MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 24352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018620	GCT	2	6	237806	237811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455047
5002	NC_018620	CTT	2	6	237867	237872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455047
5003	NC_018620	CGA	2	6	237923	237928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455047
5004	NC_018620	CATG	2	8	238047	238054	25 %	25 %	25 %	25 %	407455047
5005	NC_018620	CTTG	2	8	238065	238072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_018620	GAAT	2	8	238115	238122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018620	GAA	3	9	238129	238137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_018620	T	6	6	238152	238157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_018620	AAG	2	6	238161	238166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_018620	T	7	7	238176	238182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_018620	CAC	2	6	238233	238238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_018620	GAT	2	6	238295	238300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_018620	TTTC	2	8	238354	238361	0 %	75 %	0 %	25 %	407455048
5014	NC_018620	GTT	2	6	238382	238387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455048
5015	NC_018620	A	6	6	238422	238427	100 %	0 %	0 %	0 %	407455048
5016	NC_018620	ATA	2	6	238446	238451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_018620	AGA	2	6	238461	238466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018620	CT	3	6	238502	238507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_018620	AGCG	2	8	238514	238521	25 %	0 %	50 %	25 %	407455049
5020	NC_018620	GAG	2	6	238547	238552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455049
5021	NC_018620	AGCG	2	8	238573	238580	25 %	0 %	50 %	25 %	407455049
5022	NC_018620	TGA	2	6	238620	238625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455049
5023	NC_018620	AAT	2	6	238642	238647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455049
5024	NC_018620	CGA	2	6	238694	238699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455049
5025	NC_018620	AGC	2	6	238723	238728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455049
5026	NC_018620	CTTT	2	8	238866	238873	0 %	75 %	0 %	25 %	407455049
5027	NC_018620	T	6	6	238871	238876	0 %	100 %	0 %	0 %	407455049
5028	NC_018620	GATT	2	8	239034	239041	25 %	50 %	25 %	0 %	407455049
5029	NC_018620	GCA	2	6	239067	239072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455049
5030	NC_018620	TGGTG	2	10	239165	239174	0 %	40 %	60 %	0 %	407455049
5031	NC_018620	GACT	2	8	239242	239249	25 %	25 %	25 %	25 %	407455049
5032	NC_018620	AAG	2	6	239250	239255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455049
5033	NC_018620	TTG	2	6	239330	239335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455049
5034	NC_018620	AAG	2	6	239479	239484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455049
5035	NC_018620	T	7	7	239507	239513	0 %	100 %	0 %	0 %	407455049
5036	NC_018620	AATTAT	2	12	239592	239603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018620	TAAT	2	8	239616	239623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_018620	A	6	6	239629	239634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018620	TTC	3	9	239660	239668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_018620	T	6	6	239669	239674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018620	AAG	2	6	239696	239701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018620	ATAA	2	8	239733	239740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018620	AT	3	6	239778	239783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_018620	A	6	6	239810	239815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_018620	GCA	2	6	239828	239833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_018620	TGA	2	6	239863	239868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_018620	ATG	2	6	239871	239876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018620	ATG	2	6	239883	239888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455050
5049	NC_018620	ACA	3	9	239895	239903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455050
5050	NC_018620	GA	3	6	240031	240036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018620	T	6	6	240055	240060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018620	TCA	2	6	240062	240067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455051
5053	NC_018620	T	7	7	240084	240090	0 %	100 %	0 %	0 %	407455051
5054	NC_018620	GAT	2	6	240106	240111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455051
5055	NC_018620	AG	3	6	240251	240256	50 %	0 %	50 %	0 %	407455051
5056	NC_018620	A	6	6	240296	240301	100 %	0 %	0 %	0 %	407455051
5057	NC_018620	A	6	6	240321	240326	100 %	0 %	0 %	0 %	407455051
5058	NC_018620	T	6	6	240531	240536	0 %	100 %	0 %	0 %	407455051
5059	NC_018620	AGCGT	2	10	240617	240626	20 %	20 %	40 %	20 %	407455051
5060	NC_018620	GAG	2	6	240631	240636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455051
5061	NC_018620	CTT	2	6	240639	240644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455051
5062	NC_018620	GTA	2	6	240683	240688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455051
5063	NC_018620	GTTT	2	8	240783	240790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_018620	TAC	2	6	240838	240843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_018620	GAG	2	6	240871	240876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018620	A	6	6	240943	240948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_018620	AG	3	6	240984	240989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_018620	TAT	2	6	241000	241005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_018620	ATA	2	6	241027	241032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018620	TTG	2	6	241053	241058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455052
5071	NC_018620	GAA	2	6	241085	241090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455052
5072	NC_018620	ATC	2	6	241132	241137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455052
5073	NC_018620	GAT	2	6	241208	241213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455052
5074	NC_018620	TTCAG	2	10	241238	241247	20 %	40 %	20 %	20 %	407455052
5075	NC_018620	TTG	2	6	241313	241318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455052
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5077	NC_018620	TTA	2	6	241422	241427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455052
5078	NC_018620	ATT	2	6	241440	241445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455052
5079	NC_018620	TG	3	6	241635	241640	0 %	50 %	50 %	0 %	407455052
5080	NC_018620	ATT	2	6	241675	241680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455052
5081	NC_018620	TTC	2	6	241736	241741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455052
5082	NC_018620	AGA	2	6	241749	241754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455052
5083	NC_018620	TGA	2	6	241784	241789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455052
5084	NC_018620	CTGGT	2	10	241828	241837	0 %	40 %	40 %	20 %	407455052
5085	NC_018620	ATT	2	6	241887	241892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455052
5086	NC_018620	ATG	2	6	241957	241962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455052
5087	NC_018620	TGA	2	6	241987	241992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455052
5088	NC_018620	AAG	2	6	242041	242046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455052
5089	NC_018620	GCTT	2	8	242134	242141	0 %	50 %	25 %	25 %	407455052
5090	NC_018620	ATACC	2	10	242251	242260	40 %	20 %	0 %	40 %	407455052
5091	NC_018620	AAC	2	6	242318	242323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455052
5092	NC_018620	TGA	2	6	242339	242344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455052
5093	NC_018620	GAA	2	6	242349	242354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455052
5094	NC_018620	ATT	2	6	242364	242369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455052
5095	NC_018620	GAA	2	6	242457	242462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455052
5096	NC_018620	TTA	2	6	242484	242489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455052
5097	NC_018620	TTTAG	2	10	242528	242537	20 %	60 %	20 %	0 %	407455052
5098	NC_018620	TGT	2	6	242548	242553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_018620	AG	3	6	242598	242603	50 %	0 %	50 %	0 %	407455053
5100	NC_018620	T	7	7	242629	242635	0 %	100 %	0 %	0 %	407455053
5101	NC_018620	GCA	2	6	242659	242664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455053
5102	NC_018620	AAG	2	6	242674	242679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455053
5103	NC_018620	TAAT	2	8	242726	242733	50 %	50 %	0 %	0 %	407455053
5104	NC_018620	ATG	2	6	242785	242790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455053
5105	NC_018620	ACT	2	6	242803	242808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455053
5106	NC_018620	GCT	2	6	242824	242829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455053
5107	NC_018620	CGT	2	6	242869	242874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455053
5108	NC_018620	CTC	2	6	242882	242887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455053
5109	NC_018620	GAA	2	6	242982	242987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455053
5110	NC_018620	ATCG	2	8	243049	243056	25 %	25 %	25 %	25 %	407455053
5111	NC_018620	CAG	2	6	243071	243076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455053
5112	NC_018620	TTA	2	6	243097	243102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455053
5113	NC_018620	AAT	2	6	243199	243204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455054
5114	NC_018620	TTC	2	6	243249	243254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455054
5115	NC_018620	CTT	2	6	243255	243260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455054
5116	NC_018620	CTG	2	6	243264	243269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455054
5117	NC_018620	TTA	2	6	243279	243284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455054
5118	NC_018620	ATG	2	6	243291	243296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455054
5119	NC_018620	TG	3	6	243315	243320	0 %	50 %	50 %	0 %	407455054
5120	NC_018620	GTTGT	2	10	243333	243342	0 %	60 %	40 %	0 %	407455054
5121	NC_018620	A	6	6	243365	243370	100 %	0 %	0 %	0 %	407455054
5122	NC_018620	GGTA	2	8	243398	243405	25 %	25 %	50 %	0 %	407455054
5123	NC_018620	GTT	2	6	243434	243439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455054
5124	NC_018620	CA	4	8	243486	243493	50 %	0 %	0 %	50 %	407455054
5125	NC_018620	TTG	2	6	243546	243551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455054
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5127	NC_018620	GCG	2	6	243743	243748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407455054
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