MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018622	ATC	2	6	658938	658943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458171
14002	NC_018622	T	6	6	658997	659002	0 %	100 %	0 %	0 %	407458171
14003	NC_018622	CCT	2	6	659019	659024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458171
14004	NC_018622	AAG	2	6	659050	659055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458171
14005	NC_018622	ACT	2	6	659071	659076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458171
14006	NC_018622	TTC	2	6	659091	659096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458171
14007	NC_018622	A	7	7	659271	659277	100 %	0 %	0 %	0 %	407458172
14008	NC_018622	ACA	2	6	659320	659325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458172
14009	NC_018622	TTCC	2	8	659347	659354	0 %	50 %	0 %	50 %	407458172
14010	NC_018622	TCT	2	6	659384	659389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458172
14011	NC_018622	A	6	6	659422	659427	100 %	0 %	0 %	0 %	407458172
14012	NC_018622	GAAA	2	8	659444	659451	75 %	0 %	25 %	0 %	407458172
14013	NC_018622	ACA	2	6	659532	659537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458172
14014	NC_018622	AACAA	2	10	659547	659556	80 %	0 %	0 %	20 %	407458172
14015	NC_018622	G	6	6	659647	659652	0 %	0 %	100 %	0 %	407458172
14016	NC_018622	TGA	2	6	659712	659717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458172
14017	NC_018622	CAA	2	6	659720	659725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458172
14018	NC_018622	CAT	2	6	659788	659793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458172
14019	NC_018622	TGT	2	6	659801	659806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458172
14020	NC_018622	TGA	2	6	659844	659849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458172
14021	NC_018622	ATT	2	6	659857	659862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458172
14022	NC_018622	TCT	2	6	659908	659913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458172
14023	NC_018622	TCT	2	6	659937	659942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458172
14024	NC_018622	ACA	2	6	660034	660039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458172
14025	NC_018622	A	6	6	660061	660066	100 %	0 %	0 %	0 %	407458173
14026	NC_018622	TCCATT	2	12	660071	660082	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407458173
14027	NC_018622	A	6	6	660122	660127	100 %	0 %	0 %	0 %	407458173
14028	NC_018622	TCT	2	6	660170	660175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458173
14029	NC_018622	AAC	2	6	660366	660371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458173
14030	NC_018622	A	6	6	660378	660383	100 %	0 %	0 %	0 %	407458173
14031	NC_018622	AAC	2	6	660462	660467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458173
14032	NC_018622	CGA	2	6	660517	660522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458173
14033	NC_018622	ATCA	2	8	660549	660556	50 %	25 %	0 %	25 %	407458173
14034	NC_018622	CAG	2	6	660630	660635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458173
14035	NC_018622	A	6	6	660702	660707	100 %	0 %	0 %	0 %	407458173
14036	NC_018622	A	7	7	660728	660734	100 %	0 %	0 %	0 %	407458173
14037	NC_018622	AGA	2	6	660772	660777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458173
14038	NC_018622	CAC	2	6	660788	660793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458173
14039	NC_018622	CAAA	2	8	660831	660838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14040	NC_018622	A	6	6	660836	660841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_018622	GTA	2	6	660873	660878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_018622	CAA	2	6	660947	660952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_018622	ACC	2	6	660980	660985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14044	NC_018622	GAA	2	6	661060	661065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_018622	CCG	2	6	661092	661097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14046	NC_018622	CAT	2	6	661109	661114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_018622	ACG	2	6	661154	661159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458174
14048	NC_018622	CTAC	2	8	661221	661228	25 %	25 %	0 %	50 %	407458174
14049	NC_018622	ATTA	2	8	661347	661354	50 %	50 %	0 %	0 %	407458174
14050	NC_018622	GAT	2	6	661375	661380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458174
14051	NC_018622	CGA	2	6	661446	661451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458174
14052	NC_018622	TTAA	2	8	661459	661466	50 %	50 %	0 %	0 %	407458174
14053	NC_018622	A	8	8	661545	661552	100 %	0 %	0 %	0 %	407458174
14054	NC_018622	AG	3	6	661558	661563	50 %	0 %	50 %	0 %	407458174
14055	NC_018622	A	6	6	661607	661612	100 %	0 %	0 %	0 %	407458174
14056	NC_018622	TGC	2	6	661641	661646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458174
14057	NC_018622	ATT	2	6	661671	661676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458174
14058	NC_018622	TAA	2	6	661742	661747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458174
14059	NC_018622	GAA	2	6	661759	661764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458174
14060	NC_018622	AGA	2	6	661824	661829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458174
14061	NC_018622	A	6	6	661919	661924	100 %	0 %	0 %	0 %	407458175
14062	NC_018622	TAT	2	6	662053	662058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458175
14063	NC_018622	TACT	2	8	662112	662119	25 %	50 %	0 %	25 %	407458175
14064	NC_018622	CTGG	2	8	662170	662177	0 %	25 %	50 %	25 %	407458175
14065	NC_018622	ATT	2	6	662207	662212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458175
14066	NC_018622	T	6	6	662243	662248	0 %	100 %	0 %	0 %	407458175
14067	NC_018622	G	6	6	662348	662353	0 %	0 %	100 %	0 %	407458175
14068	NC_018622	AGT	2	6	662365	662370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458175
14069	NC_018622	TCCT	2	8	662432	662439	0 %	50 %	0 %	50 %	407458175
14070	NC_018622	TTA	2	6	662510	662515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458175
14071	NC_018622	GCA	2	6	662570	662575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458175
14072	NC_018622	CACC	2	8	662630	662637	25 %	0 %	0 %	75 %	407458175
14073	NC_018622	A	6	6	662705	662710	100 %	0 %	0 %	0 %	407458175
14074	NC_018622	ATC	2	6	662720	662725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458175
14075	NC_018622	TGA	2	6	662727	662732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458175
14076	NC_018622	TTG	2	6	662745	662750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458175
14077	NC_018622	CTA	2	6	662771	662776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458175
14078	NC_018622	CAG	2	6	662793	662798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458175
14079	NC_018622	ATTT	2	8	662884	662891	25 %	75 %	0 %	0 %	407458175
14080	NC_018622	TTA	2	6	662904	662909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458175
14081	NC_018622	CGT	2	6	662916	662921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458175
14082	NC_018622	TCAA	2	8	662925	662932	50 %	25 %	0 %	25 %	407458175
14083	NC_018622	GGA	2	6	663164	663169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458175
14084	NC_018622	CTCA	2	8	663170	663177	25 %	25 %	0 %	50 %	407458175
14085	NC_018622	TGG	2	6	663236	663241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458175
14086	NC_018622	GGTA	2	8	663283	663290	25 %	25 %	50 %	0 %	407458175
14087	NC_018622	TGG	2	6	663302	663307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458175
14088	NC_018622	AAG	2	6	663367	663372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_018622	ACG	2	6	663451	663456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458176
14090	NC_018622	CTC	2	6	663472	663477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458176
14091	NC_018622	CAA	2	6	663517	663522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458176
14092	NC_018622	GCTC	2	8	663736	663743	0 %	25 %	25 %	50 %	407458176
14093	NC_018622	TAA	2	6	663755	663760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458176
14094	NC_018622	AAT	2	6	663777	663782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458176
14095	NC_018622	GAA	2	6	663801	663806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458176
14096	NC_018622	GGA	2	6	663831	663836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458176
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14098	NC_018622	CAT	2	6	663866	663871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458176
14099	NC_018622	GAA	2	6	663876	663881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458176
14100	NC_018622	ATT	2	6	663936	663941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458176
14101	NC_018622	CAT	2	6	663996	664001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458176
14102	NC_018622	ACCTT	2	10	664066	664075	20 %	40 %	0 %	40 %	407458176
14103	NC_018622	CAA	2	6	664090	664095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458176
14104	NC_018622	TCC	2	6	664104	664109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458176
14105	NC_018622	ATT	2	6	664110	664115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458176
14106	NC_018622	GAA	2	6	664245	664250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458176
14107	NC_018622	ATT	2	6	664341	664346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458176
14108	NC_018622	AAC	2	6	664386	664391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458176
14109	NC_018622	TCT	2	6	664437	664442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458176
14110	NC_018622	AAC	2	6	664495	664500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458176
14111	NC_018622	ACC	2	6	664582	664587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458176
14112	NC_018622	GAA	2	6	664589	664594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458176
14113	NC_018622	T	6	6	664631	664636	0 %	100 %	0 %	0 %	407458176
14114	NC_018622	ATA	2	6	664675	664680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458176
14115	NC_018622	GGC	2	6	664783	664788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458176
14116	NC_018622	CAA	2	6	664819	664824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458176
14117	NC_018622	AGA	2	6	664861	664866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458176
14118	NC_018622	TTA	2	6	664894	664899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458176
14119	NC_018622	AGA	2	6	664931	664936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458176
14120	NC_018622	T	6	6	664946	664951	0 %	100 %	0 %	0 %	407458176
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14122	NC_018622	CTC	3	9	665013	665021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458176
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14475	NC_018622	TCT	2	6	683088	683093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14476	NC_018622	AAGGGA	2	12	683117	683128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14477	NC_018622	AAG	2	6	683153	683158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14478	NC_018622	CTT	2	6	683185	683190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14480	NC_018622	TG	3	6	683223	683228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14483	NC_018622	AGTT	2	8	683251	683258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14484	NC_018622	CTT	2	6	683342	683347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458187
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14489	NC_018622	GCTCT	2	10	683585	683594	0 %	40 %	20 %	40 %	407458187
14490	NC_018622	CT	3	6	683682	683687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14491	NC_018622	TA	3	6	683721	683726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14492	NC_018622	CT	3	6	683756	683761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14493	NC_018622	GAAA	2	8	683779	683786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_018622	ATC	2	6	683824	683829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14495	NC_018622	A	6	6	683836	683841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14496	NC_018622	AG	3	6	683865	683870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14497	NC_018622	T	6	6	683874	683879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14498	NC_018622	A	6	6	683888	683893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_018622	ATTT	2	8	683961	683968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_018622	AGA	2	6	684033	684038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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