458353
18524	NC_018622	GGC	2	6	874167	874172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458353
18525	NC_018622	CTG	2	6	874177	874182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458353
18526	NC_018622	ATG	2	6	874192	874197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458353
18527	NC_018622	TGAT	2	8	874237	874244	25 %	50 %	25 %	0 %	407458353
18528	NC_018622	AC	3	6	874259	874264	50 %	0 %	0 %	50 %	407458353
18529	NC_018622	TAA	2	6	874310	874315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458353
18530	NC_018622	TGA	2	6	874345	874350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458353
18531	NC_018622	AGG	2	6	874367	874372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458353
18532	NC_018622	CTAA	2	8	874431	874438	50 %	25 %	0 %	25 %	407458353
18533	NC_018622	ATT	2	6	874466	874471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458353
18534	NC_018622	TCG	2	6	874507	874512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458353
18535	NC_018622	GAA	2	6	874539	874544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458353
18536	NC_018622	ATAG	2	8	874551	874558	50 %	25 %	25 %	0 %	407458353
18537	NC_018622	A	6	6	874593	874598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_018622	GAG	3	9	874620	874628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458354
18539	NC_018622	ATC	3	9	874712	874720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458354
18540	NC_018622	GCT	2	6	874737	874742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458354
18541	NC_018622	CAA	3	9	874868	874876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458354
18542	NC_018622	TGAG	2	8	874911	874918	25 %	25 %	50 %	0 %	407458354
18543	NC_018622	CGG	2	6	874969	874974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458354
18544	NC_018622	AGC	2	6	874982	874987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458354
18545	NC_018622	A	6	6	875039	875044	100 %	0 %	0 %	0 %	407458354
18546	NC_018622	CCA	2	6	875159	875164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458354
18547	NC_018622	AAAT	2	8	875171	875178	75 %	25 %	0 %	0 %	407458354
18548	NC_018622	GTC	2	6	875220	875225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458354
18549	NC_018622	CGG	2	6	875236	875241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458354
18550	NC_018622	CCT	2	6	875325	875330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18551	NC_018622	ATT	2	6	875366	875371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_018622	TAA	2	6	875385	875390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458355
18553	NC_018622	ATTA	2	8	875402	875409	50 %	50 %	0 %	0 %	407458355
18554	NC_018622	AATAA	2	10	875430	875439	80 %	20 %	0 %	0 %	407458355
18555	NC_018622	CCT	2	6	875445	875450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458355
18556	NC_018622	AGC	2	6	875534	875539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458355
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18558	NC_018622	T	8	8	875649	875656	0 %	100 %	0 %	0 %	407458355
18559	NC_018622	CAAAG	2	10	875720	875729	60 %	0 %	20 %	20 %	407458355
18560	NC_018622	TA	3	6	875750	875755	50 %	50 %	0 %	0 %	407458355
18561	NC_018622	AACC	2	8	875852	875859	50 %	0 %	0 %	50 %	407458355
18562	NC_018622	T	6	6	875912	875917	0 %	100 %	0 %	0 %	407458355
18563	NC_018622	GTA	3	9	875942	875950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458355
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18565	NC_018622	GGAT	2	8	875992	875999	25 %	25 %	50 %	0 %	407458355
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18569	NC_018622	AAATA	2	10	876236	876245	80 %	20 %	0 %	0 %	407458355
18570	NC_018622	TCC	2	6	876248	876253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458355
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18572	NC_018622	A	6	6	876283	876288	100 %	0 %	0 %	0 %	407458355
18573	NC_018622	AAG	2	6	876299	876304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458355
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18579	NC_018622	AAT	2	6	876527	876532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458355
18580	NC_018622	A	8	8	876563	876570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18581	NC_018622	ATCT	2	8	876671	876678	25 %	50 %	0 %	25 %	407458356
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18590	NC_018622	GCT	2	6	877011	877016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458356
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18592	NC_018622	AAGTAA	2	12	877223	877234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407458356
18593	NC_018622	ACG	2	6	877367	877372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458356
18594	NC_018622	CCG	2	6	877399	877404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458356
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18596	NC_018622	GCAA	2	8	877559	877566	50 %	0 %	25 %	25 %	407458356
18597	NC_018622	TCA	2	6	877578	877583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458356
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18601	NC_018622	CT	3	6	877929	877934	0 %	50 %	0 %	50 %	407458356
18602	NC_018622	GAT	2	6	877960	877965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458356
18603	NC_018622	CTG	2	6	878038	878043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458356
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18605	NC_018622	AGAA	2	8	878117	878124	75 %	0 %	25 %	0 %	407458356
18606	NC_018622	GAA	2	6	878126	878131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458356
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18609	NC_018622	TTAC	2	8	878211	878218	25 %	50 %	0 %	25 %	407458356
18610	NC_018622	TAA	2	6	878261	878266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458356
18611	NC_018622	GA	3	6	878527	878532	50 %	0 %	50 %	0 %	407458357
18612	NC_018622	CTT	2	6	878545	878550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458357
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