MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_018619	TCT	2	6	636873	636878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454108
13502	NC_018619	GA	3	6	636884	636889	50 %	0 %	50 %	0 %	407454108
13503	NC_018619	ATCT	2	8	636902	636909	25 %	50 %	0 %	25 %	407454108
13504	NC_018619	TTGG	2	8	636949	636956	0 %	50 %	50 %	0 %	407454108
13505	NC_018619	CAG	2	6	636973	636978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13506	NC_018619	AGA	2	6	636994	636999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454108
13507	NC_018619	ATT	2	6	637049	637054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454108
13508	NC_018619	TCC	2	6	637170	637175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454108
13509	NC_018619	TCTTCG	2	12	637212	637223	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407454108
13510	NC_018619	TCTAT	2	10	637266	637275	20 %	60 %	0 %	20 %	407454108
13511	NC_018619	TGC	2	6	637288	637293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13512	NC_018619	CTC	2	6	637310	637315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454108
13513	NC_018619	GAA	2	6	637446	637451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454108
13514	NC_018619	TAA	2	6	637507	637512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454108
13515	NC_018619	GA	3	6	637514	637519	50 %	0 %	50 %	0 %	407454108
13516	NC_018619	AATCG	2	10	637560	637569	40 %	20 %	20 %	20 %	407454108
13517	NC_018619	ATGG	2	8	637681	637688	25 %	25 %	50 %	0 %	407454108
13518	NC_018619	ATCT	2	8	637705	637712	25 %	50 %	0 %	25 %	407454108
13519	NC_018619	TAC	2	6	637724	637729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13520	NC_018619	CTT	2	6	637819	637824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454108
13521	NC_018619	TCCA	2	8	637916	637923	25 %	25 %	0 %	50 %	407454108
13522	NC_018619	TACC	2	8	637942	637949	25 %	25 %	0 %	50 %	407454108
13523	NC_018619	CAG	2	6	637996	638001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13524	NC_018619	CTC	2	6	638041	638046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454108
13525	NC_018619	CAT	2	6	638048	638053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13526	NC_018619	TA	3	6	638144	638149	50 %	50 %	0 %	0 %	407454108
13527	NC_018619	CTC	2	6	638164	638169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454108
13528	NC_018619	CAC	2	6	638185	638190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454108
13529	NC_018619	TAT	2	6	638212	638217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454108
13530	NC_018619	TCG	2	6	638301	638306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13531	NC_018619	ATT	2	6	638414	638419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454108
13532	NC_018619	CAC	2	6	638455	638460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454108
13533	NC_018619	ACT	2	6	638469	638474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13534	NC_018619	TCC	2	6	638477	638482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454108
13535	NC_018619	TCCA	2	8	638564	638571	25 %	25 %	0 %	50 %	407454108
13536	NC_018619	TGTT	2	8	638621	638628	0 %	75 %	25 %	0 %	407454108
13537	NC_018619	CA	3	6	638691	638696	50 %	0 %	0 %	50 %	407454108
13538	NC_018619	GTA	2	6	638763	638768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454108
13539	NC_018619	GAT	2	6	638902	638907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454108
13540	NC_018619	TGAT	2	8	638933	638940	25 %	50 %	25 %	0 %	407454108
13541	NC_018619	GGA	2	6	638955	638960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454108
13542	NC_018619	CGTGA	2	10	639094	639103	20 %	20 %	40 %	20 %	407454108
13543	NC_018619	GCT	2	6	639135	639140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13544	NC_018619	CTG	2	6	639166	639171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13545	NC_018619	GCG	2	6	639189	639194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407454108
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13547	NC_018619	GA	3	6	639215	639220	50 %	0 %	50 %	0 %	407454108
13548	NC_018619	CTT	2	6	639274	639279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454108
13549	NC_018619	TAT	2	6	639298	639303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454108
13550	NC_018619	TCC	2	6	639386	639391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454108
13551	NC_018619	CT	3	6	639432	639437	0 %	50 %	0 %	50 %	407454108
13552	NC_018619	TAA	2	6	639466	639471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454108
13553	NC_018619	CTT	2	6	639473	639478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454108
13554	NC_018619	TCA	2	6	639558	639563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13555	NC_018619	TTTCTA	2	12	639742	639753	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407454108
13556	NC_018619	TCA	2	6	639771	639776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13557	NC_018619	ATGGAT	2	12	639816	639827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454108
13558	NC_018619	AG	3	6	639909	639914	50 %	0 %	50 %	0 %	407454108
13559	NC_018619	AG	3	6	639991	639996	50 %	0 %	50 %	0 %	407454108
13560	NC_018619	AG	3	6	640037	640042	50 %	0 %	50 %	0 %	407454108
13561	NC_018619	TGA	2	6	640116	640121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454108
13562	NC_018619	ATC	2	6	640176	640181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13563	NC_018619	TCT	2	6	640201	640206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454108
13564	NC_018619	AAT	2	6	640272	640277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454108
13565	NC_018619	AT	4	8	640290	640297	50 %	50 %	0 %	0 %	407454108
13566	NC_018619	ACGG	2	8	640401	640408	25 %	0 %	50 %	25 %	407454108
13567	NC_018619	AC	3	6	640447	640452	50 %	0 %	0 %	50 %	407454108
13568	NC_018619	ATCT	2	8	640633	640640	25 %	50 %	0 %	25 %	407454108
13569	NC_018619	CCG	2	6	640708	640713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407454108
13570	NC_018619	AAG	2	6	640900	640905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454108
13571	NC_018619	GAG	2	6	640957	640962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454108
13572	NC_018619	GAA	3	9	641019	641027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454108
13573	NC_018619	GAC	2	6	641047	641052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13574	NC_018619	CAA	2	6	641071	641076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454108
13575	NC_018619	AGT	2	6	641176	641181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454108
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13577	NC_018619	T	6	6	641243	641248	0 %	100 %	0 %	0 %	407454108
13578	NC_018619	GAA	2	6	641254	641259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454108
13579	NC_018619	TAAA	2	8	641327	641334	75 %	25 %	0 %	0 %	407454108
13580	NC_018619	AATC	2	8	641410	641417	50 %	25 %	0 %	25 %	407454108
13581	NC_018619	ACT	2	6	641444	641449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
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13583	NC_018619	CCT	2	6	641518	641523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454108
13584	NC_018619	ACAG	2	8	641571	641578	50 %	0 %	25 %	25 %	407454108
13585	NC_018619	ATC	2	6	641612	641617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13586	NC_018619	CTA	2	6	641650	641655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108
13587	NC_018619	CAG	2	6	641686	641691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13588	NC_018619	ACA	2	6	641733	641738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454108
13589	NC_018619	GATA	2	8	641799	641806	50 %	25 %	25 %	0 %	407454108
13590	NC_018619	AGCAA	2	10	641820	641829	60 %	0 %	20 %	20 %	407454108
13591	NC_018619	CTT	2	6	641849	641854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454108
13592	NC_018619	GAA	2	6	641874	641879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454108
13593	NC_018619	TCT	2	6	641980	641985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454108
13594	NC_018619	AAG	2	6	642033	642038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_018619	GTT	2	6	642049	642054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_018619	TCT	2	6	642158	642163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454109
13597	NC_018619	ATA	2	6	642177	642182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454109
13598	NC_018619	AAG	2	6	642243	642248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454109
13599	NC_018619	ATA	2	6	642288	642293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454109
13600	NC_018619	CGAT	2	8	642335	642342	25 %	25 %	25 %	25 %	407454109
13601	NC_018619	AAC	2	6	642361	642366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454109
13602	NC_018619	TTTG	2	8	642368	642375	0 %	75 %	25 %	0 %	407454109
13603	NC_018619	GAA	2	6	642445	642450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454109
13604	NC_018619	ACA	2	6	642563	642568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454109
13605	NC_018619	CAT	2	6	642627	642632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454109
13606	NC_018619	TAA	2	6	642643	642648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454109
13607	NC_018619	AATC	2	8	642705	642712	50 %	25 %	0 %	25 %	407454109
13608	NC_018619	ATC	2	6	642814	642819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454109
13609	NC_018619	CAT	2	6	642831	642836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454109
13610	NC_018619	CCT	2	6	642915	642920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454109
13611	NC_018619	A	6	6	642979	642984	100 %	0 %	0 %	0 %	407454109
13612	NC_018619	TCA	2	6	642990	642995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454109
13613	NC_018619	AATCA	2	10	643003	643012	60 %	20 %	0 %	20 %	407454109
13614	NC_018619	ACTG	2	8	643033	643040	25 %	25 %	25 %	25 %	407454109
13615	NC_018619	CCT	2	6	643112	643117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454109
13616	NC_018619	TCT	2	6	643148	643153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454109
13617	NC_018619	TC	4	8	643182	643189	0 %	50 %	0 %	50 %	407454109
13618	NC_018619	TTC	2	6	643201	643206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454109
13619	NC_018619	ATCA	2	8	643225	643232	50 %	25 %	0 %	25 %	407454109
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13621	NC_018619	CAT	2	6	643264	643269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454109
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