MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_018619	AAG	2	6	805430	805435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454254
17003	NC_018619	TC	3	6	805518	805523	0 %	50 %	0 %	50 %	407454254
17004	NC_018619	CAA	2	6	805528	805533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454254
17005	NC_018619	CTC	2	6	805561	805566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454254
17006	NC_018619	TAC	2	6	805583	805588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454254
17007	NC_018619	ATC	2	6	805673	805678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454254
17008	NC_018619	GAT	2	6	805754	805759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454254
17009	NC_018619	TCT	2	6	805782	805787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454254
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17011	NC_018619	TTTG	2	8	805917	805924	0 %	75 %	25 %	0 %	407454254
17012	NC_018619	AAC	2	6	805949	805954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454254
17013	NC_018619	AGC	2	6	805976	805981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454254
17014	NC_018619	TTC	2	6	806099	806104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454254
17015	NC_018619	CTG	2	6	806152	806157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454254
17016	NC_018619	GCTT	2	8	806339	806346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17017	NC_018619	CAA	2	6	806530	806535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_018619	TCT	2	6	806664	806669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17019	NC_018619	T	7	7	806669	806675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_018619	ATTA	2	8	806683	806690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_018619	GCA	3	9	806803	806811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_018619	ATAG	2	8	806848	806855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_018619	A	6	6	806868	806873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_018619	ATTG	2	8	806876	806883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_018619	TAC	2	6	806907	806912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_018619	TTTAC	2	10	806934	806943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17027	NC_018619	TAA	2	6	806966	806971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_018619	TCT	2	6	806984	806989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454255
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17030	NC_018619	TCT	2	6	807131	807136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454255
17031	NC_018619	CCCTC	2	10	807139	807148	0 %	20 %	0 %	80 %	407454255
17032	NC_018619	TC	3	6	807147	807152	0 %	50 %	0 %	50 %	407454255
17033	NC_018619	TGA	2	6	807153	807158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454255
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17035	NC_018619	AT	3	6	807253	807258	50 %	50 %	0 %	0 %	407454255
17036	NC_018619	CTTG	2	8	807272	807279	0 %	50 %	25 %	25 %	407454255
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17039	NC_018619	TGA	2	6	807432	807437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454255
17040	NC_018619	CAG	2	6	807449	807454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454255
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17042	NC_018619	TTC	2	6	807508	807513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454255
17043	NC_018619	TGCA	2	8	807556	807563	25 %	25 %	25 %	25 %	407454255
17044	NC_018619	GAC	2	6	807614	807619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454255
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17046	NC_018619	CAA	2	6	807743	807748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454255
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17052	NC_018619	TGT	2	6	808064	808069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454256
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17054	NC_018619	T	6	6	808201	808206	0 %	100 %	0 %	0 %	407454256
17055	NC_018619	TCT	2	6	808228	808233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454256
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17059	NC_018619	CTTG	2	8	808429	808436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17060	NC_018619	CT	3	6	808550	808555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17061	NC_018619	CAA	2	6	808563	808568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_018619	TCA	2	6	808597	808602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17063	NC_018619	AGT	2	6	808614	808619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_018619	TCA	2	6	808624	808629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17065	NC_018619	CAA	2	6	808727	808732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17066	NC_018619	AAT	2	6	808879	808884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_018619	TTAA	2	8	808938	808945	50 %	50 %	0 %	0 %	407454257
17068	NC_018619	ACTGC	2	10	808965	808974	20 %	20 %	20 %	40 %	407454257
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17102	NC_018619	CTC	2	6	810059	810064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454258
17103	NC_018619	AGT	2	6	810082	810087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454258
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17105	NC_018619	AAT	2	6	810201	810206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454258
17106	NC_018619	CAA	2	6	810215	810220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454258
17107	NC_018619	A	6	6	810224	810229	100 %	0 %	0 %	0 %	407454258
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17110	NC_018619	AATAT	2	10	810332	810341	60 %	40 %	0 %	0 %	407454258
17111	NC_018619	A	6	6	810416	810421	100 %	0 %	0 %	0 %	407454258
17112	NC_018619	GTT	2	6	810497	810502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454258
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17119	NC_018619	CAAA	2	8	810839	810846	75 %	0 %	0 %	25 %	407454258
17120	NC_018619	AAACC	2	10	810866	810875	60 %	0 %	0 %	40 %	407454258
17121	NC_018619	AGCA	2	8	810891	810898	50 %	0 %	25 %	25 %	407454258
17122	NC_018619	TCAA	2	8	810918	810925	50 %	25 %	0 %	25 %	407454258
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17373	NC_018619	GTT	2	6	822154	822159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454270
17374	NC_018619	CTA	2	6	822224	822229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454270
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