MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_018622	ATC	2	6	309579	309584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457839
6502	NC_018622	ATAG	2	8	309612	309619	50 %	25 %	25 %	0 %	407457839
6503	NC_018622	TTA	2	6	309643	309648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457839
6504	NC_018622	AGA	2	6	309684	309689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457839
6505	NC_018622	ACA	2	6	309717	309722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457839
6506	NC_018622	TGA	2	6	309741	309746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457839
6507	NC_018622	GA	3	6	309789	309794	50 %	0 %	50 %	0 %	407457839
6508	NC_018622	GAA	2	6	309896	309901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457839
6509	NC_018622	TCG	2	6	309920	309925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457839
6510	NC_018622	ATA	2	6	309965	309970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457839
6511	NC_018622	GTT	2	6	310002	310007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457839
6512	NC_018622	CGC	2	6	310017	310022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457839
6513	NC_018622	TCA	2	6	310042	310047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457839
6514	NC_018622	AGA	2	6	310080	310085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457839
6515	NC_018622	ATT	2	6	310104	310109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457839
6516	NC_018622	CAG	2	6	310127	310132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457839
6517	NC_018622	CAG	2	6	310151	310156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457839
6518	NC_018622	CTG	2	6	310160	310165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457839
6519	NC_018622	CATAG	2	10	310185	310194	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6520	NC_018622	A	6	6	310199	310204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_018622	T	6	6	310260	310265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_018622	GGGA	2	8	310272	310279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_018622	T	6	6	310311	310316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_018622	AAT	2	6	310333	310338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_018622	AC	3	6	310361	310366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_018622	A	7	7	310377	310383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_018622	CTGC	2	8	310449	310456	0 %	25 %	25 %	50 %	407457840
6528	NC_018622	GCA	2	6	310560	310565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6529	NC_018622	TGT	2	6	310586	310591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457840
6530	NC_018622	AAC	2	6	310607	310612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457840
6531	NC_018622	TA	3	6	310667	310672	50 %	50 %	0 %	0 %	407457840
6532	NC_018622	TGC	2	6	310673	310678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6533	NC_018622	AT	3	6	310811	310816	50 %	50 %	0 %	0 %	407457840
6534	NC_018622	TATTT	2	10	310959	310968	20 %	80 %	0 %	0 %	407457840
6535	NC_018622	GCA	2	6	311092	311097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6536	NC_018622	TA	3	6	311116	311121	50 %	50 %	0 %	0 %	407457840
6537	NC_018622	T	6	6	311137	311142	0 %	100 %	0 %	0 %	407457840
6538	NC_018622	CCT	2	6	311508	311513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457840
6539	NC_018622	TCC	2	6	311523	311528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457840
6540	NC_018622	CTT	2	6	311569	311574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457840
6541	NC_018622	GTT	2	6	311647	311652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457840
6542	NC_018622	CAA	2	6	311695	311700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457840
6543	NC_018622	GTA	2	6	311739	311744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457840
6544	NC_018622	GTA	2	6	311760	311765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457840
6545	NC_018622	CTGC	2	8	311866	311873	0 %	25 %	25 %	50 %	407457840
6546	NC_018622	AG	3	6	311888	311893	50 %	0 %	50 %	0 %	407457840
6547	NC_018622	CCTT	2	8	311967	311974	0 %	50 %	0 %	50 %	407457840
6548	NC_018622	ACC	2	6	312003	312008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457840
6549	NC_018622	TTGA	2	8	312031	312038	25 %	50 %	25 %	0 %	407457840
6550	NC_018622	ATC	2	6	312057	312062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457840
6551	NC_018622	TGG	2	6	312073	312078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457840
6552	NC_018622	T	6	6	312088	312093	0 %	100 %	0 %	0 %	407457840
6553	NC_018622	A	6	6	312196	312201	100 %	0 %	0 %	0 %	407457840
6554	NC_018622	CAT	2	6	312274	312279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457840
6555	NC_018622	GA	3	6	312330	312335	50 %	0 %	50 %	0 %	407457840
6556	NC_018622	CCA	2	6	312339	312344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457840
6557	NC_018622	GCAATC	2	12	312348	312359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407457840
6558	NC_018622	TAT	2	6	312382	312387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457840
6559	NC_018622	CCA	2	6	312405	312410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457840
6560	NC_018622	CCG	2	6	312444	312449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457840
6561	NC_018622	GAA	2	6	312459	312464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457840
6562	NC_018622	TAT	2	6	312511	312516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457840
6563	NC_018622	CTG	2	6	312526	312531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6564	NC_018622	ATT	2	6	312549	312554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457840
6565	NC_018622	AGG	2	6	312626	312631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457840
6566	NC_018622	TTCCGG	2	12	312632	312643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6567	NC_018622	G	9	9	312659	312667	0 %	0 %	100 %	0 %	407457840
6568	NC_018622	CCG	2	6	312684	312689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457840
6569	NC_018622	GAG	2	6	312747	312752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457840
6570	NC_018622	GAG	2	6	312801	312806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457840
6571	NC_018622	GCA	2	6	312867	312872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6572	NC_018622	CCTGT	2	10	312874	312883	0 %	40 %	20 %	40 %	407457840
6573	NC_018622	AAAGA	2	10	312926	312935	80 %	0 %	20 %	0 %	407457840
6574	NC_018622	AGC	2	6	312955	312960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6575	NC_018622	CTT	2	6	313000	313005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457840
6576	NC_018622	GTA	2	6	313008	313013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457840
6577	NC_018622	AGT	2	6	313043	313048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457840
6578	NC_018622	TTG	2	6	313078	313083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457840
6579	NC_018622	TTCTGT	2	12	313139	313150	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407457840
6580	NC_018622	TGC	2	6	313151	313156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6581	NC_018622	AATAT	2	10	313206	313215	60 %	40 %	0 %	0 %	407457840
6582	NC_018622	AG	3	6	313220	313225	50 %	0 %	50 %	0 %	407457840
6583	NC_018622	CGA	2	6	313229	313234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457840
6584	NC_018622	A	8	8	313307	313314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_018622	A	6	6	313316	313321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_018622	AG	3	6	313335	313340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_018622	GA	3	6	313385	313390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_018622	GAA	3	9	313441	313449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457841
6589	NC_018622	AAC	2	6	313518	313523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457841
6590	NC_018622	TTG	2	6	313544	313549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457841
6591	NC_018622	ACAT	2	8	313627	313634	50 %	25 %	0 %	25 %	407457841
6592	NC_018622	AAG	2	6	313653	313658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457841
6593	NC_018622	AGC	2	6	313733	313738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457841
6594	NC_018622	CTT	2	6	313748	313753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457841
6595	NC_018622	TGA	2	6	313793	313798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457841
6596	NC_018622	CCA	2	6	314023	314028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457841
6597	NC_018622	CAT	2	6	314114	314119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457841
6598	NC_018622	TGC	2	6	314148	314153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457841
6599	NC_018622	TTTA	2	8	314181	314188	25 %	75 %	0 %	0 %	407457841
6600	NC_018622	T	7	7	314230	314236	0 %	100 %	0 %	0 %	407457841
6601	NC_018622	TTCT	2	8	314324	314331	0 %	75 %	0 %	25 %	407457841
6602	NC_018622	CAC	2	6	314399	314404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457841
6603	NC_018622	AGT	2	6	314460	314465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457841
6604	NC_018622	GTA	2	6	314609	314614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457841
6605	NC_018622	TTA	2	6	314629	314634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457841
6606	NC_018622	AGC	2	6	314709	314714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457841
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6608	NC_018622	TCA	2	6	314755	314760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457841
6609	NC_018622	TGCC	2	8	314968	314975	0 %	25 %	25 %	50 %	407457841
6610	NC_018622	ATA	2	6	314983	314988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457841
6611	NC_018622	GTG	2	6	315001	315006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457841
6612	NC_018622	TTG	2	6	315019	315024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_018622	CAA	2	6	315053	315058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_018622	ATAGA	2	10	315074	315083	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_018622	CTT	2	6	315089	315094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_018622	TTG	2	6	315142	315147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457842
6617	NC_018622	CGC	2	6	315328	315333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457842
6618	NC_018622	TGGT	2	8	315348	315355	0 %	50 %	50 %	0 %	407457842
6619	NC_018622	GCT	2	6	315367	315372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457842
6620	NC_018622	GCA	2	6	315411	315416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457842
6621	NC_018622	AGC	2	6	315506	315511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457842
6622	NC_018622	CAA	2	6	315562	315567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457842
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6995	NC_018622	AGA	2	6	332599	332604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457855
6996	NC_018622	T	6	6	332642	332647	0 %	100 %	0 %	0 %	407457855
6997	NC_018622	GT	3	6	332657	332662	0 %	50 %	50 %	0 %	407457855
6998	NC_018622	TAA	2	6	332733	332738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457855
6999	NC_018622	AGC	2	6	332848	332853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457855
7000	NC_018622	A	6	6	332859	332864	100 %	0 %	0 %	0 %	407457855

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