MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018619	ATC	2	6	613601	613606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454088
13002	NC_018619	CT	3	6	613703	613708	0 %	50 %	0 %	50 %	407454088
13003	NC_018619	CT	3	6	613741	613746	0 %	50 %	0 %	50 %	407454088
13004	NC_018619	CTT	2	6	613766	613771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454088
13005	NC_018619	TGA	2	6	613774	613779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454088
13006	NC_018619	GA	3	6	613840	613845	50 %	0 %	50 %	0 %	407454088
13007	NC_018619	CCAC	2	8	613869	613876	25 %	0 %	0 %	75 %	407454088
13008	NC_018619	GTG	2	6	614014	614019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454088
13009	NC_018619	GCT	2	6	614032	614037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_018619	AGC	2	6	614041	614046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_018619	TGC	2	6	614085	614090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454089
13012	NC_018619	CTT	2	6	614123	614128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454089
13013	NC_018619	CCT	2	6	614227	614232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454089
13014	NC_018619	AAG	2	6	614309	614314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454089
13015	NC_018619	TCG	2	6	614434	614439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454089
13016	NC_018619	TCA	2	6	614464	614469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454089
13017	NC_018619	AAG	2	6	614559	614564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454089
13018	NC_018619	AGA	2	6	614607	614612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454089
13019	NC_018619	A	6	6	614612	614617	100 %	0 %	0 %	0 %	407454089
13020	NC_018619	CCAT	2	8	614767	614774	25 %	25 %	0 %	50 %	407454089
13021	NC_018619	CAT	2	6	614811	614816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454089
13022	NC_018619	TCT	2	6	614884	614889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454089
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13024	NC_018619	ATC	2	6	615087	615092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454089
13025	NC_018619	CTT	2	6	615098	615103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454089
13026	NC_018619	TTC	2	6	615129	615134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454089
13027	NC_018619	TCA	2	6	615196	615201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454089
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13029	NC_018619	AAT	2	6	615218	615223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454089
13030	NC_018619	T	6	6	615326	615331	0 %	100 %	0 %	0 %	407454089
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13032	NC_018619	T	6	6	615347	615352	0 %	100 %	0 %	0 %	407454089
13033	NC_018619	AGA	2	6	615360	615365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454089
13034	NC_018619	AAAG	2	8	615396	615403	75 %	0 %	25 %	0 %	407454089
13035	NC_018619	TCT	2	6	615411	615416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454089
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13037	NC_018619	TAA	2	6	615460	615465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_018619	TAAT	2	8	615473	615480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_018619	TATT	2	8	615489	615496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_018619	TTA	2	6	615526	615531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_018619	CT	3	6	615535	615540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_018619	T	7	7	615557	615563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_018619	GGA	2	6	615590	615595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_018619	AGA	2	6	615610	615615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_018619	AGA	2	6	615691	615696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454090
13046	NC_018619	GAA	2	6	615743	615748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454090
13047	NC_018619	TAT	2	6	615769	615774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454090
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13049	NC_018619	A	7	7	615925	615931	100 %	0 %	0 %	0 %	407454090
13050	NC_018619	TTC	2	6	615968	615973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454090
13051	NC_018619	CATA	2	8	615997	616004	50 %	25 %	0 %	25 %	407454090
13052	NC_018619	TGC	2	6	616046	616051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454090
13053	NC_018619	TTC	2	6	616064	616069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454090
13054	NC_018619	TTAC	2	8	616107	616114	25 %	50 %	0 %	25 %	407454090
13055	NC_018619	TGT	2	6	616131	616136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454090
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13058	NC_018619	TGG	2	6	616329	616334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454090
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13060	NC_018619	ACG	2	6	616420	616425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454090
13061	NC_018619	GACAA	2	10	616541	616550	60 %	0 %	20 %	20 %	407454090
13062	NC_018619	AT	3	6	616595	616600	50 %	50 %	0 %	0 %	407454090
13063	NC_018619	GTT	2	6	616613	616618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454090
13064	NC_018619	TTG	2	6	616666	616671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454090
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13066	NC_018619	TGAA	2	8	616943	616950	50 %	25 %	25 %	0 %	407454090
13067	NC_018619	TCT	3	9	616962	616970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454090
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13071	NC_018619	ATCG	2	8	617117	617124	25 %	25 %	25 %	25 %	407454090
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13075	NC_018619	AACT	2	8	617291	617298	50 %	25 %	0 %	25 %	407454090
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13088	NC_018619	AT	3	6	618037	618042	50 %	50 %	0 %	0 %	407454090
13089	NC_018619	GAAA	2	8	618077	618084	75 %	0 %	25 %	0 %	407454090
13090	NC_018619	ACA	2	6	618097	618102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454090
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13095	NC_018619	ATA	2	6	618270	618275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454090
13096	NC_018619	AGAA	2	8	618284	618291	75 %	0 %	25 %	0 %	407454090
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13098	NC_018619	CT	3	6	618387	618392	0 %	50 %	0 %	50 %	407454090
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13102	NC_018619	AAGA	2	8	618556	618563	75 %	0 %	25 %	0 %	407454090
13103	NC_018619	GTT	2	6	618595	618600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454090
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13107	NC_018619	CTT	2	6	618755	618760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454090
13108	NC_018619	A	6	6	618891	618896	100 %	0 %	0 %	0 %	407454090
13109	NC_018619	AT	3	6	619020	619025	50 %	50 %	0 %	0 %	407454091
13110	NC_018619	GAA	2	6	619092	619097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454091
13111	NC_018619	CT	3	6	619155	619160	0 %	50 %	0 %	50 %	407454091
13112	NC_018619	AGG	2	6	619258	619263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454091
13113	NC_018619	AAAAT	2	10	619361	619370	80 %	20 %	0 %	0 %	407454091
13114	NC_018619	CTC	2	6	619404	619409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454091
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13118	NC_018619	TGC	2	6	619573	619578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454091
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13121	NC_018619	A	7	7	619639	619645	100 %	0 %	0 %	0 %	407454091
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13367	NC_018619	TCTT	2	8	630558	630565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13495	NC_018619	CTG	2	6	636572	636577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454107
13496	NC_018619	ATTA	2	8	636642	636649	50 %	50 %	0 %	0 %	407454107
13497	NC_018619	TCCTT	2	10	636683	636692	0 %	60 %	0 %	40 %	407454107
13498	NC_018619	AG	3	6	636830	636835	50 %	0 %	50 %	0 %	407454108
13499	NC_018619	CTG	2	6	636838	636843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454108
13500	NC_018619	TCA	2	6	636846	636851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454108

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