MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_018622	GTA	2	6	684056	684061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_018622	GA	4	8	684186	684193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_018622	TAA	2	6	684279	684284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458188
14504	NC_018622	CAAG	2	8	684311	684318	50 %	0 %	25 %	25 %	407458188
14505	NC_018622	CCAA	2	8	684320	684327	50 %	0 %	0 %	50 %	407458188
14506	NC_018622	AAC	2	6	684343	684348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458188
14507	NC_018622	CCA	2	6	684368	684373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458188
14508	NC_018622	AGC	2	6	684378	684383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458188
14509	NC_018622	TGCTAC	2	12	684406	684417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407458188
14510	NC_018622	CTA	2	6	684423	684428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458188
14511	NC_018622	TGC	2	6	684430	684435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458188
14512	NC_018622	TTA	2	6	684476	684481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458188
14513	NC_018622	AGC	2	6	684529	684534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458188
14514	NC_018622	TA	3	6	684616	684621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_018622	AGA	2	6	684694	684699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_018622	GA	3	6	684716	684721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_018622	TATT	2	8	684755	684762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_018622	A	8	8	684793	684800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_018622	CAA	2	6	684835	684840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_018622	TAGC	2	8	684964	684971	25 %	25 %	25 %	25 %	407458189
14521	NC_018622	CAC	2	6	685007	685012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458189
14522	NC_018622	GCT	3	9	685036	685044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458189
14523	NC_018622	AAG	2	6	685083	685088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458189
14524	NC_018622	TCA	2	6	685103	685108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458189
14525	NC_018622	GTT	2	6	685202	685207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458189
14526	NC_018622	ATA	2	6	685216	685221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458189
14527	NC_018622	A	6	6	685268	685273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_018622	ATA	2	6	685286	685291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_018622	A	6	6	685291	685296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_018622	TAT	2	6	685299	685304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_018622	AAG	2	6	685333	685338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458190
14532	NC_018622	GAGT	2	8	685456	685463	25 %	25 %	50 %	0 %	407458190
14533	NC_018622	CGAT	2	8	685582	685589	25 %	25 %	25 %	25 %	407458190
14534	NC_018622	AGC	2	6	685616	685621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458190
14535	NC_018622	CT	3	6	685663	685668	0 %	50 %	0 %	50 %	407458190
14536	NC_018622	ATT	2	6	685674	685679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458190
14537	NC_018622	AGC	2	6	685754	685759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_018622	TAA	2	6	685773	685778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_018622	TA	3	6	685796	685801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_018622	ATTAAT	2	12	685806	685817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_018622	T	7	7	685861	685867	0 %	100 %	0 %	0 %	407458191
14542	NC_018622	CTT	2	6	685895	685900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458191
14543	NC_018622	A	6	6	685947	685952	100 %	0 %	0 %	0 %	407458191
14544	NC_018622	GCTCT	2	10	686042	686051	0 %	40 %	20 %	40 %	407458191
14545	NC_018622	ACG	2	6	686108	686113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458191
14546	NC_018622	T	6	6	686148	686153	0 %	100 %	0 %	0 %	407458191
14547	NC_018622	AAG	2	6	686294	686299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458191
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14549	NC_018622	TTG	2	6	686417	686422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458191
14550	NC_018622	GCAAA	2	10	686428	686437	60 %	0 %	20 %	20 %	407458191
14551	NC_018622	TAA	2	6	686449	686454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458191
14552	NC_018622	TCA	2	6	686496	686501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458191
14553	NC_018622	AAT	2	6	686518	686523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458191
14554	NC_018622	TCC	2	6	686543	686548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458191
14555	NC_018622	GTT	2	6	686553	686558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458191
14556	NC_018622	AGA	2	6	686660	686665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458191
14557	NC_018622	AGAAA	2	10	686709	686718	80 %	0 %	20 %	0 %	407458191
14558	NC_018622	CATTT	2	10	686732	686741	20 %	60 %	0 %	20 %	407458191
14559	NC_018622	CTT	2	6	686761	686766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458191
14560	NC_018622	TA	3	6	686864	686869	50 %	50 %	0 %	0 %	407458191
14561	NC_018622	GAA	2	6	686980	686985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458191
14562	NC_018622	CAT	3	9	686992	687000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458191
14563	NC_018622	T	6	6	687035	687040	0 %	100 %	0 %	0 %	407458191
14564	NC_018622	TCT	2	6	687054	687059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458191
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14566	NC_018622	A	6	6	687140	687145	100 %	0 %	0 %	0 %	407458191
14567	NC_018622	TTTC	2	8	687155	687162	0 %	75 %	0 %	25 %	407458191
14568	NC_018622	TGA	2	6	687168	687173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458191
14569	NC_018622	CA	3	6	687196	687201	50 %	0 %	0 %	50 %	407458191
14570	NC_018622	AACA	2	8	687308	687315	75 %	0 %	0 %	25 %	407458191
14571	NC_018622	CAT	2	6	687341	687346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458191
14572	NC_018622	TC	3	6	687408	687413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14573	NC_018622	TTTA	2	8	687426	687433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_018622	AGAT	2	8	687451	687458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_018622	TCA	2	6	687489	687494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_018622	AT	3	6	687535	687540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_018622	CTCC	2	8	687732	687739	0 %	25 %	0 %	75 %	407458192
14578	NC_018622	ACA	2	6	687758	687763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458192
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14580	NC_018622	TCA	2	6	687791	687796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458192
14581	NC_018622	CAA	2	6	687798	687803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458192
14582	NC_018622	TG	3	6	687823	687828	0 %	50 %	50 %	0 %	407458192
14583	NC_018622	TAAA	2	8	687858	687865	75 %	25 %	0 %	0 %	407458192
14584	NC_018622	GTT	2	6	687867	687872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458192
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14588	NC_018622	TTAGTG	2	12	687963	687974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407458192
14589	NC_018622	TAC	2	6	688075	688080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458192
14590	NC_018622	GTCTT	2	10	688098	688107	0 %	60 %	20 %	20 %	407458192
14591	NC_018622	CAG	2	6	688125	688130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458192
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14593	NC_018622	CTC	2	6	688216	688221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458192
14594	NC_018622	GCG	2	6	688230	688235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458192
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14596	NC_018622	GTG	2	6	688350	688355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458192
14597	NC_018622	TAA	2	6	688407	688412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458192
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14602	NC_018622	A	8	8	688617	688624	100 %	0 %	0 %	0 %	407458192
14603	NC_018622	CAG	2	6	688671	688676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458192
14604	NC_018622	ACAG	2	8	688726	688733	50 %	0 %	25 %	25 %	407458192
14605	NC_018622	TGT	2	6	688744	688749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458192
14606	NC_018622	CTT	2	6	688779	688784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458192
14607	NC_018622	CTAA	2	8	688805	688812	50 %	25 %	0 %	25 %	407458192
14608	NC_018622	G	14	14	688838	688851	0 %	0 %	100 %	0 %	407458192
14609	NC_018622	A	6	6	688876	688881	100 %	0 %	0 %	0 %	407458192
14610	NC_018622	CCT	2	6	688995	689000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458192
14611	NC_018622	CCT	2	6	689047	689052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458192
14612	NC_018622	AAC	2	6	689100	689105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_018622	CT	3	6	689188	689193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14614	NC_018622	AAC	2	6	689449	689454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458193
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14618	NC_018622	CTC	2	6	689624	689629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458193
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14620	NC_018622	TCT	2	6	689719	689724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458193
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14622	NC_018622	CTT	2	6	689897	689902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458193
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14624	NC_018622	CTG	2	6	689912	689917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458193
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