MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018619	CTT	2	6	661402	661407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454129
14002	NC_018619	TCA	2	6	661421	661426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_018619	ACA	2	6	661480	661485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_018619	ATT	2	6	661506	661511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_018619	TAT	2	6	661519	661524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_018619	AAT	2	6	661528	661533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_018619	GCT	2	6	661550	661555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_018619	TG	3	6	661590	661595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_018619	GTC	2	6	661681	661686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_018619	A	6	6	661698	661703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_018619	AG	3	6	661715	661720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_018619	TA	3	6	661771	661776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_018619	AAATAC	2	12	661782	661793	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14014	NC_018619	ATA	2	6	661833	661838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454130
14015	NC_018619	TGA	2	6	661942	661947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454130
14016	NC_018619	ATT	2	6	661976	661981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454130
14017	NC_018619	GT	3	6	662040	662045	0 %	50 %	50 %	0 %	407454130
14018	NC_018619	AAT	2	6	662104	662109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454130
14019	NC_018619	TCA	2	6	662178	662183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454130
14020	NC_018619	AGA	2	6	662207	662212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454130
14021	NC_018619	TGC	2	6	662221	662226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454130
14022	NC_018619	AACTG	2	10	662256	662265	40 %	20 %	20 %	20 %	407454130
14023	NC_018619	A	6	6	662282	662287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_018619	AAT	2	6	662299	662304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_018619	TTA	2	6	662322	662327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_018619	TAA	2	6	662344	662349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_018619	CAATCT	2	12	662368	662379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_018619	TAG	2	6	662382	662387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_018619	CATT	2	8	662397	662404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14030	NC_018619	TAA	2	6	662435	662440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454131
14031	NC_018619	TAA	2	6	662447	662452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454131
14032	NC_018619	CAA	2	6	662470	662475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454131
14033	NC_018619	TTCCG	2	10	662493	662502	0 %	40 %	20 %	40 %	407454131
14034	NC_018619	A	6	6	662601	662606	100 %	0 %	0 %	0 %	407454131
14035	NC_018619	GAT	2	6	662717	662722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454131
14036	NC_018619	TTAGGG	2	12	662730	662741	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407454131
14037	NC_018619	TTC	2	6	662746	662751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454131
14038	NC_018619	AT	3	6	662782	662787	50 %	50 %	0 %	0 %	407454131
14039	NC_018619	GAA	2	6	662792	662797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454131
14040	NC_018619	CTG	3	9	662807	662815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454131
14041	NC_018619	CAA	2	6	662854	662859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454131
14042	NC_018619	GAT	2	6	662874	662879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454131
14043	NC_018619	CCA	2	6	662908	662913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454131
14044	NC_018619	ATT	2	6	663044	663049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454131
14045	NC_018619	GAA	2	6	663081	663086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454131
14046	NC_018619	TC	3	6	663103	663108	0 %	50 %	0 %	50 %	407454131
14047	NC_018619	TAG	2	6	663121	663126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454131
14048	NC_018619	GAGTA	2	10	663152	663161	40 %	20 %	40 %	0 %	407454131
14049	NC_018619	ACT	2	6	663165	663170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454131
14050	NC_018619	CTT	2	6	663184	663189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454131
14051	NC_018619	TAT	2	6	663290	663295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_018619	TGA	2	6	663298	663303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_018619	AAGAG	2	10	663316	663325	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_018619	TAA	2	6	663430	663435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454132
14055	NC_018619	AAAT	2	8	663442	663449	75 %	25 %	0 %	0 %	407454132
14056	NC_018619	GAT	2	6	663530	663535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454132
14057	NC_018619	ATA	2	6	663641	663646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454132
14058	NC_018619	AC	3	6	663654	663659	50 %	0 %	0 %	50 %	407454132
14059	NC_018619	TAA	2	6	663671	663676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454132
14060	NC_018619	GTA	2	6	663683	663688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454132
14061	NC_018619	CAA	2	6	663711	663716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454132
14062	NC_018619	TCC	2	6	663769	663774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454133
14063	NC_018619	GATAA	2	10	663837	663846	60 %	20 %	20 %	0 %	407454133
14064	NC_018619	CAA	2	6	663851	663856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454133
14065	NC_018619	T	8	8	663910	663917	0 %	100 %	0 %	0 %	407454133
14066	NC_018619	TCAG	2	8	664003	664010	25 %	25 %	25 %	25 %	407454133
14067	NC_018619	GAG	2	6	664025	664030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454133
14068	NC_018619	CTC	2	6	664047	664052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454133
14069	NC_018619	ATG	2	6	664119	664124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454133
14070	NC_018619	AC	3	6	664127	664132	50 %	0 %	0 %	50 %	407454133
14071	NC_018619	CTT	2	6	664218	664223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454133
14072	NC_018619	T	6	6	664222	664227	0 %	100 %	0 %	0 %	407454133
14073	NC_018619	A	6	6	664414	664419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_018619	TCTTA	2	10	664464	664473	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14075	NC_018619	CA	3	6	664481	664486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14076	NC_018619	AAATA	2	10	664495	664504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_018619	A	7	7	664504	664510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_018619	T	6	6	664527	664532	0 %	100 %	0 %	0 %	407454134
14079	NC_018619	AAG	2	6	664538	664543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454134
14080	NC_018619	CT	4	8	664549	664556	0 %	50 %	0 %	50 %	407454134
14081	NC_018619	A	6	6	664598	664603	100 %	0 %	0 %	0 %	407454134
14082	NC_018619	TCATTC	2	12	664617	664628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407454134
14083	NC_018619	AGAA	2	8	664634	664641	75 %	0 %	25 %	0 %	407454134
14084	NC_018619	T	7	7	664711	664717	0 %	100 %	0 %	0 %	407454134
14085	NC_018619	ATT	2	6	664747	664752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454134
14086	NC_018619	GCAT	2	8	664841	664848	25 %	25 %	25 %	25 %	407454134
14087	NC_018619	TTCT	2	8	664849	664856	0 %	75 %	0 %	25 %	407454134
14088	NC_018619	TTTGG	2	10	664872	664881	0 %	60 %	40 %	0 %	407454134
14089	NC_018619	TC	3	6	664902	664907	0 %	50 %	0 %	50 %	407454134
14090	NC_018619	TGT	2	6	664981	664986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454134
14091	NC_018619	TCC	2	6	664993	664998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454134
14092	NC_018619	TCT	2	6	665060	665065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454134
14093	NC_018619	GGA	2	6	665066	665071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454134
14094	NC_018619	GCT	2	6	665078	665083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454134
14095	NC_018619	TTA	2	6	665099	665104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454134
14096	NC_018619	AGT	2	6	665156	665161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454134
14097	NC_018619	CTT	2	6	665173	665178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454134
14098	NC_018619	ATG	3	9	665189	665197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454134
14099	NC_018619	TTG	2	6	665214	665219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454134
14100	NC_018619	CT	4	8	665222	665229	0 %	50 %	0 %	50 %	407454134
14101	NC_018619	GGA	2	6	665234	665239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454134
14102	NC_018619	CGT	2	6	665243	665248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454134
14103	NC_018619	GTC	2	6	665267	665272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454134
14104	NC_018619	CCA	2	6	665298	665303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454134
14105	NC_018619	CAA	2	6	665333	665338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454134
14106	NC_018619	GTTT	2	8	665392	665399	0 %	75 %	25 %	0 %	407454134
14107	NC_018619	A	6	6	665453	665458	100 %	0 %	0 %	0 %	407454134
14108	NC_018619	TC	3	6	665477	665482	0 %	50 %	0 %	50 %	407454134
14109	NC_018619	TAC	2	6	665495	665500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454134
14110	NC_018619	GAA	2	6	665519	665524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454134
14111	NC_018619	GCAA	2	8	665553	665560	50 %	0 %	25 %	25 %	407454134
14112	NC_018619	TTTCC	2	10	665574	665583	0 %	60 %	0 %	40 %	407454134
14113	NC_018619	TCT	2	6	665590	665595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454134
14114	NC_018619	CTG	3	9	665680	665688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454134
14115	NC_018619	ATT	2	6	665693	665698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454134
14116	NC_018619	TG	3	6	665750	665755	0 %	50 %	50 %	0 %	407454134
14117	NC_018619	CAG	2	6	665763	665768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454134
14118	NC_018619	CT	3	6	665777	665782	0 %	50 %	0 %	50 %	407454134
14119	NC_018619	TTTC	2	8	665788	665795	0 %	75 %	0 %	25 %	407454134
14120	NC_018619	ATA	2	6	665873	665878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454134
14121	NC_018619	AAG	2	6	665917	665922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454135
14122	NC_018619	CTT	3	9	665938	665946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454135
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14124	NC_018619	AGA	2	6	666074	666079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454135
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14244	NC_018619	A	6	6	672332	672337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_018619	T	6	6	672368	672373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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