MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_018621	ATAGG	2	10	307411	307420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_018621	TG	3	6	307476	307481	0 %	50 %	50 %	0 %	407456480
6503	NC_018621	GAAA	2	8	307504	307511	75 %	0 %	25 %	0 %	407456480
6504	NC_018621	A	6	6	307509	307514	100 %	0 %	0 %	0 %	407456480
6505	NC_018621	TTG	2	6	307533	307538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456480
6506	NC_018621	CTAC	2	8	307572	307579	25 %	25 %	0 %	50 %	407456480
6507	NC_018621	AAT	2	6	307615	307620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456481
6508	NC_018621	GA	3	6	307722	307727	50 %	0 %	50 %	0 %	407456481
6509	NC_018621	AAAG	2	8	307884	307891	75 %	0 %	25 %	0 %	407456481
6510	NC_018621	TAC	2	6	307903	307908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456481
6511	NC_018621	TTC	2	6	307923	307928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456481
6512	NC_018621	CTT	3	9	307933	307941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456481
6513	NC_018621	GGA	2	6	307987	307992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456481
6514	NC_018621	AT	3	6	308002	308007	50 %	50 %	0 %	0 %	407456481
6515	NC_018621	TTC	2	6	308012	308017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456481
6516	NC_018621	CAG	2	6	308170	308175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456481
6517	NC_018621	GTTT	2	8	308367	308374	0 %	75 %	25 %	0 %	407456481
6518	NC_018621	ATG	2	6	308429	308434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456481
6519	NC_018621	T	6	6	308885	308890	0 %	100 %	0 %	0 %	407456481
6520	NC_018621	TATTT	2	10	308943	308952	20 %	80 %	0 %	0 %	407456481
6521	NC_018621	ATGGT	2	10	308992	309001	20 %	40 %	40 %	0 %	407456481
6522	NC_018621	TCA	2	6	309034	309039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456481
6523	NC_018621	TAC	2	6	309040	309045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456481
6524	NC_018621	GTG	2	6	309063	309068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456481
6525	NC_018621	TCC	2	6	309128	309133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456481
6526	NC_018621	ATG	2	6	309230	309235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456481
6527	NC_018621	TGAT	2	8	309255	309262	25 %	50 %	25 %	0 %	407456481
6528	NC_018621	CAT	2	6	309301	309306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456481
6529	NC_018621	TGA	2	6	309346	309351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_018621	T	6	6	309378	309383	0 %	100 %	0 %	0 %	407456482
6531	NC_018621	ATA	2	6	309422	309427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456482
6532	NC_018621	TAT	2	6	309519	309524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456482
6533	NC_018621	ATC	2	6	309538	309543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456482
6534	NC_018621	ATAG	2	8	309571	309578	50 %	25 %	25 %	0 %	407456482
6535	NC_018621	TTA	2	6	309602	309607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456482
6536	NC_018621	AGA	2	6	309643	309648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456482
6537	NC_018621	ACA	2	6	309676	309681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456482
6538	NC_018621	TGA	2	6	309700	309705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456482
6539	NC_018621	ATCGT	2	10	309725	309734	20 %	40 %	20 %	20 %	407456482
6540	NC_018621	GA	3	6	309748	309753	50 %	0 %	50 %	0 %	407456482
6541	NC_018621	GAA	2	6	309855	309860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456482
6542	NC_018621	TCG	2	6	309879	309884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456482
6543	NC_018621	ATT	2	6	309910	309915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456482
6544	NC_018621	ATA	2	6	309924	309929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456482
6545	NC_018621	GTT	2	6	309961	309966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456482
6546	NC_018621	TCA	2	6	310001	310006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456482
6547	NC_018621	AGA	2	6	310039	310044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456482
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6549	NC_018621	CAG	2	6	310086	310091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456482
6550	NC_018621	CAG	2	6	310110	310115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456482
6551	NC_018621	CTG	2	6	310119	310124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456482
6552	NC_018621	CATAG	2	10	310144	310153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6553	NC_018621	A	6	6	310158	310163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_018621	T	6	6	310219	310224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_018621	GGGA	2	8	310231	310238	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_018621	T	6	6	310270	310275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_018621	AAT	2	6	310292	310297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_018621	AC	3	6	310320	310325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6559	NC_018621	A	8	8	310336	310343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_018621	CTGC	2	8	310409	310416	0 %	25 %	25 %	50 %	407456483
6561	NC_018621	GCA	2	6	310520	310525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456483
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6564	NC_018621	AAC	2	6	310567	310572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456483
6565	NC_018621	TA	3	6	310627	310632	50 %	50 %	0 %	0 %	407456483
6566	NC_018621	TGC	2	6	310633	310638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456483
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6568	NC_018621	TATTT	2	10	310919	310928	20 %	80 %	0 %	0 %	407456483
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6571	NC_018621	T	6	6	311097	311102	0 %	100 %	0 %	0 %	407456483
6572	NC_018621	CTG	2	6	311472	311477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456483
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6578	NC_018621	AG	3	6	311848	311853	50 %	0 %	50 %	0 %	407456483
6579	NC_018621	CCTT	2	8	311927	311934	0 %	50 %	0 %	50 %	407456483
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6595	NC_018621	TAT	2	6	312489	312494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456483
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6599	NC_018621	G	10	10	312634	312643	0 %	0 %	100 %	0 %	407456484
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6605	NC_018621	AAAGA	2	10	312903	312912	80 %	0 %	20 %	0 %	407456484
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6611	NC_018621	TTCTGT	2	12	313116	313127	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407456484
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6615	NC_018621	CGA	2	6	313206	313211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456484
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6617	NC_018621	A	6	6	313293	313298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_018621	AG	3	6	313312	313317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_018621	GA	3	6	313362	313367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_018621	GAA	3	9	313418	313426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456485
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6997	NC_018621	TAT	2	6	330669	330674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456495
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