MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_018622	TTG	2	6	847825	847830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458332
18003	NC_018622	TCT	2	6	847907	847912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458332
18004	NC_018622	TTA	2	6	847928	847933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458332
18005	NC_018622	TCA	2	6	847958	847963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458332
18006	NC_018622	CAT	2	6	847974	847979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458332
18007	NC_018622	TAA	2	6	848038	848043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458332
18008	NC_018622	ATG	2	6	848158	848163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458332
18009	NC_018622	TTC	2	6	848188	848193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458332
18010	NC_018622	AAT	2	6	848210	848215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458332
18011	NC_018622	GCA	2	6	848234	848239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458332
18012	NC_018622	GGAA	2	8	848269	848276	50 %	0 %	50 %	0 %	407458332
18013	NC_018622	CTT	3	9	848301	848309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458332
18014	NC_018622	TAAGCT	2	12	848316	848327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407458332
18015	NC_018622	CT	3	6	848350	848355	0 %	50 %	0 %	50 %	407458332
18016	NC_018622	CCAT	2	8	848356	848363	25 %	25 %	0 %	50 %	407458332
18017	NC_018622	CAG	2	6	848376	848381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458332
18018	NC_018622	AAG	2	6	848404	848409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458332
18019	NC_018622	AAT	2	6	848420	848425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458332
18020	NC_018622	TCC	2	6	848434	848439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458332
18021	NC_018622	AGCA	2	8	848446	848453	50 %	0 %	25 %	25 %	407458332
18022	NC_018622	T	7	7	848460	848466	0 %	100 %	0 %	0 %	407458332
18023	NC_018622	A	9	9	848481	848489	100 %	0 %	0 %	0 %	407458332
18024	NC_018622	AT	3	6	848590	848595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_018622	GAA	2	6	848617	848622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_018622	TATGC	2	10	848637	848646	20 %	40 %	20 %	20 %	407458333
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18030	NC_018622	CCTT	2	8	848899	848906	0 %	50 %	0 %	50 %	407458333
18031	NC_018622	ATC	2	6	848931	848936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458333
18032	NC_018622	TGT	2	6	848970	848975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458333
18033	NC_018622	ATT	2	6	849065	849070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458333
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18037	NC_018622	GTT	2	6	849249	849254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458333
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18039	NC_018622	ATT	2	6	849400	849405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458333
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18043	NC_018622	TGT	2	6	849637	849642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458333
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18045	NC_018622	TCA	2	6	849809	849814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458334
18046	NC_018622	TAC	2	6	849839	849844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458334
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18050	NC_018622	TAT	2	6	850055	850060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458334
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18053	NC_018622	TTC	2	6	850211	850216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458334
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18058	NC_018622	TCT	2	6	850702	850707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458334
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18061	NC_018622	TATGCT	2	12	850800	850811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407458334
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18068	NC_018622	TAGG	2	8	851152	851159	25 %	25 %	50 %	0 %	407458335
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18089	NC_018622	TC	3	6	851996	852001	0 %	50 %	0 %	50 %	407458335
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18094	NC_018622	TCGT	2	8	852176	852183	0 %	50 %	25 %	25 %	407458335
18095	NC_018622	TGAG	2	8	852299	852306	25 %	25 %	50 %	0 %	407458335
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18104	NC_018622	TTTCA	2	10	852700	852709	20 %	60 %	0 %	20 %	407458335
18105	NC_018622	ATG	2	6	852715	852720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458335
18106	NC_018622	AT	3	6	852732	852737	50 %	50 %	0 %	0 %	407458335
18107	NC_018622	T	6	6	852788	852793	0 %	100 %	0 %	0 %	407458335
18108	NC_018622	TGC	2	6	852806	852811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458335
18109	NC_018622	A	6	6	852867	852872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_018622	ATT	2	6	852877	852882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_018622	TAT	2	6	852906	852911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_018622	AAT	2	6	852915	852920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_018622	TAA	2	6	852962	852967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_018622	A	7	7	852998	853004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18115	NC_018622	AGA	2	6	853009	853014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_018622	AGAA	2	8	853060	853067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_018622	GAA	2	6	853071	853076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_018622	TTC	2	6	853147	853152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_018622	CTG	2	6	853163	853168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458336
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18122	NC_018622	ATGT	2	8	853660	853667	25 %	50 %	25 %	0 %	407458336
18123	NC_018622	GAT	2	6	853723	853728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458336
18124	NC_018622	TTC	2	6	853760	853765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458336
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18126	NC_018622	CTT	2	6	853921	853926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458336
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18150	NC_018622	T	6	6	855584	855589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18151	NC_018622	TAA	2	6	855693	855698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18152	NC_018622	TTG	2	6	855703	855708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18230	NC_018622	GCT	2	6	859905	859910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458345
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18232	NC_018622	T	6	6	859976	859981	0 %	100 %	0 %	0 %	407458345
18233	NC_018622	ATAAAT	2	12	859996	860007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458345
18234	NC_018622	TCT	2	6	860039	860044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458345
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18240	NC_018622	ATA	2	6	860555	860560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458345
18241	NC_018622	GTTAGC	2	12	860684	860695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407458345
18242	NC_018622	CTT	2	6	860698	860703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458345
18243	NC_018622	CTG	2	6	860839	860844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458345
18244	NC_018622	AAC	2	6	860890	860895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458345
18245	NC_018622	ACA	2	6	860898	860903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458345
18246	NC_018622	TCT	2	6	861016	861021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458345
18247	NC_018622	TA	3	6	861022	861027	50 %	50 %	0 %	0 %	407458345
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18250	NC_018622	CTG	2	6	861146	861151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458345
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18252	NC_018622	TCA	2	6	861219	861224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458345
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18254	NC_018622	TCCAG	2	10	861416	861425	20 %	20 %	20 %	40 %	407458345
18255	NC_018622	AGCAT	2	10	861456	861465	40 %	20 %	20 %	20 %	407458345
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18283	NC_018622	TC	3	6	862982	862987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18284	NC_018622	A	6	6	863001	863006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18285	NC_018622	AGA	2	6	863031	863036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18286	NC_018622	TCT	2	6	863041	863046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18288	NC_018622	A	7	7	863143	863149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18289	NC_018622	T	6	6	863167	863172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18292	NC_018622	TGA	2	6	863218	863223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18311	NC_018622	TAC	2	6	863927	863932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458346
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18353	NC_018622	TA	3	6	866056	866061	50 %	50 %	0 %	0 %	407458348
18354	NC_018622	CGA	2	6	866077	866082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458348
18355	NC_018622	ATT	2	6	866105	866110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458348
18356	NC_018622	AGGC	2	8	866138	866145	25 %	0 %	50 %	25 %	407458348
18357	NC_018622	TGC	2	6	866253	866258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458348
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18361	NC_018622	GA	3	6	866410	866415	50 %	0 %	50 %	0 %	407458348
18362	NC_018622	CCT	2	6	866436	866441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458348
18363	NC_018622	GCT	2	6	866464	866469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458348
18364	NC_018622	TCC	2	6	866483	866488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458348
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18488	NC_018622	ACCTAT	2	12	871947	871958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458351
18489	NC_018622	TGAG	2	8	871984	871991	25 %	25 %	50 %	0 %	407458351
18490	NC_018622	AT	3	6	872059	872064	50 %	50 %	0 %	0 %	407458351
18491	NC_018622	TACA	2	8	872084	872091	50 %	25 %	0 %	25 %	407458351
18492	NC_018622	GCA	2	6	872248	872253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458351
18493	NC_018622	AGG	2	6	872259	872264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458351
18494	NC_018622	TTG	2	6	872276	872281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458351
18495	NC_018622	CCT	2	6	872350	872355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458351
18496	NC_018622	CTC	2	6	872369	872374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458351
18497	NC_018622	ACT	2	6	872619	872624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458352
18498	NC_018622	CAA	2	6	872659	872664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458352
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18500	NC_018622	TGC	2	6	872807	872812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458352

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