MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_018621	ATTC	2	8	1106625	1106632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23502	NC_018621	TCA	2	6	1106640	1106645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23503	NC_018621	CTT	2	6	1106707	1106712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23504	NC_018621	AAG	2	6	1106725	1106730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23505	NC_018621	T	6	6	1106732	1106737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23506	NC_018621	TTG	2	6	1106742	1106747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23507	NC_018621	TGT	2	6	1106788	1106793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23508	NC_018621	T	7	7	1106913	1106919	0 %	100 %	0 %	0 %	407457232
23509	NC_018621	AGA	2	6	1106961	1106966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457232
23510	NC_018621	A	6	6	1107039	1107044	100 %	0 %	0 %	0 %	407457232
23511	NC_018621	GCA	2	6	1107064	1107069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457232
23512	NC_018621	TTA	2	6	1107196	1107201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457232
23513	NC_018621	A	7	7	1107249	1107255	100 %	0 %	0 %	0 %	407457232
23514	NC_018621	GGC	2	6	1107351	1107356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457232
23515	NC_018621	TCA	2	6	1107429	1107434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457232
23516	NC_018621	CT	3	6	1107444	1107449	0 %	50 %	0 %	50 %	407457232
23517	NC_018621	GAT	2	6	1107466	1107471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457232
23518	NC_018621	ATC	2	6	1107499	1107504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457232
23519	NC_018621	GAT	2	6	1107667	1107672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457232
23520	NC_018621	GCA	2	6	1107687	1107692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457232
23521	NC_018621	ACT	2	6	1107774	1107779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457232
23522	NC_018621	CAC	2	6	1107781	1107786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457232
23523	NC_018621	AGGA	2	8	1107827	1107834	50 %	0 %	50 %	0 %	407457232
23524	NC_018621	CT	3	6	1107883	1107888	0 %	50 %	0 %	50 %	407457232
23525	NC_018621	AG	3	6	1107896	1107901	50 %	0 %	50 %	0 %	407457232
23526	NC_018621	TGA	2	6	1108062	1108067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457232
23527	NC_018621	TAT	2	6	1108086	1108091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457232
23528	NC_018621	AAG	3	9	1108106	1108114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457232
23529	NC_018621	ACA	2	6	1108137	1108142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457232
23530	NC_018621	AT	3	6	1108182	1108187	50 %	50 %	0 %	0 %	407457232
23531	NC_018621	ATA	2	6	1108223	1108228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457232
23532	NC_018621	ATG	2	6	1108388	1108393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457232
23533	NC_018621	TC	3	6	1108409	1108414	0 %	50 %	0 %	50 %	407457232
23534	NC_018621	CTAT	2	8	1108490	1108497	25 %	50 %	0 %	25 %	407457232
23535	NC_018621	TCT	2	6	1108554	1108559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457232
23536	NC_018621	AAG	2	6	1108589	1108594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457232
23537	NC_018621	AAG	2	6	1108646	1108651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457232
23538	NC_018621	TCC	2	6	1108692	1108697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457232
23539	NC_018621	GGA	2	6	1108753	1108758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457232
23540	NC_018621	GAA	2	6	1108798	1108803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457232
23541	NC_018621	TCT	2	6	1108853	1108858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457232
23542	NC_018621	AGA	2	6	1108902	1108907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457232
23543	NC_018621	CACG	2	8	1108938	1108945	25 %	0 %	25 %	50 %	407457232
23544	NC_018621	T	6	6	1108946	1108951	0 %	100 %	0 %	0 %	407457232
23545	NC_018621	AAT	2	6	1108990	1108995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457232
23546	NC_018621	AACA	2	8	1109055	1109062	75 %	0 %	0 %	25 %	407457232
23547	NC_018621	CAA	2	6	1109074	1109079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457232
23548	NC_018621	A	6	6	1109234	1109239	100 %	0 %	0 %	0 %	407457232
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23550	NC_018621	ATTC	2	8	1109397	1109404	25 %	50 %	0 %	25 %	407457232
23551	NC_018621	ATG	2	6	1109458	1109463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457232
23552	NC_018621	GAA	2	6	1109488	1109493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457232
23553	NC_018621	TCA	2	6	1109526	1109531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457232
23554	NC_018621	CTC	2	6	1109549	1109554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457232
23555	NC_018621	CCCTC	2	10	1109743	1109752	0 %	20 %	0 %	80 %	407457232
23556	NC_018621	T	6	6	1109805	1109810	0 %	100 %	0 %	0 %	407457233
23557	NC_018621	CTTT	2	8	1109811	1109818	0 %	75 %	0 %	25 %	407457233
23558	NC_018621	CGAA	2	8	1109826	1109833	50 %	0 %	25 %	25 %	407457233
23559	NC_018621	TC	3	6	1109863	1109868	0 %	50 %	0 %	50 %	407457233
23560	NC_018621	CT	3	6	1109884	1109889	0 %	50 %	0 %	50 %	407457233
23561	NC_018621	T	6	6	1109901	1109906	0 %	100 %	0 %	0 %	407457233
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23563	NC_018621	T	6	6	1109955	1109960	0 %	100 %	0 %	0 %	407457233
23564	NC_018621	CGTA	2	8	1109970	1109977	25 %	25 %	25 %	25 %	407457233
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23567	NC_018621	GCT	2	6	1110037	1110042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457233
23568	NC_018621	CATA	2	8	1110122	1110129	50 %	25 %	0 %	25 %	407457233
23569	NC_018621	GCTCTT	2	12	1110131	1110142	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407457233
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23571	NC_018621	TCT	2	6	1110203	1110208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457233
23572	NC_018621	ATG	2	6	1110223	1110228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457233
23573	NC_018621	GATC	2	8	1110229	1110236	25 %	25 %	25 %	25 %	407457233
23574	NC_018621	TC	3	6	1110287	1110292	0 %	50 %	0 %	50 %	407457233
23575	NC_018621	TC	3	6	1110302	1110307	0 %	50 %	0 %	50 %	407457233
23576	NC_018621	TA	3	6	1110309	1110314	50 %	50 %	0 %	0 %	407457233
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23578	NC_018621	TGA	2	6	1110473	1110478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457233
23579	NC_018621	TC	3	6	1110482	1110487	0 %	50 %	0 %	50 %	407457233
23580	NC_018621	CT	3	6	1110583	1110588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23581	NC_018621	TTAT	2	8	1110589	1110596	25 %	75 %	0 %	0 %	407457234
23582	NC_018621	GTAA	2	8	1110704	1110711	50 %	25 %	25 %	0 %	407457234
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23588	NC_018621	TTC	2	6	1110969	1110974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457234
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23590	NC_018621	TC	3	6	1111051	1111056	0 %	50 %	0 %	50 %	407457234
23591	NC_018621	TCT	2	6	1111086	1111091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457234
23592	NC_018621	GTT	2	6	1111128	1111133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457234
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23603	NC_018621	TCT	2	6	1111593	1111598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457234
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23605	NC_018621	CCCT	2	8	1111694	1111701	0 %	25 %	0 %	75 %	407457234
23606	NC_018621	GGAT	2	8	1111758	1111765	25 %	25 %	50 %	0 %	407457234
23607	NC_018621	ATT	2	6	1111922	1111927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457234
23608	NC_018621	AATAC	2	10	1111941	1111950	60 %	20 %	0 %	20 %	407457234
23609	NC_018621	ATT	2	6	1111967	1111972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457234
23610	NC_018621	AATC	2	8	1111976	1111983	50 %	25 %	0 %	25 %	407457234
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23614	NC_018621	TATCG	2	10	1112258	1112267	20 %	40 %	20 %	20 %	407457234
23615	NC_018621	TA	3	6	1112276	1112281	50 %	50 %	0 %	0 %	407457234
23616	NC_018621	CTC	2	6	1112294	1112299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457234
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