MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_018622	ACA	2	6	707820	707825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458210
15003	NC_018622	AG	3	6	707902	707907	50 %	0 %	50 %	0 %	407458210
15004	NC_018622	ATCAA	2	10	707938	707947	60 %	20 %	0 %	20 %	407458210
15005	NC_018622	A	7	7	707946	707952	100 %	0 %	0 %	0 %	407458210
15006	NC_018622	ACA	2	6	707966	707971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458210
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15010	NC_018622	TGT	2	6	708116	708121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458210
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15013	NC_018622	A	7	7	708225	708231	100 %	0 %	0 %	0 %	407458210
15014	NC_018622	TTCC	2	8	708249	708256	0 %	50 %	0 %	50 %	407458210
15015	NC_018622	ACA	2	6	708263	708268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458210
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15017	NC_018622	TAG	2	6	708337	708342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458210
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15041	NC_018622	TTTC	2	8	709277	709284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15056	NC_018622	GGA	2	6	709944	709949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458211
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15065	NC_018622	A	6	6	710129	710134	100 %	0 %	0 %	0 %	407458211
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15069	NC_018622	T	6	6	710339	710344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_018622	AG	3	6	710368	710373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15083	NC_018622	TA	3	6	710944	710949	50 %	50 %	0 %	0 %	407458212
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15106	NC_018622	CAG	2	6	711915	711920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458212
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15108	NC_018622	AG	3	6	712023	712028	50 %	0 %	50 %	0 %	407458213
15109	NC_018622	CTG	2	6	712057	712062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458213
15110	NC_018622	CG	3	6	712072	712077	0 %	0 %	50 %	50 %	407458213
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15117	NC_018622	GGC	2	6	712316	712321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458213
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15119	NC_018622	AG	3	6	712419	712424	50 %	0 %	50 %	0 %	407458213
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15246	NC_018622	AACCGC	2	12	718843	718854	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407458218
15247	NC_018622	TCA	2	6	718877	718882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458218
15248	NC_018622	ATC	2	6	718939	718944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458218
15249	NC_018622	CGT	2	6	718955	718960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458218
15250	NC_018622	CTC	2	6	718966	718971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458218
15251	NC_018622	AAAC	2	8	718977	718984	75 %	0 %	0 %	25 %	407458218
15252	NC_018622	CTT	2	6	719004	719009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458218
15253	NC_018622	TCT	2	6	719043	719048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458218
15254	NC_018622	GTT	2	6	719090	719095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458218
15255	NC_018622	CAG	2	6	719106	719111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458218
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15257	NC_018622	GAT	2	6	719148	719153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458218
15258	NC_018622	TGA	2	6	719324	719329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458219
15259	NC_018622	ATC	2	6	719344	719349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458219
15260	NC_018622	AAT	2	6	719410	719415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458219
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15262	NC_018622	AGA	2	6	719459	719464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458219
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15264	NC_018622	TTCT	2	8	719544	719551	0 %	75 %	0 %	25 %	407458219
15265	NC_018622	ATA	2	6	719572	719577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458219
15266	NC_018622	CTTT	2	8	719618	719625	0 %	75 %	0 %	25 %	407458219
15267	NC_018622	GAA	2	6	719676	719681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458219
15268	NC_018622	GCT	2	6	719687	719692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458219
15269	NC_018622	GA	3	6	719746	719751	50 %	0 %	50 %	0 %	407458219
15270	NC_018622	CTT	3	9	719769	719777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458219
15271	NC_018622	TAGA	2	8	719790	719797	50 %	25 %	25 %	0 %	407458219
15272	NC_018622	TAGC	2	8	719817	719824	25 %	25 %	25 %	25 %	407458219
15273	NC_018622	TAAA	2	8	719847	719854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15274	NC_018622	AGC	2	6	719928	719933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458220
15275	NC_018622	AGT	2	6	719954	719959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458220
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15277	NC_018622	CAA	2	6	720005	720010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458220
15278	NC_018622	A	6	6	720028	720033	100 %	0 %	0 %	0 %	407458220
15279	NC_018622	T	6	6	720035	720040	0 %	100 %	0 %	0 %	407458220
15280	NC_018622	CTC	2	6	720089	720094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458220
15281	NC_018622	GTTC	2	8	720133	720140	0 %	50 %	25 %	25 %	407458220
15282	NC_018622	ACC	2	6	720144	720149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458220
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15288	NC_018622	A	6	6	720405	720410	100 %	0 %	0 %	0 %	407458221
15289	NC_018622	GTC	2	6	720411	720416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458221
15290	NC_018622	TATTTT	2	12	720449	720460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407458221
15291	NC_018622	T	6	6	720457	720462	0 %	100 %	0 %	0 %	407458221
15292	NC_018622	CTG	2	6	720642	720647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458221
15293	NC_018622	TCTA	2	8	720714	720721	25 %	50 %	0 %	25 %	407458221
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15298	NC_018622	CTG	2	6	721070	721075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458221
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15302	NC_018622	TAC	2	6	721146	721151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458221
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15305	NC_018622	CAT	2	6	721193	721198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458221
15306	NC_018622	TGGAT	2	10	721241	721250	20 %	40 %	40 %	0 %	407458221
15307	NC_018622	CT	3	6	721262	721267	0 %	50 %	0 %	50 %	407458221
15308	NC_018622	CCCT	2	8	721274	721281	0 %	25 %	0 %	75 %	407458221
15309	NC_018622	AAAG	2	8	721324	721331	75 %	0 %	25 %	0 %	407458221
15310	NC_018622	A	6	6	721356	721361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15311	NC_018622	ACG	2	6	721404	721409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458222
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15313	NC_018622	CAG	2	6	721511	721516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458222
15314	NC_018622	TCGC	2	8	721560	721567	0 %	25 %	25 %	50 %	407458222
15315	NC_018622	ACTGT	2	10	721585	721594	20 %	40 %	20 %	20 %	407458222
15316	NC_018622	AAT	2	6	721612	721617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458222
15317	NC_018622	AT	3	6	721621	721626	50 %	50 %	0 %	0 %	407458222
15318	NC_018622	GAG	2	6	721637	721642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458222
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15320	NC_018622	TTG	2	6	721692	721697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458222
15321	NC_018622	TCC	2	6	721727	721732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15322	NC_018622	TC	3	6	721760	721765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15323	NC_018622	A	6	6	721780	721785	100 %	0 %	0 %	0 %	407458223
15324	NC_018622	CAT	2	6	721798	721803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458223
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15326	NC_018622	TC	3	6	721897	721902	0 %	50 %	0 %	50 %	407458223
15327	NC_018622	GAG	2	6	721905	721910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458223
15328	NC_018622	AGAA	2	8	721915	721922	75 %	0 %	25 %	0 %	407458223
15329	NC_018622	T	7	7	721935	721941	0 %	100 %	0 %	0 %	407458223
15330	NC_018622	CCA	2	6	721988	721993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458223
15331	NC_018622	CAT	2	6	722002	722007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458223
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15333	NC_018622	CTT	2	6	722095	722100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458223
15334	NC_018622	TTC	2	6	722107	722112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458223
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15336	NC_018622	T	6	6	722142	722147	0 %	100 %	0 %	0 %	407458223
15337	NC_018622	TC	3	6	722227	722232	0 %	50 %	0 %	50 %	407458223
15338	NC_018622	ATA	2	6	722280	722285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458223
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15341	NC_018622	CATG	2	8	722417	722424	25 %	25 %	25 %	25 %	407458223
15342	NC_018622	TTC	2	6	722449	722454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458223
15343	NC_018622	TCA	2	6	722465	722470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458223
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15345	NC_018622	ATCA	2	8	722491	722498	50 %	25 %	0 %	25 %	407458223
15346	NC_018622	CTG	2	6	722625	722630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458223
15347	NC_018622	CTTT	2	8	722664	722671	0 %	75 %	0 %	25 %	407458223
15348	NC_018622	AGT	2	6	722798	722803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458223
15349	NC_018622	TTC	2	6	722812	722817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458223
15350	NC_018622	TTG	2	6	722836	722841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458223
15351	NC_018622	CTT	2	6	722865	722870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458223
15352	NC_018622	CAA	2	6	722938	722943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458223
15353	NC_018622	TTC	2	6	722980	722985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458223
15354	NC_018622	GAA	2	6	723011	723016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458223
15355	NC_018622	A	6	6	723015	723020	100 %	0 %	0 %	0 %	407458223
15356	NC_018622	ATC	2	6	723050	723055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458223
15357	NC_018622	AAT	2	6	723074	723079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_018622	A	8	8	723117	723124	100 %	0 %	0 %	0 %	407458224
15359	NC_018622	GA	3	6	723139	723144	50 %	0 %	50 %	0 %	407458224
15360	NC_018622	CA	4	8	723161	723168	50 %	0 %	0 %	50 %	407458224
15361	NC_018622	CCA	2	6	723305	723310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458224
15362	NC_018622	TCA	2	6	723361	723366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458224
15363	NC_018622	AAAG	2	8	723367	723374	75 %	0 %	25 %	0 %	407458224
15364	NC_018622	AGG	2	6	723378	723383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458224
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15491	NC_018622	CTG	2	6	729622	729627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458229
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