MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018621	T	6	6	236080	236085	0 %	100 %	0 %	0 %	407456414
5002	NC_018621	GC	3	6	236150	236155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_018621	GTCC	2	8	236202	236209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_018621	GTCT	2	8	236220	236227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_018621	T	6	6	236227	236232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018621	GAA	2	6	236373	236378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456415
5007	NC_018621	ACA	2	6	236403	236408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456415
5008	NC_018621	CAA	2	6	236410	236415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456415
5009	NC_018621	ACT	2	6	236423	236428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456415
5010	NC_018621	TCT	2	6	236438	236443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456415
5011	NC_018621	TTA	2	6	236454	236459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456415
5012	NC_018621	GTA	2	6	236461	236466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456415
5013	NC_018621	TC	4	8	236473	236480	0 %	50 %	0 %	50 %	407456415
5014	NC_018621	ATC	2	6	236497	236502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456415
5015	NC_018621	TCT	2	6	236619	236624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456415
5016	NC_018621	TG	4	8	236637	236644	0 %	50 %	50 %	0 %	407456415
5017	NC_018621	TC	4	8	236729	236736	0 %	50 %	0 %	50 %	407456415
5018	NC_018621	CTT	2	6	236796	236801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456415
5019	NC_018621	ATG	2	6	236811	236816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456415
5020	NC_018621	TGT	2	6	236846	236851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456415
5021	NC_018621	TGG	2	6	236875	236880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456415
5022	NC_018621	AG	3	6	236942	236947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_018621	AT	3	6	237012	237017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018621	CTA	2	6	237121	237126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_018621	CGA	2	6	237359	237364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456416
5026	NC_018621	TGC	2	6	237370	237375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456416
5027	NC_018621	T	6	6	237454	237459	0 %	100 %	0 %	0 %	407456416
5028	NC_018621	AAC	3	9	237529	237537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456416
5029	NC_018621	T	6	6	237544	237549	0 %	100 %	0 %	0 %	407456416
5030	NC_018621	GTT	2	6	237550	237555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456416
5031	NC_018621	TAA	2	6	237556	237561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456416
5032	NC_018621	TGC	2	6	237617	237622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456416
5033	NC_018621	CTT	2	6	237636	237641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456416
5034	NC_018621	ACT	2	6	237688	237693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456416
5035	NC_018621	CTTT	2	8	237713	237720	0 %	75 %	0 %	25 %	407456416
5036	NC_018621	TGC	2	6	237805	237810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456416
5037	NC_018621	CATC	2	8	237840	237847	25 %	25 %	0 %	50 %	407456416
5038	NC_018621	GCT	2	6	237857	237862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456416
5039	NC_018621	CTT	2	6	237918	237923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456416
5040	NC_018621	CGA	2	6	237974	237979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456416
5041	NC_018621	CATG	2	8	238098	238105	25 %	25 %	25 %	25 %	407456416
5042	NC_018621	CTTG	2	8	238116	238123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_018621	GAAT	2	8	238167	238174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_018621	GAA	3	9	238181	238189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_018621	T	6	6	238204	238209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_018621	AAG	2	6	238213	238218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_018621	T	7	7	238228	238234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018621	AAG	2	6	238267	238272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018621	ACC	2	6	238286	238291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_018621	AATT	2	8	238306	238313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018621	GAT	2	6	238347	238352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018621	TTTC	2	8	238406	238413	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5053	NC_018621	GTT	2	6	238434	238439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018621	A	8	8	238474	238481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018621	AGA	2	6	238515	238520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018621	GAG	2	6	238601	238606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456417
5057	NC_018621	T	6	6	238661	238666	0 %	100 %	0 %	0 %	407456417
5058	NC_018621	GTT	2	6	238717	238722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456417
5059	NC_018621	CT	3	6	238724	238729	0 %	50 %	0 %	50 %	407456417
5060	NC_018621	AGC	2	6	238777	238782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456417
5061	NC_018621	TTG	2	6	238785	238790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456417
5062	NC_018621	CTC	2	6	238874	238879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456417
5063	NC_018621	CTTT	2	8	238920	238927	0 %	75 %	0 %	25 %	407456417
5064	NC_018621	T	6	6	238925	238930	0 %	100 %	0 %	0 %	407456417
5065	NC_018621	AGA	2	6	239077	239082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456417
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5067	NC_018621	GCA	2	6	239121	239126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456417
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5069	NC_018621	TTG	2	6	239384	239389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456417
5070	NC_018621	GGA	2	6	239432	239437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456417
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5072	NC_018621	AAG	2	6	239533	239538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456417
5073	NC_018621	T	7	7	239561	239567	0 %	100 %	0 %	0 %	407456417
5074	NC_018621	ATTATA	2	12	239647	239658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_018621	A	6	6	239682	239687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_018621	CTT	2	6	239719	239724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_018621	TAT	2	6	239746	239751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_018621	ATAA	2	8	239787	239794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_018621	GA	3	6	239829	239834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_018621	A	6	6	239864	239869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_018621	GCA	2	6	239882	239887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_018621	GCA	2	6	239892	239897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_018621	CAA	2	6	239950	239955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456418
5084	NC_018621	GCTT	2	8	239965	239972	0 %	50 %	25 %	25 %	407456418
5085	NC_018621	AAT	2	6	239994	239999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456418
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5088	NC_018621	T	6	6	240108	240113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_018621	TCA	2	6	240115	240120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456419
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5092	NC_018621	A	6	6	240374	240379	100 %	0 %	0 %	0 %	407456419
5093	NC_018621	TAG	2	6	240480	240485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456419
5094	NC_018621	T	6	6	240584	240589	0 %	100 %	0 %	0 %	407456419
5095	NC_018621	AAAT	2	8	240603	240610	75 %	25 %	0 %	0 %	407456419
5096	NC_018621	TCT	2	6	240653	240658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456419
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5099	NC_018621	GTTT	2	8	240836	240843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_018621	TAG	2	6	240904	240909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_018621	A	7	7	240996	241002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_018621	AG	3	6	241038	241043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_018621	TAT	2	6	241054	241059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_018621	TCAT	2	8	241066	241073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_018621	ATA	2	6	241081	241086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_018621	CGT	2	6	241102	241107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456420
5107	NC_018621	GAA	2	6	241139	241144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456420
5108	NC_018621	ATC	2	6	241186	241191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456420
5109	NC_018621	TAT	2	6	241223	241228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
5110	NC_018621	GAG	2	6	241238	241243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456420
5111	NC_018621	GAT	2	6	241262	241267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
5112	NC_018621	TTCAG	2	10	241292	241301	20 %	40 %	20 %	20 %	407456420
5113	NC_018621	TTG	2	6	241367	241372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456420
5114	NC_018621	CAT	2	6	241484	241489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456420
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5117	NC_018621	AGG	2	6	241631	241636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456420
5118	NC_018621	TG	3	6	241689	241694	0 %	50 %	50 %	0 %	407456420
5119	NC_018621	ATT	2	6	241729	241734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
5120	NC_018621	TTC	2	6	241790	241795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456420
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5125	NC_018621	TTG	2	6	241906	241911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456420
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5127	NC_018621	ATG	2	6	242011	242016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
5128	NC_018621	ATG	2	6	242043	242048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
5129	NC_018621	GCA	2	6	242073	242078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456420
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5140	NC_018621	TTA	2	6	242538	242543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
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5174	NC_018621	T	7	7	244018	244024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5241	NC_018621	TCT	2	6	247511	247516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456426
5242	NC_018621	ATC	2	6	247543	247548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456426
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5244	NC_018621	T	6	6	247655	247660	0 %	100 %	0 %	0 %	407456427
5245	NC_018621	AAT	2	6	247749	247754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456427
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5247	NC_018621	AAG	2	6	247793	247798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_018621	ATA	2	6	247892	247897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456428
5249	NC_018621	TAC	2	6	247981	247986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456428
5250	NC_018621	GAA	2	6	247994	247999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456428
5251	NC_018621	TTGAG	2	10	248040	248049	20 %	40 %	40 %	0 %	407456428
5252	NC_018621	GTT	2	6	248106	248111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456428
5253	NC_018621	GAT	2	6	248156	248161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456428
5254	NC_018621	GA	3	6	248210	248215	50 %	0 %	50 %	0 %	407456428
5255	NC_018621	TATT	2	8	248226	248233	25 %	75 %	0 %	0 %	407456428
5256	NC_018621	GAA	2	6	248282	248287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456428
5257	NC_018621	ATC	2	6	248306	248311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456428
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5259	NC_018621	CTT	2	6	248416	248421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456428
5260	NC_018621	TTCT	2	8	248428	248435	0 %	75 %	0 %	25 %	407456428
5261	NC_018621	AAC	2	6	248437	248442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456428
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5265	NC_018621	ATTT	2	8	248617	248624	25 %	75 %	0 %	0 %	407456428
5266	NC_018621	CTT	2	6	248653	248658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456428
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5273	NC_018621	AG	3	6	249080	249085	50 %	0 %	50 %	0 %	407456428
5274	NC_018621	T	6	6	249168	249173	0 %	100 %	0 %	0 %	407456428
5275	NC_018621	ACG	2	6	249174	249179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456428
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5279	NC_018621	TAACA	2	10	249664	249673	60 %	20 %	0 %	20 %	407456428
5280	NC_018621	ACA	2	6	249692	249697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456428
5281	NC_018621	TGG	2	6	249899	249904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456429
5282	NC_018621	CAG	2	6	250062	250067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456429
5283	NC_018621	CTT	2	6	250080	250085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456429
5284	NC_018621	AAT	2	6	250106	250111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_018621	T	6	6	250164	250169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_018621	GA	3	6	250225	250230	50 %	0 %	50 %	0 %	407456430
5287	NC_018621	CTT	2	6	250232	250237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456430
5288	NC_018621	T	6	6	250236	250241	0 %	100 %	0 %	0 %	407456430
5289	NC_018621	TCC	2	6	250364	250369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456430
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5293	NC_018621	TCT	2	6	250485	250490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456430
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5304	NC_018621	TA	3	6	251099	251104	50 %	50 %	0 %	0 %	407456430
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5310	NC_018621	T	8	8	251408	251415	0 %	100 %	0 %	0 %	407456431
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5331	NC_018621	AAT	2	6	252256	252261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5332	NC_018621	T	8	8	252272	252279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5333	NC_018621	AGG	2	6	252340	252345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456434
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5352	NC_018621	T	6	6	253104	253109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_018621	T	6	6	253125	253130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_018621	A	7	7	253133	253139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_018621	T	6	6	253140	253145	0 %	100 %	0 %	0 %	407456435
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5364	NC_018621	ATT	2	6	253715	253720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456435
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5367	NC_018621	T	7	7	253763	253769	0 %	100 %	0 %	0 %	407456436
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5369	NC_018621	TTGA	2	8	253833	253840	25 %	50 %	25 %	0 %	407456436
5370	NC_018621	AG	3	6	253854	253859	50 %	0 %	50 %	0 %	407456436
5371	NC_018621	AGG	2	6	253893	253898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456436
5372	NC_018621	ATC	2	6	253902	253907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456436
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