MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018619	TCCT	2	8	143305	143312	0 %	50 %	0 %	50 %	407453623
3002	NC_018619	GTT	2	6	143326	143331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453623
3003	NC_018619	AGAAA	2	10	143336	143345	80 %	0 %	20 %	0 %	407453623
3004	NC_018619	ATT	2	6	143348	143353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453623
3005	NC_018619	TAC	2	6	143366	143371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453623
3006	NC_018619	TGA	2	6	143510	143515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453623
3007	NC_018619	TAC	2	6	143545	143550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453623
3008	NC_018619	CAG	2	6	143554	143559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453623
3009	NC_018619	TTG	3	9	143614	143622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453623
3010	NC_018619	TA	3	6	143677	143682	50 %	50 %	0 %	0 %	407453623
3011	NC_018619	ATG	2	6	143785	143790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453623
3012	NC_018619	TAT	2	6	143804	143809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453623
3013	NC_018619	ATT	2	6	143856	143861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453623
3014	NC_018619	TAG	2	6	143893	143898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453623
3015	NC_018619	TTC	2	6	143899	143904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453623
3016	NC_018619	GTG	2	6	143905	143910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453623
3017	NC_018619	AGA	2	6	143911	143916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453623
3018	NC_018619	TTG	2	6	143922	143927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453623
3019	NC_018619	TTA	2	6	144021	144026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453624
3020	NC_018619	AAT	2	6	144058	144063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453624
3021	NC_018619	GAG	2	6	144087	144092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453624
3022	NC_018619	TCTA	2	8	144130	144137	25 %	50 %	0 %	25 %	407453624
3023	NC_018619	T	6	6	144223	144228	0 %	100 %	0 %	0 %	407453624
3024	NC_018619	TTG	2	6	144258	144263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453624
3025	NC_018619	ATA	2	6	144423	144428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453624
3026	NC_018619	CAG	2	6	144431	144436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453624
3027	NC_018619	TAG	2	6	144441	144446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453624
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3029	NC_018619	CAA	2	6	144621	144626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453624
3030	NC_018619	TGT	2	6	144653	144658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453624
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3032	NC_018619	T	7	7	144814	144820	0 %	100 %	0 %	0 %	407453624
3033	NC_018619	AAT	2	6	144834	144839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453625
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3035	NC_018619	GGAA	3	12	144854	144865	50 %	0 %	50 %	0 %	407453625
3036	NC_018619	TCC	2	6	144866	144871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453625
3037	NC_018619	AGTA	2	8	144887	144894	50 %	25 %	25 %	0 %	407453625
3038	NC_018619	A	7	7	144903	144909	100 %	0 %	0 %	0 %	407453625
3039	NC_018619	TAT	2	6	144980	144985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_018619	TAA	2	6	144987	144992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_018619	AAT	2	6	145073	145078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_018619	A	7	7	145106	145112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_018619	TAT	2	6	145170	145175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_018619	T	6	6	145207	145212	0 %	100 %	0 %	0 %	407453626
3045	NC_018619	T	6	6	145257	145262	0 %	100 %	0 %	0 %	407453626
3046	NC_018619	TGTC	2	8	145274	145281	0 %	50 %	25 %	25 %	407453626
3047	NC_018619	TTG	2	6	145282	145287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453626
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3049	NC_018619	TTTA	2	8	145364	145371	25 %	75 %	0 %	0 %	407453626
3050	NC_018619	TTG	2	6	145387	145392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453626
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3052	NC_018619	TTC	2	6	145483	145488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453626
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3057	NC_018619	TCC	2	6	145715	145720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453626
3058	NC_018619	T	6	6	145752	145757	0 %	100 %	0 %	0 %	407453626
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3062	NC_018619	AAAGA	2	10	146000	146009	80 %	0 %	20 %	0 %	407453626
3063	NC_018619	AAG	2	6	146016	146021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453626
3064	NC_018619	ATA	2	6	146056	146061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453626
3065	NC_018619	TTAT	2	8	146082	146089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_018619	TTAT	2	8	146117	146124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_018619	GTAA	2	8	146138	146145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3070	NC_018619	CTTT	2	8	146375	146382	0 %	75 %	0 %	25 %	407453627
3071	NC_018619	CTT	2	6	146402	146407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453627
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3080	NC_018619	AAG	2	6	146794	146799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_018619	T	6	6	146804	146809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_018619	TCA	2	6	146854	146859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453629
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3088	NC_018619	CTC	2	6	147146	147151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_018619	GAG	2	6	147181	147186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_018619	T	6	6	147190	147195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_018619	AT	3	6	147201	147206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_018619	A	6	6	147226	147231	100 %	0 %	0 %	0 %	407453630
3093	NC_018619	TTG	2	6	147247	147252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453630
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3096	NC_018619	TTTA	2	8	147412	147419	25 %	75 %	0 %	0 %	407453631
3097	NC_018619	AATA	2	8	147467	147474	75 %	25 %	0 %	0 %	407453631
3098	NC_018619	AGT	2	6	147484	147489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_018619	ATTT	3	12	147525	147536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_018619	T	6	6	147581	147586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018619	ATT	2	6	147595	147600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_018619	T	6	6	147605	147610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_018619	T	7	7	147689	147695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_018619	ACA	2	6	147705	147710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_018619	A	6	6	147726	147731	100 %	0 %	0 %	0 %	407453632
3106	NC_018619	CTT	2	6	147744	147749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453632
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3108	NC_018619	TGA	2	6	147788	147793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453632
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3110	NC_018619	AAG	2	6	147847	147852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453632
3111	NC_018619	CAT	3	9	147870	147878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453632
3112	NC_018619	TGA	2	6	147897	147902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_018619	G	6	6	147907	147912	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_018619	C	6	6	147913	147918	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3115	NC_018619	CAT	2	6	147935	147940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_018619	TTCCGT	2	12	148015	148026	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_018619	T	6	6	148068	148073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_018619	TTTTA	2	10	148179	148188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_018619	T	6	6	148191	148196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018619	ATT	2	6	148252	148257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_018619	TAA	2	6	148262	148267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_018619	AGA	2	6	148268	148273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_018619	GAA	2	6	148401	148406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018619	CAC	2	6	148460	148465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_018619	CAA	2	6	148551	148556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_018619	TAAG	2	8	148591	148598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_018619	T	7	7	148636	148642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3375	NC_018619	CGA	2	6	160841	160846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453642
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