MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_018019	GTT	2	6	2246646	2246651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401544
42503	NC_018019	TGG	2	6	2246719	2246724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401544
42504	NC_018019	CAGGT	2	10	2246758	2246767	20 %	20 %	40 %	20 %	392401544
42505	NC_018019	TC	3	6	2246795	2246800	0 %	50 %	0 %	50 %	392401544
42506	NC_018019	CAC	2	6	2246932	2246937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401544
42507	NC_018019	GCC	2	6	2247015	2247020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401544
42508	NC_018019	GCT	2	6	2247029	2247034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401544
42509	NC_018019	AGC	2	6	2247053	2247058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401544
42510	NC_018019	CAG	2	6	2247062	2247067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401544
42511	NC_018019	GCA	2	6	2247121	2247126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401545
42512	NC_018019	AAC	2	6	2247131	2247136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392401545
42513	NC_018019	ATT	2	6	2247164	2247169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392401545
42514	NC_018019	GCC	2	6	2247399	2247404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401545
42515	NC_018019	TGT	2	6	2247433	2247438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401545
42516	NC_018019	CTC	2	6	2247491	2247496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392401545
42517	NC_018019	GAT	2	6	2247521	2247526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401545
42518	NC_018019	GCCG	2	8	2247530	2247537	0 %	0 %	50 %	50 %	392401545
42519	NC_018019	TCC	2	6	2247555	2247560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392401545
42520	NC_018019	TGG	2	6	2247567	2247572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401545
42521	NC_018019	TGG	2	6	2247616	2247621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401545
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42532	NC_018019	CTC	2	6	2247929	2247934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392401545
42533	NC_018019	C	6	6	2247990	2247995	0 %	0 %	0 %	100 %	392401546
42534	NC_018019	GTTT	2	8	2248085	2248092	0 %	75 %	25 %	0 %	392401546
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42539	NC_018019	GGCG	2	8	2248443	2248450	0 %	0 %	75 %	25 %	392401546
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42550	NC_018019	CA	3	6	2248953	2248958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42551	NC_018019	GCAG	2	8	2248963	2248970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42552	NC_018019	TAC	2	6	2249022	2249027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401547
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42554	NC_018019	CAGTT	2	10	2249115	2249124	20 %	40 %	20 %	20 %	392401547
42555	NC_018019	CT	4	8	2249244	2249251	0 %	50 %	0 %	50 %	392401547
42556	NC_018019	GTA	2	6	2249263	2249268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401547
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42558	NC_018019	CAT	2	6	2249324	2249329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401547
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42562	NC_018019	AAAAT	2	10	2249610	2249619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42563	NC_018019	GAA	2	6	2249676	2249681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42565	NC_018019	ATTT	2	8	2249711	2249718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42574	NC_018019	CCCA	2	8	2250194	2250201	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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42587	NC_018019	GA	3	6	2250706	2250711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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42593	NC_018019	CG	4	8	2250970	2250977	0 %	0 %	50 %	50 %	392401549
42594	NC_018019	CA	3	6	2251005	2251010	50 %	0 %	0 %	50 %	392401549
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42602	NC_018019	TC	3	6	2251334	2251339	0 %	50 %	0 %	50 %	392401550
42603	NC_018019	GGT	2	6	2251353	2251358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401550
42604	NC_018019	ATGG	2	8	2251385	2251392	25 %	25 %	50 %	0 %	392401550
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42606	NC_018019	GACTG	2	10	2251468	2251477	20 %	20 %	40 %	20 %	392401550
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42608	NC_018019	GC	3	6	2251557	2251562	0 %	0 %	50 %	50 %	392401550
42609	NC_018019	CCAT	2	8	2251563	2251570	25 %	25 %	0 %	50 %	392401550
42610	NC_018019	AAT	2	6	2251614	2251619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401550
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42612	NC_018019	C	6	6	2251642	2251647	0 %	0 %	0 %	100 %	392401550
42613	NC_018019	CAC	2	6	2251685	2251690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401550
42614	NC_018019	GTC	2	6	2251747	2251752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42615	NC_018019	TCCC	2	8	2251909	2251916	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42616	NC_018019	CAG	2	6	2251929	2251934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42617	NC_018019	CGC	2	6	2251962	2251967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42618	NC_018019	CTT	2	6	2251978	2251983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42620	NC_018019	CGA	2	6	2252046	2252051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42982	NC_018019	AGC	2	6	2273403	2273408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401569
42983	NC_018019	AAC	2	6	2273445	2273450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392401569
42984	NC_018019	CATA	2	8	2273458	2273465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42985	NC_018019	CCTT	2	8	2273473	2273480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42986	NC_018019	TCT	2	6	2273485	2273490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401570
42987	NC_018019	ACC	2	6	2273533	2273538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401570
42988	NC_018019	CTT	2	6	2273560	2273565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401570
42989	NC_018019	A	6	6	2273604	2273609	100 %	0 %	0 %	0 %	392401570
42990	NC_018019	TC	3	6	2273726	2273731	0 %	50 %	0 %	50 %	392401570
42991	NC_018019	GAT	2	6	2273737	2273742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401570
42992	NC_018019	CTT	3	9	2273768	2273776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401570
42993	NC_018019	ACG	2	6	2273849	2273854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401570
42994	NC_018019	CAT	2	6	2273926	2273931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401570
42995	NC_018019	CGCA	2	8	2273969	2273976	25 %	0 %	25 %	50 %	392401570
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42997	NC_018019	CATG	2	8	2274061	2274068	25 %	25 %	25 %	25 %	392401570
42998	NC_018019	TCT	3	9	2274102	2274110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401570
42999	NC_018019	TGC	2	6	2274162	2274167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401570
43000	NC_018019	ATG	2	6	2274210	2274215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401570

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