MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018619	AAGC	2	8	211258	211265	50 %	0 %	25 %	25 %	407453694
4502	NC_018619	ATT	2	6	211303	211308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453694
4503	NC_018619	AAG	2	6	211329	211334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453694
4504	NC_018619	GTT	2	6	211351	211356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453694
4505	NC_018619	GTA	2	6	211409	211414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453694
4506	NC_018619	GA	3	6	211443	211448	50 %	0 %	50 %	0 %	407453694
4507	NC_018619	GTAG	2	8	211730	211737	25 %	25 %	50 %	0 %	407453695
4508	NC_018619	TGA	2	6	211744	211749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453695
4509	NC_018619	TTG	2	6	211776	211781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453695
4510	NC_018619	AT	3	6	211804	211809	50 %	50 %	0 %	0 %	407453695
4511	NC_018619	TTC	2	6	211815	211820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453695
4512	NC_018619	GTTT	2	8	211855	211862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_018619	T	6	6	211874	211879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_018619	GGT	2	6	212056	212061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453696
4515	NC_018619	GAA	2	6	212181	212186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453696
4516	NC_018619	GTT	2	6	212287	212292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453696
4517	NC_018619	AGG	2	6	212307	212312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453696
4518	NC_018619	ATT	2	6	212463	212468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453696
4519	NC_018619	ATT	2	6	212667	212672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453696
4520	NC_018619	GTT	2	6	212673	212678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453696
4521	NC_018619	TCC	2	6	212707	212712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453696
4522	NC_018619	AGA	3	9	212715	212723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453696
4523	NC_018619	TGA	2	6	212805	212810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453696
4524	NC_018619	TTG	2	6	212975	212980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_018619	ATC	2	6	213055	213060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_018619	TGC	2	6	213171	213176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_018619	GAAG	2	8	213188	213195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_018619	CAT	2	6	213225	213230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_018619	AT	3	6	213229	213234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_018619	AAAG	2	8	213250	213257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_018619	TAC	2	6	213276	213281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_018619	GGT	2	6	213330	213335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_018619	ATA	2	6	213406	213411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_018619	TCT	2	6	213454	213459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_018619	CATA	2	8	213527	213534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_018619	CCT	2	6	213586	213591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_018619	ATGT	2	8	213643	213650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_018619	ACA	2	6	213655	213660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_018619	GCC	2	6	213685	213690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_018619	AAG	2	6	213695	213700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_018619	A	7	7	213729	213735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_018619	T	7	7	213753	213759	0 %	100 %	0 %	0 %	407453697
4543	NC_018619	TTG	2	6	213790	213795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4544	NC_018619	GTT	2	6	213810	213815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4545	NC_018619	ATG	2	6	213860	213865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453697
4546	NC_018619	GTT	2	6	213931	213936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4547	NC_018619	AGAT	2	8	214037	214044	50 %	25 %	25 %	0 %	407453697
4548	NC_018619	AGAA	2	8	214160	214167	75 %	0 %	25 %	0 %	407453697
4549	NC_018619	GAAAA	2	10	214189	214198	80 %	0 %	20 %	0 %	407453697
4550	NC_018619	TGC	2	6	214212	214217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453697
4551	NC_018619	T	7	7	214244	214250	0 %	100 %	0 %	0 %	407453697
4552	NC_018619	GTA	2	6	214281	214286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453697
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4554	NC_018619	GTT	2	6	214320	214325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4555	NC_018619	C	6	6	214328	214333	0 %	0 %	0 %	100 %	407453697
4556	NC_018619	CAA	2	6	214354	214359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453697
4557	NC_018619	GTT	2	6	214472	214477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453698
4558	NC_018619	ATT	2	6	214492	214497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453698
4559	NC_018619	TTC	2	6	214507	214512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453698
4560	NC_018619	TAGCA	2	10	214555	214564	40 %	20 %	20 %	20 %	407453698
4561	NC_018619	AGC	2	6	214630	214635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453698
4562	NC_018619	ACA	2	6	214640	214645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453698
4563	NC_018619	ACG	2	6	214682	214687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453698
4564	NC_018619	GCT	2	6	214752	214757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453698
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4567	NC_018619	T	6	6	214985	214990	0 %	100 %	0 %	0 %	407453698
4568	NC_018619	T	7	7	215018	215024	0 %	100 %	0 %	0 %	407453698
4569	NC_018619	T	6	6	215079	215084	0 %	100 %	0 %	0 %	407453698
4570	NC_018619	TTC	2	6	215218	215223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453698
4571	NC_018619	AAGAA	2	10	215253	215262	80 %	0 %	20 %	0 %	407453698
4572	NC_018619	AAG	2	6	215269	215274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453698
4573	NC_018619	TGA	2	6	215306	215311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_018619	TAA	2	6	215343	215348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_018619	T	6	6	215376	215381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_018619	AT	3	6	215421	215426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_018619	GA	3	6	215481	215486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_018619	GT	3	6	215521	215526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_018619	CT	3	6	215558	215563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_018619	T	6	6	215586	215591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_018619	T	6	6	215649	215654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_018619	T	6	6	215695	215700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_018619	A	6	6	215746	215751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_018619	AG	3	6	215785	215790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_018619	TC	3	6	215844	215849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_018619	GAA	2	6	215887	215892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453699
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4590	NC_018619	GACA	2	8	216143	216150	50 %	0 %	25 %	25 %	407453699
4591	NC_018619	AG	3	6	216172	216177	50 %	0 %	50 %	0 %	407453699
4592	NC_018619	CTC	2	6	216229	216234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453699
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4599	NC_018619	GAAAG	2	10	216553	216562	60 %	0 %	40 %	0 %	407453700
4600	NC_018619	TAT	2	6	216641	216646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453700
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4602	NC_018619	ATTT	2	8	216724	216731	25 %	75 %	0 %	0 %	407453700
4603	NC_018619	TCA	2	6	216836	216841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453700
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4605	NC_018619	ACTC	2	8	216933	216940	25 %	25 %	0 %	50 %	407453700
4606	NC_018619	TTA	2	6	217027	217032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453700
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4609	NC_018619	TAG	2	6	217274	217279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453700
4610	NC_018619	TAC	2	6	217290	217295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453700
4611	NC_018619	AT	3	6	217525	217530	50 %	50 %	0 %	0 %	407453701
4612	NC_018619	AGAA	2	8	217830	217837	75 %	0 %	25 %	0 %	407453701
4613	NC_018619	TTG	2	6	217842	217847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453701
4614	NC_018619	CAAC	2	8	217897	217904	50 %	0 %	0 %	50 %	407453701
4615	NC_018619	TTC	2	6	218236	218241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453701
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4617	NC_018619	ATC	2	6	218302	218307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453701
4618	NC_018619	TGT	2	6	218328	218333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453701
4619	NC_018619	GA	3	6	218359	218364	50 %	0 %	50 %	0 %	407453701
4620	NC_018619	AGT	2	6	218397	218402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453701
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4623	NC_018619	AT	3	6	218501	218506	50 %	50 %	0 %	0 %	407453701
4624	NC_018619	GTTAG	2	10	218537	218546	20 %	40 %	40 %	0 %	407453701
4625	NC_018619	CTA	2	6	218561	218566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453701
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4627	NC_018619	TGGAT	2	10	218689	218698	20 %	40 %	40 %	0 %	407453701
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