MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018619	ATT	2	6	520458	520463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_018619	TTC	2	6	520670	520675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_018619	TAA	2	6	520687	520692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_018619	CTT	2	6	520799	520804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453995
11005	NC_018619	TGA	2	6	520857	520862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453995
11006	NC_018619	GAGTCA	2	12	520887	520898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407453995
11007	NC_018619	TTTC	2	8	520984	520991	0 %	75 %	0 %	25 %	407453995
11008	NC_018619	TGT	2	6	521022	521027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453995
11009	NC_018619	GTT	2	6	521030	521035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453995
11010	NC_018619	AGAT	2	8	521069	521076	50 %	25 %	25 %	0 %	407453995
11011	NC_018619	TGA	2	6	521082	521087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453995
11012	NC_018619	TCT	2	6	521128	521133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453995
11013	NC_018619	CAA	2	6	521135	521140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453995
11014	NC_018619	AAGC	2	8	521161	521168	50 %	0 %	25 %	25 %	407453995
11015	NC_018619	GAA	2	6	521175	521180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453995
11016	NC_018619	AGA	2	6	521268	521273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453995
11017	NC_018619	TGT	2	6	521318	521323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453995
11018	NC_018619	TGT	2	6	521379	521384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453995
11019	NC_018619	GAA	2	6	521386	521391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453995
11020	NC_018619	TGT	2	6	521415	521420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453995
11021	NC_018619	AGA	3	9	521439	521447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453995
11022	NC_018619	TGC	2	6	521532	521537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453995
11023	NC_018619	GATT	2	8	521552	521559	25 %	50 %	25 %	0 %	407453995
11024	NC_018619	TAG	2	6	521806	521811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453995
11025	NC_018619	AGA	2	6	521812	521817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453996
11026	NC_018619	CT	3	6	521829	521834	0 %	50 %	0 %	50 %	407453996
11027	NC_018619	GAGAA	2	10	521869	521878	60 %	0 %	40 %	0 %	407453996
11028	NC_018619	TCTT	2	8	521882	521889	0 %	75 %	0 %	25 %	407453996
11029	NC_018619	TTC	2	6	521980	521985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453996
11030	NC_018619	AT	3	6	522023	522028	50 %	50 %	0 %	0 %	407453996
11031	NC_018619	GCAT	2	8	522050	522057	25 %	25 %	25 %	25 %	407453996
11032	NC_018619	ATCT	2	8	522248	522255	25 %	50 %	0 %	25 %	407453996
11033	NC_018619	GAG	2	6	522259	522264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453996
11034	NC_018619	CCTTC	2	10	522324	522333	0 %	40 %	0 %	60 %	407453996
11035	NC_018619	CAG	2	6	522412	522417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453996
11036	NC_018619	AGT	2	6	522457	522462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453996
11037	NC_018619	CAGT	2	8	522598	522605	25 %	25 %	25 %	25 %	407453996
11038	NC_018619	A	7	7	522635	522641	100 %	0 %	0 %	0 %	407453996
11039	NC_018619	AT	3	6	522722	522727	50 %	50 %	0 %	0 %	407453997
11040	NC_018619	TTC	2	6	522804	522809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453997
11041	NC_018619	TAC	2	6	522854	522859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453997
11042	NC_018619	T	7	7	523008	523014	0 %	100 %	0 %	0 %	407453997
11043	NC_018619	G	7	7	523026	523032	0 %	0 %	100 %	0 %	407453997
11044	NC_018619	TTG	2	6	523035	523040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453997
11045	NC_018619	TAGG	2	8	523084	523091	25 %	25 %	50 %	0 %	407453997
11046	NC_018619	T	6	6	523096	523101	0 %	100 %	0 %	0 %	407453997
11047	NC_018619	CAA	2	6	523109	523114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453997
11048	NC_018619	ATA	2	6	523187	523192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453997
11049	NC_018619	T	8	8	523280	523287	0 %	100 %	0 %	0 %	407453997
11050	NC_018619	TCCT	2	8	523331	523338	0 %	50 %	0 %	50 %	407453997
11051	NC_018619	AGA	2	6	523354	523359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453997
11052	NC_018619	CTT	2	6	523364	523369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453997
11053	NC_018619	ATG	2	6	523393	523398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_018619	A	6	6	523491	523496	100 %	0 %	0 %	0 %	407453998
11055	NC_018619	ACG	2	6	523538	523543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453998
11056	NC_018619	ATA	2	6	523793	523798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453998
11057	NC_018619	GAT	2	6	523815	523820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453999
11058	NC_018619	AT	3	6	523819	523824	50 %	50 %	0 %	0 %	407453999
11059	NC_018619	ACCT	2	8	523849	523856	25 %	25 %	0 %	50 %	407453999
11060	NC_018619	TAA	2	6	523876	523881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453999
11061	NC_018619	T	6	6	523900	523905	0 %	100 %	0 %	0 %	407453999
11062	NC_018619	CTT	2	6	523908	523913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453999
11063	NC_018619	TCT	2	6	523919	523924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453999
11064	NC_018619	AGA	2	6	523939	523944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453999
11065	NC_018619	TTA	2	6	523970	523975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453999
11066	NC_018619	ACA	2	6	523979	523984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453999
11067	NC_018619	TGA	2	6	524050	524055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453999
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11069	NC_018619	TC	3	6	524092	524097	0 %	50 %	0 %	50 %	407453999
11070	NC_018619	TCA	2	6	524124	524129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453999
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11072	NC_018619	AAT	2	6	524239	524244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453999
11073	NC_018619	TGC	2	6	524257	524262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453999
11074	NC_018619	CTA	2	6	524300	524305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453999
11075	NC_018619	ACTT	2	8	524320	524327	25 %	50 %	0 %	25 %	407453999
11076	NC_018619	ATA	2	6	524393	524398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453999
11077	NC_018619	GCA	2	6	524421	524426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453999
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11080	NC_018619	T	6	6	524508	524513	0 %	100 %	0 %	0 %	407453999
11081	NC_018619	ACA	2	6	524525	524530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453999
11082	NC_018619	GCCT	2	8	524539	524546	0 %	25 %	25 %	50 %	407453999
11083	NC_018619	CACGAG	2	12	524754	524765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453999
11084	NC_018619	AGCA	2	8	524806	524813	50 %	0 %	25 %	25 %	407453999
11085	NC_018619	ATTG	2	8	524959	524966	25 %	50 %	25 %	0 %	407453999
11086	NC_018619	ACA	2	6	524969	524974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453999
11087	NC_018619	AAC	2	6	525153	525158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453999
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11089	NC_018619	CTG	2	6	525198	525203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453999
11090	NC_018619	AGT	2	6	525235	525240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453999
11091	NC_018619	CGA	2	6	525270	525275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453999
11092	NC_018619	AGG	2	6	525277	525282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453999
11093	NC_018619	TCT	2	6	525320	525325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453999
11094	NC_018619	TGA	2	6	525364	525369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453999
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11097	NC_018619	T	6	6	525586	525591	0 %	100 %	0 %	0 %	407453999
11098	NC_018619	T	6	6	525594	525599	0 %	100 %	0 %	0 %	407453999
11099	NC_018619	T	7	7	525607	525613	0 %	100 %	0 %	0 %	407453999
11100	NC_018619	TCT	2	6	525683	525688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453999
11101	NC_018619	T	6	6	525688	525693	0 %	100 %	0 %	0 %	407453999
11102	NC_018619	TGT	2	6	525776	525781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453999
11103	NC_018619	AGA	2	6	525799	525804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453999
11104	NC_018619	TCT	2	6	525857	525862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453999
11105	NC_018619	T	6	6	525862	525867	0 %	100 %	0 %	0 %	407453999
11106	NC_018619	AAC	2	6	525940	525945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454000
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11109	NC_018619	GGA	3	9	525991	525999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454000
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11111	NC_018619	TTC	2	6	526023	526028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454000
11112	NC_018619	TAC	2	6	526029	526034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454000
11113	NC_018619	CTT	2	6	526088	526093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454000
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11116	NC_018619	TTC	2	6	526267	526272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454000
11117	NC_018619	CCTG	2	8	526348	526355	0 %	25 %	25 %	50 %	407454000
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11119	NC_018619	TAA	2	6	526534	526539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454001
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11243	NC_018619	ACCA	2	8	532062	532069	50 %	0 %	0 %	50 %	407454006
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11490	NC_018619	ATG	2	6	544386	544391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454016
11491	NC_018619	CTAT	2	8	544410	544417	25 %	50 %	0 %	25 %	407454016
11492	NC_018619	GTA	2	6	544419	544424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454016
11493	NC_018619	CAT	2	6	544441	544446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454016
11494	NC_018619	TAC	2	6	544586	544591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454016
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11496	NC_018619	TGGA	2	8	544739	544746	25 %	25 %	50 %	0 %	407454016
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11498	NC_018619	TTGAGC	2	12	544877	544888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407454016
11499	NC_018619	ATA	2	6	544899	544904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454016
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