MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_018622	AGG	2	6	566334	566339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458083
12003	NC_018622	CTG	2	6	566462	566467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458083
12004	NC_018622	TCT	2	6	566579	566584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458083
12005	NC_018622	TGA	2	6	566586	566591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458083
12006	NC_018622	GAT	2	6	566610	566615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458083
12007	NC_018622	AG	3	6	566647	566652	50 %	0 %	50 %	0 %	407458083
12008	NC_018622	GCA	2	6	566653	566658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458083
12009	NC_018622	AAG	2	6	566659	566664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458083
12010	NC_018622	GGA	2	6	566788	566793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458083
12011	NC_018622	CGT	2	6	566815	566820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458083
12012	NC_018622	CAT	2	6	566910	566915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458083
12013	NC_018622	TAATTT	2	12	566946	566957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458083
12014	NC_018622	TATCAT	2	12	566979	566990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407458083
12015	NC_018622	TTC	2	6	567040	567045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458083
12016	NC_018622	AATG	2	8	567073	567080	50 %	25 %	25 %	0 %	407458083
12017	NC_018622	TA	3	6	567085	567090	50 %	50 %	0 %	0 %	407458083
12018	NC_018622	CCT	2	6	567097	567102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458083
12019	NC_018622	A	6	6	567121	567126	100 %	0 %	0 %	0 %	407458083
12020	NC_018622	GATG	2	8	567156	567163	25 %	25 %	50 %	0 %	407458083
12021	NC_018622	A	6	6	567298	567303	100 %	0 %	0 %	0 %	407458083
12022	NC_018622	TAT	2	6	567361	567366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458083
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12032	NC_018622	GAA	2	6	567811	567816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458083
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12038	NC_018622	ATT	2	6	567985	567990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458084
12039	NC_018622	GA	3	6	568142	568147	50 %	0 %	50 %	0 %	407458084
12040	NC_018622	TTAT	2	8	568151	568158	25 %	75 %	0 %	0 %	407458084
12041	NC_018622	GCT	2	6	568252	568257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458084
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12043	NC_018622	TGT	2	6	568368	568373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458084
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12049	NC_018622	CTAC	2	8	568592	568599	25 %	25 %	0 %	50 %	407458084
12050	NC_018622	AGA	2	6	568644	568649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458084
12051	NC_018622	GTT	2	6	568807	568812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458084
12052	NC_018622	AAG	2	6	568822	568827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458084
12053	NC_018622	TCA	2	6	568834	568839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458084
12054	NC_018622	GTT	2	6	568843	568848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458084
12055	NC_018622	AGA	2	6	568990	568995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458084
12056	NC_018622	TAAA	2	8	569009	569016	75 %	25 %	0 %	0 %	407458084
12057	NC_018622	GAT	2	6	569071	569076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458084
12058	NC_018622	ATTG	2	8	569127	569134	25 %	50 %	25 %	0 %	407458084
12059	NC_018622	TAAA	2	8	569243	569250	75 %	25 %	0 %	0 %	407458084
12060	NC_018622	TAC	2	6	569257	569262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458084
12061	NC_018622	TGA	2	6	569277	569282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458084
12062	NC_018622	CTC	2	6	569342	569347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458084
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12064	NC_018622	GGT	2	6	569488	569493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458084
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12088	NC_018622	A	9	9	570773	570781	100 %	0 %	0 %	0 %	407458085
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12102	NC_018622	CATA	2	8	571481	571488	50 %	25 %	0 %	25 %	407458086
12103	NC_018622	CAGATA	2	12	571600	571611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407458086
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12105	NC_018622	AGAT	2	8	571670	571677	50 %	25 %	25 %	0 %	407458086
12106	NC_018622	CTTT	2	8	571683	571690	0 %	75 %	0 %	25 %	407458086
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12111	NC_018622	ACA	2	6	571936	571941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458087
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12121	NC_018622	GTT	2	6	572414	572419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458087
12122	NC_018622	ATA	3	9	572524	572532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458087
12123	NC_018622	ATC	2	6	572535	572540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458087
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12126	NC_018622	GATT	2	8	572656	572663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_018622	TTC	2	6	572718	572723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458088
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12229	NC_018622	TTAG	2	8	577403	577410	25 %	50 %	25 %	0 %	407458093
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12232	NC_018622	TGA	2	6	577469	577474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458093
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12235	NC_018622	A	7	7	577613	577619	100 %	0 %	0 %	0 %	407458093
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12241	NC_018622	GCCA	2	8	577925	577932	25 %	0 %	25 %	50 %	407458093
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12365	NC_018622	TAA	3	9	583853	583861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458100
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12368	NC_018622	TCC	2	6	583982	583987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458100
12369	NC_018622	CAAT	2	8	584011	584018	50 %	25 %	0 %	25 %	407458100
12370	NC_018622	ACTT	2	8	584027	584034	25 %	50 %	0 %	25 %	407458100
12371	NC_018622	CAA	2	6	584060	584065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458100
12372	NC_018622	TA	4	8	584068	584075	50 %	50 %	0 %	0 %	407458100
12373	NC_018622	TA	3	6	584145	584150	50 %	50 %	0 %	0 %	407458100
12374	NC_018622	CTCA	2	8	584174	584181	25 %	25 %	0 %	50 %	407458100
12375	NC_018622	T	6	6	584266	584271	0 %	100 %	0 %	0 %	407458100
12376	NC_018622	ATT	2	6	584342	584347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458100
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12379	NC_018622	AGC	2	6	584454	584459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458100
12380	NC_018622	CTAT	2	8	584464	584471	25 %	50 %	0 %	25 %	407458100
12381	NC_018622	GGA	2	6	584478	584483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458100
12382	NC_018622	GAT	2	6	584681	584686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458101
12383	NC_018622	TAA	2	6	584725	584730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458101
12384	NC_018622	GAT	2	6	584831	584836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458101
12385	NC_018622	ACT	2	6	585036	585041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458101
12386	NC_018622	A	7	7	585044	585050	100 %	0 %	0 %	0 %	407458101
12387	NC_018622	ACT	2	6	585177	585182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458101
12388	NC_018622	ATG	2	6	585276	585281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458101
12389	NC_018622	ATTT	2	8	585288	585295	25 %	75 %	0 %	0 %	407458101
12390	NC_018622	CAG	2	6	585336	585341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458101
12391	NC_018622	GCA	2	6	585497	585502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458101
12392	NC_018622	GAG	2	6	585512	585517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458101
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12394	NC_018622	A	10	10	585605	585614	100 %	0 %	0 %	0 %	407458102
12395	NC_018622	CTT	2	6	585761	585766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458103
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12397	NC_018622	CAA	2	6	585843	585848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458103
12398	NC_018622	TAA	2	6	585875	585880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458103
12399	NC_018622	AGG	2	6	585911	585916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458103
12400	NC_018622	AAC	2	6	585985	585990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458103
12401	NC_018622	TGTA	2	8	586006	586013	25 %	50 %	25 %	0 %	407458103
12402	NC_018622	CGG	2	6	586103	586108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458103
12403	NC_018622	AACGG	2	10	586119	586128	40 %	0 %	40 %	20 %	407458103
12404	NC_018622	GT	4	8	586136	586143	0 %	50 %	50 %	0 %	407458103
12405	NC_018622	TGT	2	6	586151	586156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458103
12406	NC_018622	ATGGA	2	10	586224	586233	40 %	20 %	40 %	0 %	407458103
12407	NC_018622	CGA	2	6	586237	586242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458103
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12410	NC_018622	GATAA	2	10	586440	586449	60 %	20 %	20 %	0 %	407458104
12411	NC_018622	TTCA	2	8	586479	586486	25 %	50 %	0 %	25 %	407458104
12412	NC_018622	TAA	2	6	586487	586492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458104
12413	NC_018622	TGGA	2	8	586554	586561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12414	NC_018622	TTA	2	6	586603	586608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458105
12415	NC_018622	CAG	2	6	586694	586699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458105
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12418	NC_018622	CGA	2	6	586769	586774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458105
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12421	NC_018622	T	6	6	586915	586920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12422	NC_018622	ATT	2	6	586929	586934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12423	NC_018622	TCA	2	6	587010	587015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458106
12424	NC_018622	TAGA	2	8	587104	587111	50 %	25 %	25 %	0 %	407458106
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12432	NC_018622	ATT	2	6	587523	587528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458106
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12439	NC_018622	ATTTT	2	10	587706	587715	20 %	80 %	0 %	0 %	407458106
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12441	NC_018622	A	9	9	587732	587740	100 %	0 %	0 %	0 %	407458106
12442	NC_018622	AAAT	2	8	587805	587812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12443	NC_018622	TCA	2	6	587851	587856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12444	NC_018622	ATTAA	2	10	587881	587890	60 %	40 %	0 %	0 %	407458107
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12447	NC_018622	AAG	2	6	588002	588007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458107
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12449	NC_018622	GTT	2	6	588050	588055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12450	NC_018622	AAG	2	6	588106	588111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458108
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12452	NC_018622	ATT	2	6	588155	588160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458108
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12456	NC_018622	CTTT	2	8	588320	588327	0 %	75 %	0 %	25 %	407458108
12457	NC_018622	ACA	2	6	588332	588337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458108
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12459	NC_018622	ACT	2	6	588396	588401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458108
12460	NC_018622	TGA	2	6	588619	588624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458108
12461	NC_018622	AACA	2	8	588654	588661	75 %	0 %	0 %	25 %	407458108
12462	NC_018622	TACC	2	8	588739	588746	25 %	25 %	0 %	50 %	407458108
12463	NC_018622	GAG	2	6	588747	588752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458108
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12470	NC_018622	ATT	2	6	589163	589168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458108
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12475	NC_018622	GTT	2	6	589325	589330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458108
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12477	NC_018622	AAT	2	6	589372	589377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458108
12478	NC_018622	TTAC	2	8	589393	589400	25 %	50 %	0 %	25 %	407458108
12479	NC_018622	TTC	2	6	589427	589432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458108
12480	NC_018622	GCT	2	6	589502	589507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458108
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12483	NC_018622	A	6	6	589599	589604	100 %	0 %	0 %	0 %	407458109
12484	NC_018622	GTT	2	6	589615	589620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458109
12485	NC_018622	TCA	2	6	589759	589764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458109
12486	NC_018622	GAAAA	2	10	589785	589794	80 %	0 %	20 %	0 %	407458109
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12489	NC_018622	A	6	6	589945	589950	100 %	0 %	0 %	0 %	407458109
12490	NC_018622	AGG	2	6	590016	590021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458109
12491	NC_018622	AAC	2	6	590027	590032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458109
12492	NC_018622	TCGCAA	2	12	590036	590047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407458109
12493	NC_018622	TGA	2	6	590082	590087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458109
12494	NC_018622	CATC	2	8	590124	590131	25 %	25 %	0 %	50 %	407458109
12495	NC_018622	ATCTCA	2	12	590142	590153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458109
12496	NC_018622	ATA	2	6	590183	590188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458109
12497	NC_018622	CGT	2	6	590256	590261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458110
12498	NC_018622	GC	3	6	590346	590351	0 %	0 %	50 %	50 %	407458110
12499	NC_018622	TCA	2	6	590369	590374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458110
12500	NC_018622	ATG	2	6	590481	590486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458110

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