MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_018622	AATT	2	8	635591	635598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_018622	ACA	2	6	635604	635609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_018622	TAAT	2	8	635615	635622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_018622	TTA	2	6	635641	635646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_018622	TAG	2	6	635653	635658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_018622	TTA	2	6	635669	635674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_018622	TAT	2	6	635697	635702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_018622	GAT	2	6	635837	635842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_018622	A	6	6	635843	635848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_018622	AAAAC	2	10	635890	635899	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13511	NC_018622	ACT	2	6	635935	635940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_018622	ACA	2	6	636028	636033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_018622	GTC	2	6	636124	636129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_018622	AGC	2	6	636147	636152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458146
13515	NC_018622	TGC	2	6	636186	636191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458146
13516	NC_018622	ACT	2	6	636241	636246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458146
13517	NC_018622	AAG	2	6	636290	636295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458146
13518	NC_018622	ATT	2	6	636298	636303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_018622	AGC	2	6	636310	636315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_018622	A	6	6	636356	636361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_018622	ATT	2	6	636404	636409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_018622	TGT	2	6	636491	636496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_018622	ACTA	2	8	636546	636553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13524	NC_018622	TAC	2	6	636711	636716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_018622	TCT	2	6	636741	636746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_018622	ATA	2	6	636767	636772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_018622	TTC	2	6	636805	636810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458147
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13529	NC_018622	TTA	2	6	636871	636876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458147
13530	NC_018622	TAAT	2	8	636977	636984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_018622	ACA	3	9	637001	637009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_018622	CTTC	2	8	637051	637058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13533	NC_018622	A	8	8	637104	637111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_018622	TTTA	2	8	637124	637131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_018622	GATT	2	8	637203	637210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_018622	ACT	2	6	637325	637330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_018622	TAG	2	6	637331	637336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_018622	TAG	2	6	637393	637398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_018622	GTTTT	2	10	637415	637424	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_018622	ACC	2	6	637444	637449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13541	NC_018622	TCC	2	6	637474	637479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13542	NC_018622	TAA	2	6	637529	637534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_018622	CAA	2	6	637556	637561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_018622	TTAA	2	8	637580	637587	50 %	50 %	0 %	0 %	407458148
13545	NC_018622	AC	3	6	637596	637601	50 %	0 %	0 %	50 %	407458148
13546	NC_018622	CCTA	2	8	637635	637642	25 %	25 %	0 %	50 %	407458148
13547	NC_018622	ATT	2	6	637682	637687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458148
13548	NC_018622	CTTCT	2	10	637878	637887	0 %	60 %	0 %	40 %	407458148
13549	NC_018622	TACT	2	8	637932	637939	25 %	50 %	0 %	25 %	407458148
13550	NC_018622	TGG	2	6	637963	637968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458148
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13552	NC_018622	TTAG	2	8	638098	638105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_018622	AAC	2	6	638149	638154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_018622	AGA	2	6	638164	638169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_018622	CTTC	2	8	638185	638192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13556	NC_018622	TCC	2	6	638229	638234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13557	NC_018622	AAG	2	6	638294	638299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_018622	TC	3	6	638304	638309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_018622	AAC	2	6	638338	638343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_018622	TCC	2	6	638382	638387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13561	NC_018622	ATT	2	6	638396	638401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_018622	TCT	2	6	638468	638473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_018622	TCGC	2	8	638480	638487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13564	NC_018622	T	6	6	638579	638584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_018622	TTTTTA	2	12	638619	638630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_018622	AAT	2	6	638694	638699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458149
13567	NC_018622	TGT	2	6	638721	638726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458149
13568	NC_018622	T	7	7	638740	638746	0 %	100 %	0 %	0 %	407458149
13569	NC_018622	AAAGT	2	10	638915	638924	60 %	20 %	20 %	0 %	407458149
13570	NC_018622	TAA	2	6	638951	638956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458149
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13572	NC_018622	TAC	2	6	639015	639020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458149
13573	NC_018622	CTT	2	6	639071	639076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458149
13574	NC_018622	CCTA	2	8	639122	639129	25 %	25 %	0 %	50 %	407458149
13575	NC_018622	TCT	2	6	639184	639189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458149
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13577	NC_018622	TG	3	6	639284	639289	0 %	50 %	50 %	0 %	407458149
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13582	NC_018622	GTA	2	6	639637	639642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458151
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13584	NC_018622	CTT	2	6	639685	639690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458151
13585	NC_018622	CGC	2	6	639714	639719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458151
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13590	NC_018622	CATC	2	8	639854	639861	25 %	25 %	0 %	50 %	407458151
13591	NC_018622	TGA	2	6	639873	639878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458151
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13593	NC_018622	CAG	2	6	640013	640018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458151
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13604	NC_018622	CAAA	2	8	640596	640603	75 %	0 %	0 %	25 %	407458151
13605	NC_018622	T	6	6	640624	640629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_018622	T	6	6	640631	640636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_018622	ATT	2	6	640640	640645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_018622	TTTA	2	8	640707	640714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_018622	AAT	2	6	640716	640721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_018622	A	6	6	640762	640767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_018622	ACA	2	6	640805	640810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_018622	AAC	2	6	640811	640816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_018622	TAA	2	6	640845	640850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_018622	T	6	6	640861	640866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_018622	ATA	2	6	640881	640886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_018622	TCT	2	6	640893	640898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_018622	AGAT	2	8	640930	640937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13619	NC_018622	TAA	2	6	640961	640966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_018622	TCA	2	6	640981	640986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13622	NC_018622	ATTTCT	2	12	641161	641172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13623	NC_018622	TA	3	6	641197	641202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_018622	CTT	2	6	641207	641212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13625	NC_018622	TTC	2	6	641216	641221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13626	NC_018622	TTTC	2	8	641248	641255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13627	NC_018622	CAA	2	6	641267	641272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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