MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018621	TAAA	2	8	542431	542438	75 %	25 %	0 %	0 %	407456715
11502	NC_018621	AAT	2	6	542472	542477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456715
11503	NC_018621	T	6	6	542477	542482	0 %	100 %	0 %	0 %	407456715
11504	NC_018621	AT	3	6	542496	542501	50 %	50 %	0 %	0 %	407456716
11505	NC_018621	TTG	2	6	542512	542517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456716
11506	NC_018621	GAAA	2	8	542519	542526	75 %	0 %	25 %	0 %	407456716
11507	NC_018621	GGT	2	6	542626	542631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456716
11508	NC_018621	GCT	2	6	542638	542643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456716
11509	NC_018621	TTA	2	6	542732	542737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456716
11510	NC_018621	AAT	2	6	542767	542772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456716
11511	NC_018621	GAA	2	6	542812	542817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456716
11512	NC_018621	TCT	2	6	542824	542829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456716
11513	NC_018621	TATG	2	8	542860	542867	25 %	50 %	25 %	0 %	407456716
11514	NC_018621	GTT	2	6	542929	542934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456716
11515	NC_018621	TAT	2	6	542985	542990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456716
11516	NC_018621	TGC	2	6	543021	543026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456716
11517	NC_018621	A	6	6	543117	543122	100 %	0 %	0 %	0 %	407456716
11518	NC_018621	GAA	2	6	543151	543156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456716
11519	NC_018621	TCT	2	6	543193	543198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456716
11520	NC_018621	TA	3	6	543199	543204	50 %	50 %	0 %	0 %	407456716
11521	NC_018621	GTT	2	6	543295	543300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_018621	AGA	2	6	543364	543369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456717
11523	NC_018621	ATT	2	6	543383	543388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456717
11524	NC_018621	TTC	2	6	543430	543435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456717
11525	NC_018621	AGA	2	6	543493	543498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456717
11526	NC_018621	AT	3	6	543565	543570	50 %	50 %	0 %	0 %	407456717
11527	NC_018621	AGT	2	6	543588	543593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456717
11528	NC_018621	ACT	2	6	543597	543602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_018621	CAT	2	6	543632	543637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_018621	TTC	2	6	543797	543802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456718
11531	NC_018621	CTTA	2	8	543824	543831	25 %	50 %	0 %	25 %	407456718
11532	NC_018621	TTG	2	6	543882	543887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456718
11533	NC_018621	TCT	2	6	543900	543905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456718
11534	NC_018621	TGA	2	6	543920	543925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456718
11535	NC_018621	CTA	2	6	543976	543981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456718
11536	NC_018621	AAGCTG	2	12	543990	544001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407456718
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11539	NC_018621	GAAG	2	8	544117	544124	50 %	0 %	50 %	0 %	407456718
11540	NC_018621	TCA	2	6	544141	544146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456718
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11542	NC_018621	CGG	2	6	544237	544242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407456719
11543	NC_018621	TTC	2	6	544276	544281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456719
11544	NC_018621	CAT	2	6	544330	544335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456719
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11547	NC_018621	T	7	7	544454	544460	0 %	100 %	0 %	0 %	407456719
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11550	NC_018621	T	6	6	544496	544501	0 %	100 %	0 %	0 %	407456719
11551	NC_018621	TAGGA	2	10	544632	544641	40 %	20 %	40 %	0 %	407456719
11552	NC_018621	GCA	2	6	544757	544762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456719
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11555	NC_018621	TAA	2	6	544842	544847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456719
11556	NC_018621	TAA	2	6	544879	544884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456719
11557	NC_018621	GGT	2	6	544888	544893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456719
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11559	NC_018621	CTT	2	6	544962	544967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456719
11560	NC_018621	GTA	2	6	544995	545000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456719
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11562	NC_018621	TAC	2	6	545158	545163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456719
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11571	NC_018621	TGAG	2	8	545582	545589	25 %	25 %	50 %	0 %	407456719
11572	NC_018621	TCTCT	2	10	545608	545617	0 %	60 %	0 %	40 %	407456719
11573	NC_018621	T	7	7	545652	545658	0 %	100 %	0 %	0 %	407456719
11574	NC_018621	GTA	2	6	545704	545709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456719
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11596	NC_018621	TGA	2	6	546969	546974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11598	NC_018621	AAT	2	6	547012	547017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_018621	ATTT	2	8	547030	547037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_018621	T	7	7	547035	547041	0 %	100 %	0 %	0 %	407456720
11601	NC_018621	TGT	2	6	547078	547083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456720
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11605	NC_018621	GCA	2	6	547341	547346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456720
11606	NC_018621	TTG	2	6	547475	547480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456720
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11609	NC_018621	TAA	2	6	547625	547630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_018621	CTT	2	6	547677	547682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456721
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11615	NC_018621	ATA	2	6	547830	547835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456721
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11619	NC_018621	CTA	2	6	547915	547920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456721
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