MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018622	TAA	2	6	544068	544073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458064
11502	NC_018622	TGA	3	9	544079	544087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458064
11503	NC_018622	ATAG	2	8	544136	544143	50 %	25 %	25 %	0 %	407458064
11504	NC_018622	CTT	2	6	544151	544156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458064
11505	NC_018622	GTA	2	6	544184	544189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458064
11506	NC_018622	T	7	7	544312	544318	0 %	100 %	0 %	0 %	407458064
11507	NC_018622	TAC	2	6	544347	544352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458064
11508	NC_018622	GAG	2	6	544371	544376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458064
11509	NC_018622	GCG	2	6	544447	544452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407458064
11510	NC_018622	TCA	2	6	544471	544476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458064
11511	NC_018622	TAA	2	6	544506	544511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458064
11512	NC_018622	GCA	2	6	544543	544548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458064
11513	NC_018622	GTG	2	6	544559	544564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458064
11514	NC_018622	TAA	2	6	544683	544688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458064
11515	NC_018622	AGGA	2	8	544692	544699	50 %	0 %	50 %	0 %	407458064
11516	NC_018622	TGAG	2	8	544771	544778	25 %	25 %	50 %	0 %	407458064
11517	NC_018622	TCTCT	2	10	544797	544806	0 %	60 %	0 %	40 %	407458064
11518	NC_018622	T	7	7	544841	544847	0 %	100 %	0 %	0 %	407458064
11519	NC_018622	GTA	2	6	544893	544898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458064
11520	NC_018622	TAA	2	6	544905	544910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458064
11521	NC_018622	GAC	2	6	544920	544925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458064
11522	NC_018622	AGAC	2	8	544945	544952	50 %	0 %	25 %	25 %	407458064
11523	NC_018622	TTA	2	6	545086	545091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458064
11524	NC_018622	G	6	6	545195	545200	0 %	0 %	100 %	0 %	407458064
11525	NC_018622	ATA	2	6	545209	545214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458064
11526	NC_018622	CTG	2	6	545242	545247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458064
11527	NC_018622	TGTT	2	8	545270	545277	0 %	75 %	25 %	0 %	407458064
11528	NC_018622	AGG	2	6	545472	545477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458064
11529	NC_018622	ATGGTC	2	12	545496	545507	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407458064
11530	NC_018622	ATG	2	6	545656	545661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458064
11531	NC_018622	AGT	2	6	545779	545784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458064
11532	NC_018622	A	6	6	545822	545827	100 %	0 %	0 %	0 %	407458064
11533	NC_018622	AAT	2	6	545869	545874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458064
11534	NC_018622	T	7	7	545891	545897	0 %	100 %	0 %	0 %	407458064
11535	NC_018622	AGA	2	6	545926	545931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458064
11536	NC_018622	TGA	3	9	545940	545948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458064
11537	NC_018622	AAC	2	6	546026	546031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458064
11538	NC_018622	TC	3	6	546075	546080	0 %	50 %	0 %	50 %	407458064
11539	NC_018622	ATG	2	6	546087	546092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458064
11540	NC_018622	ATA	2	6	546145	546150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_018622	TGA	2	6	546158	546163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_018622	AATT	3	12	546164	546175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_018622	AAT	2	6	546201	546206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_018622	ATTT	2	8	546219	546226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_018622	T	7	7	546224	546230	0 %	100 %	0 %	0 %	407458065
11546	NC_018622	TGT	2	6	546267	546272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458065
11547	NC_018622	GCA	2	6	546374	546379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458065
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11549	NC_018622	ATA	2	6	546428	546433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458065
11550	NC_018622	GCA	2	6	546530	546535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458065
11551	NC_018622	TTG	2	6	546664	546669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458065
11552	NC_018622	GCC	2	6	546686	546691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458065
11553	NC_018622	TAG	2	6	546696	546701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458065
11554	NC_018622	TAA	2	6	546814	546819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_018622	CTT	2	6	546866	546871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458066
11556	NC_018622	AAG	2	6	546876	546881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458066
11557	NC_018622	ATG	2	6	546905	546910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458066
11558	NC_018622	ATA	2	6	546929	546934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458066
11559	NC_018622	AAAT	2	8	546978	546985	75 %	25 %	0 %	0 %	407458066
11560	NC_018622	ATA	2	6	547019	547024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458066
11561	NC_018622	TAC	2	6	547060	547065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458066
11562	NC_018622	TGC	2	6	547066	547071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458066
11563	NC_018622	GGAG	2	8	547087	547094	25 %	0 %	75 %	0 %	407458066
11564	NC_018622	CTA	2	6	547104	547109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458066
11565	NC_018622	TA	3	6	547108	547113	50 %	50 %	0 %	0 %	407458066
11566	NC_018622	AAT	2	6	547169	547174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458066
11567	NC_018622	ATT	2	6	547249	547254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458066
11568	NC_018622	ATCT	2	8	547281	547288	25 %	50 %	0 %	25 %	407458066
11569	NC_018622	TC	3	6	547300	547305	0 %	50 %	0 %	50 %	407458066
11570	NC_018622	TTC	2	6	547341	547346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458066
11571	NC_018622	TAAG	2	8	547356	547363	50 %	25 %	25 %	0 %	407458066
11572	NC_018622	CTT	2	6	547377	547382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458066
11573	NC_018622	GAC	2	6	547403	547408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458066
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11576	NC_018622	AT	3	6	547494	547499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_018622	T	6	6	547553	547558	0 %	100 %	0 %	0 %	407458067
11578	NC_018622	TAAC	2	8	547576	547583	50 %	25 %	0 %	25 %	407458067
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11581	NC_018622	TTG	2	6	547740	547745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458067
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11588	NC_018622	AAAACA	2	12	547984	547995	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407458067
11589	NC_018622	TGA	2	6	548009	548014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458067
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11591	NC_018622	AGAT	2	8	548106	548113	50 %	25 %	25 %	0 %	407458067
11592	NC_018622	CTATAC	2	12	548119	548130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458067
11593	NC_018622	TTG	2	6	548147	548152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458067
11594	NC_018622	CAC	2	6	548261	548266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458067
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11596	NC_018622	CA	3	6	548463	548468	50 %	0 %	0 %	50 %	407458067
11597	NC_018622	GT	3	6	548591	548596	0 %	50 %	50 %	0 %	407458067
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11602	NC_018622	CCT	2	6	548727	548732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458067
11603	NC_018622	CTG	2	6	548752	548757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458067
11604	NC_018622	CTTT	2	8	548782	548789	0 %	75 %	0 %	25 %	407458067
11605	NC_018622	ATA	2	6	548817	548822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458067
11606	NC_018622	ATAA	2	8	548838	548845	75 %	25 %	0 %	0 %	407458067
11607	NC_018622	A	7	7	548844	548850	100 %	0 %	0 %	0 %	407458067
11608	NC_018622	TGC	2	6	548888	548893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458067
11609	NC_018622	CAT	2	6	548939	548944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458067
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11611	NC_018622	GTTT	2	8	549033	549040	0 %	75 %	25 %	0 %	407458068
11612	NC_018622	ACA	2	6	549050	549055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458068
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11614	NC_018622	CAGAC	2	10	549063	549072	40 %	0 %	20 %	40 %	407458068
11615	NC_018622	GAA	2	6	549114	549119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458068
11616	NC_018622	TAA	2	6	549127	549132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458068
11617	NC_018622	AG	3	6	549161	549166	50 %	0 %	50 %	0 %	407458068
11618	NC_018622	CCAA	2	8	549235	549242	50 %	0 %	0 %	50 %	407458068
11619	NC_018622	CAA	2	6	549282	549287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458068
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