MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018619	AAC	2	6	166131	166136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453648
3502	NC_018619	TGT	2	6	166215	166220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453648
3503	NC_018619	CGAG	2	8	166224	166231	25 %	0 %	50 %	25 %	407453648
3504	NC_018619	GAA	2	6	166243	166248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453648
3505	NC_018619	GAT	2	6	166311	166316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453648
3506	NC_018619	GTG	2	6	166367	166372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453648
3507	NC_018619	GAG	2	6	166387	166392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453648
3508	NC_018619	AAATG	2	10	166422	166431	60 %	20 %	20 %	0 %	407453648
3509	NC_018619	CTT	2	6	166582	166587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453648
3510	NC_018619	AAGAGA	2	12	166622	166633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453648
3511	NC_018619	GAA	2	6	166696	166701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453648
3512	NC_018619	AAT	2	6	166723	166728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453648
3513	NC_018619	TCT	2	6	166740	166745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453648
3514	NC_018619	AGC	2	6	166835	166840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453648
3515	NC_018619	G	6	6	166920	166925	0 %	0 %	100 %	0 %	407453648
3516	NC_018619	TGA	2	6	166992	166997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453648
3517	NC_018619	AAC	2	6	167018	167023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453648
3518	NC_018619	TTGC	2	8	167025	167032	0 %	50 %	25 %	25 %	407453648
3519	NC_018619	TTC	2	6	167041	167046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453648
3520	NC_018619	AC	3	6	167261	167266	50 %	0 %	0 %	50 %	407453648
3521	NC_018619	TC	3	6	167285	167290	0 %	50 %	0 %	50 %	407453648
3522	NC_018619	GGA	2	6	167317	167322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453648
3523	NC_018619	GAA	2	6	167344	167349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453648
3524	NC_018619	TTC	2	6	167356	167361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453648
3525	NC_018619	AGC	2	6	167439	167444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453648
3526	NC_018619	TCG	2	6	167510	167515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453648
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3528	NC_018619	TCT	2	6	167602	167607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453648
3529	NC_018619	CAAC	2	8	167641	167648	50 %	0 %	0 %	50 %	407453648
3530	NC_018619	TGT	2	6	167812	167817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453649
3531	NC_018619	A	6	6	167819	167824	100 %	0 %	0 %	0 %	407453649
3532	NC_018619	GT	3	6	167894	167899	0 %	50 %	50 %	0 %	407453649
3533	NC_018619	GCA	2	6	167933	167938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453649
3534	NC_018619	T	6	6	167939	167944	0 %	100 %	0 %	0 %	407453649
3535	NC_018619	TAC	2	6	167956	167961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453649
3536	NC_018619	ATTC	2	8	167965	167972	25 %	50 %	0 %	25 %	407453649
3537	NC_018619	ATA	2	6	168045	168050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453649
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3539	NC_018619	A	8	8	168066	168073	100 %	0 %	0 %	0 %	407453649
3540	NC_018619	TGA	2	6	168188	168193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453649
3541	NC_018619	GGGGA	2	10	168197	168206	20 %	0 %	80 %	0 %	407453649
3542	NC_018619	TTC	2	6	168208	168213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453649
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3544	NC_018619	T	6	6	168389	168394	0 %	100 %	0 %	0 %	407453649
3545	NC_018619	T	6	6	168428	168433	0 %	100 %	0 %	0 %	407453649
3546	NC_018619	GAAG	2	8	168461	168468	50 %	0 %	50 %	0 %	407453649
3547	NC_018619	AAAG	2	8	168499	168506	75 %	0 %	25 %	0 %	407453649
3548	NC_018619	A	6	6	168515	168520	100 %	0 %	0 %	0 %	407453649
3549	NC_018619	TG	3	6	168674	168679	0 %	50 %	50 %	0 %	407453649
3550	NC_018619	GAA	2	6	168713	168718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_018619	GTT	2	6	168733	168738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453650
3552	NC_018619	T	7	7	168758	168764	0 %	100 %	0 %	0 %	407453650
3553	NC_018619	TGA	2	6	168805	168810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453650
3554	NC_018619	AGA	2	6	168915	168920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453650
3555	NC_018619	T	7	7	168922	168928	0 %	100 %	0 %	0 %	407453650
3556	NC_018619	CTG	2	6	168929	168934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453650
3557	NC_018619	CTTT	2	8	169009	169016	0 %	75 %	0 %	25 %	407453650
3558	NC_018619	T	9	9	169014	169022	0 %	100 %	0 %	0 %	407453650
3559	NC_018619	A	8	8	169085	169092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_018619	TTA	2	6	169105	169110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_018619	A	6	6	169119	169124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_018619	A	6	6	169130	169135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_018619	TTTTC	2	10	169246	169255	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3564	NC_018619	TAA	2	6	169256	169261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_018619	TTG	2	6	169313	169318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_018619	ACA	2	6	169331	169336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_018619	AGT	2	6	169349	169354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_018619	GTA	2	6	169414	169419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3571	NC_018619	A	6	6	169572	169577	100 %	0 %	0 %	0 %	407453651
3572	NC_018619	ACA	2	6	169592	169597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453651
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3575	NC_018619	AG	3	6	169714	169719	50 %	0 %	50 %	0 %	407453651
3576	NC_018619	CTGTT	2	10	169724	169733	0 %	60 %	20 %	20 %	407453651
3577	NC_018619	AATGA	2	10	169759	169768	60 %	20 %	20 %	0 %	407453651
3578	NC_018619	TTG	2	6	169787	169792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453651
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3581	NC_018619	TAA	2	6	169966	169971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453651
3582	NC_018619	GTT	2	6	170003	170008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_018619	TAGT	2	8	170068	170075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_018619	T	6	6	170136	170141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_018619	TAC	2	6	170178	170183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_018619	ATT	2	6	170245	170250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_018619	T	6	6	170318	170323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_018619	TTCC	2	8	170380	170387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_018619	AGA	2	6	170402	170407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_018619	T	6	6	170408	170413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_018619	AGT	2	6	170447	170452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_018619	AAG	2	6	170599	170604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_018619	GGT	2	6	170612	170617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_018619	TAT	2	6	170690	170695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_018619	TAT	2	6	170742	170747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453652
3596	NC_018619	TCT	2	6	170751	170756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453652
3597	NC_018619	GCT	2	6	170847	170852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453652
3598	NC_018619	GGC	2	6	170853	170858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407453652
3599	NC_018619	AGG	2	6	170903	170908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453652
3600	NC_018619	CTA	2	6	170919	170924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453652
3601	NC_018619	GAT	2	6	170987	170992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453652
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3603	NC_018619	AAG	2	6	171076	171081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453652
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3605	NC_018619	GAT	2	6	171139	171144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453652
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3608	NC_018619	T	8	8	171310	171317	0 %	100 %	0 %	0 %	407453652
3609	NC_018619	AGA	2	6	171407	171412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453652
3610	NC_018619	CTT	2	6	171463	171468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453652
3611	NC_018619	GA	3	6	171474	171479	50 %	0 %	50 %	0 %	407453652
3612	NC_018619	TCT	2	6	171575	171580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453653
3613	NC_018619	ATC	2	6	171658	171663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453653
3614	NC_018619	TC	3	6	171676	171681	0 %	50 %	0 %	50 %	407453653
3615	NC_018619	GTT	2	6	171786	171791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453653
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3617	NC_018619	GATA	2	8	171873	171880	50 %	25 %	25 %	0 %	407453653
3618	NC_018619	TTG	2	6	171925	171930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453653
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3622	NC_018619	ACA	2	6	172199	172204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453654
3623	NC_018619	AGG	2	6	172211	172216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453654
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3626	NC_018619	CAGG	2	8	172471	172478	25 %	0 %	50 %	25 %	407453654
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3999	NC_018619	CAG	2	6	190221	190226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453672
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