MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_018621	A	6	6	1130128	1130133	100 %	0 %	0 %	0 %	407457254
24003	NC_018621	GAA	2	6	1130141	1130146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457254
24004	NC_018621	TCA	2	6	1130293	1130298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457254
24005	NC_018621	ACA	2	6	1130315	1130320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457254
24006	NC_018621	ACA	2	6	1130356	1130361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457254
24007	NC_018621	CGT	2	6	1130378	1130383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457254
24008	NC_018621	AAAAG	2	10	1130429	1130438	80 %	0 %	20 %	0 %	407457254
24009	NC_018621	TGC	2	6	1130502	1130507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457255
24010	NC_018621	AGG	2	6	1130618	1130623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457255
24011	NC_018621	TTC	2	6	1130646	1130651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457255
24012	NC_018621	ACG	2	6	1130657	1130662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457255
24013	NC_018621	CAAT	2	8	1130677	1130684	50 %	25 %	0 %	25 %	407457255
24014	NC_018621	AGAA	2	8	1130711	1130718	75 %	0 %	25 %	0 %	407457255
24015	NC_018621	CTAACC	2	12	1130752	1130763	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407457255
24016	NC_018621	AGAA	2	8	1130765	1130772	75 %	0 %	25 %	0 %	407457255
24017	NC_018621	CT	3	6	1130793	1130798	0 %	50 %	0 %	50 %	407457255
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24019	NC_018621	TCT	2	6	1130931	1130936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457255
24020	NC_018621	AT	3	6	1131056	1131061	50 %	50 %	0 %	0 %	407457255
24021	NC_018621	AAT	2	6	1131143	1131148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457255
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24032	NC_018621	ATT	2	6	1131437	1131442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24033	NC_018621	TTA	2	6	1131444	1131449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24034	NC_018621	TAC	2	6	1131480	1131485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24035	NC_018621	ATT	2	6	1131486	1131491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24036	NC_018621	GAA	2	6	1131563	1131568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24037	NC_018621	T	6	6	1131661	1131666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24039	NC_018621	CTT	2	6	1131704	1131709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24040	NC_018621	AGT	2	6	1131797	1131802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24041	NC_018621	TTGC	2	8	1131825	1131832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24042	NC_018621	T	8	8	1131840	1131847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24043	NC_018621	A	6	6	1131868	1131873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24044	NC_018621	A	6	6	1131928	1131933	100 %	0 %	0 %	0 %	407457257
24045	NC_018621	TGT	2	6	1132023	1132028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457257
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24057	NC_018621	CTG	2	6	1132562	1132567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457257
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24068	NC_018621	TA	3	6	1132924	1132929	50 %	50 %	0 %	0 %	407457257
24069	NC_018621	A	6	6	1132983	1132988	100 %	0 %	0 %	0 %	407457257
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24113	NC_018621	CGG	2	6	1134914	1134919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457258
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24119	NC_018621	CTGT	2	8	1135183	1135190	0 %	50 %	25 %	25 %	407457258
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24131	NC_018621	T	6	6	1135861	1135866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24233	NC_018621	AATG	2	8	1140084	1140091	50 %	25 %	25 %	0 %	407457264
24234	NC_018621	A	6	6	1140103	1140108	100 %	0 %	0 %	0 %	407457264
24235	NC_018621	AGC	2	6	1140117	1140122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457264
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24237	NC_018621	CTA	2	6	1140200	1140205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457264
24238	NC_018621	CGCT	2	8	1140308	1140315	0 %	25 %	25 %	50 %	407457264
24239	NC_018621	A	6	6	1140338	1140343	100 %	0 %	0 %	0 %	407457264
24240	NC_018621	TGC	2	6	1140354	1140359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457264
24241	NC_018621	GCT	2	6	1140526	1140531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457264
24242	NC_018621	ATG	2	6	1140595	1140600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457264
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24244	NC_018621	TCA	2	6	1140742	1140747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457264
24245	NC_018621	TCG	2	6	1140762	1140767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457264
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24262	NC_018621	AGT	2	6	1141360	1141365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457265
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24264	NC_018621	CTTT	2	8	1141583	1141590	0 %	75 %	0 %	25 %	407457265
24265	NC_018621	GCT	2	6	1141594	1141599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457265
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24272	NC_018621	TA	3	6	1142200	1142205	50 %	50 %	0 %	0 %	407457266
24273	NC_018621	GAG	2	6	1142214	1142219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457266
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24297	NC_018621	TGC	3	9	1143150	1143158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457268
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24299	NC_018621	GTAA	2	8	1143197	1143204	50 %	25 %	25 %	0 %	407457268
24300	NC_018621	TGT	2	6	1143217	1143222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457268
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24308	NC_018621	TAA	3	9	1143555	1143563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457268
24309	NC_018621	GCC	2	6	1143600	1143605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457268
24310	NC_018621	CAT	2	6	1143611	1143616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457268
24311	NC_018621	CT	3	6	1143647	1143652	0 %	50 %	0 %	50 %	407457268
24312	NC_018621	TAA	2	6	1143653	1143658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457268
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24320	NC_018621	TAG	2	6	1144046	1144051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457268
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24322	NC_018621	ATG	3	9	1144111	1144119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457268
24323	NC_018621	TCA	2	6	1144138	1144143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457268
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24328	NC_018621	CTA	2	6	1144621	1144626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457269
24329	NC_018621	CTT	2	6	1144651	1144656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457269
24330	NC_018621	AAG	2	6	1144663	1144668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457269
24331	NC_018621	GCAT	2	8	1144685	1144692	25 %	25 %	25 %	25 %	407457269
24332	NC_018621	ATC	2	6	1144700	1144705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457269
24333	NC_018621	AAAG	3	12	1144730	1144741	75 %	0 %	25 %	0 %	407457269
24334	NC_018621	GAC	2	6	1144742	1144747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457269
24335	NC_018621	GCT	2	6	1144762	1144767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457269
24336	NC_018621	CTC	2	6	1144778	1144783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457269
24337	NC_018621	AAT	2	6	1144823	1144828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24338	NC_018621	GCG	2	6	1144845	1144850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24339	NC_018621	T	6	6	1144914	1144919	0 %	100 %	0 %	0 %	407457270
24340	NC_018621	CTT	2	6	1144920	1144925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457270
24341	NC_018621	CAAAA	2	10	1145092	1145101	80 %	0 %	0 %	20 %	407457270
24342	NC_018621	CTG	2	6	1145172	1145177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457270
24343	NC_018621	CCTC	2	8	1145225	1145232	0 %	25 %	0 %	75 %	407457270
24344	NC_018621	CAT	2	6	1145353	1145358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457270
24345	NC_018621	CAC	2	6	1145370	1145375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457270
24346	NC_018621	GAA	2	6	1145376	1145381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457270
24347	NC_018621	CCA	2	6	1145467	1145472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457270
24348	NC_018621	TCA	2	6	1145529	1145534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457270
24349	NC_018621	AAG	2	6	1145564	1145569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457270
24350	NC_018621	T	6	6	1145590	1145595	0 %	100 %	0 %	0 %	407457270
24351	NC_018621	T	6	6	1145638	1145643	0 %	100 %	0 %	0 %	407457270
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24474	NC_018621	AG	3	6	1150269	1150274	50 %	0 %	50 %	0 %	407457274
24475	NC_018621	GA	3	6	1150310	1150315	50 %	0 %	50 %	0 %	407457274
24476	NC_018621	TTAA	2	8	1150345	1150352	50 %	50 %	0 %	0 %	407457274
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