MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_018019	GGC	2	6	1617633	1617638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401014
30503	NC_018019	TTA	2	6	1617647	1617652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392401014
30504	NC_018019	CAA	2	6	1617727	1617732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392401014
30505	NC_018019	CTA	2	6	1617758	1617763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401014
30506	NC_018019	GCC	2	6	1617784	1617789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401014
30507	NC_018019	GCAAC	2	10	1617837	1617846	40 %	0 %	20 %	40 %	392401014
30508	NC_018019	AAC	3	9	1617844	1617852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392401014
30509	NC_018019	AGG	2	6	1617858	1617863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392401014
30510	NC_018019	GGC	2	6	1617922	1617927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401014
30511	NC_018019	GGA	2	6	1617931	1617936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392401014
30512	NC_018019	CGG	2	6	1617942	1617947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401014
30513	NC_018019	GGT	2	6	1617958	1617963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401014
30514	NC_018019	TGG	2	6	1617972	1617977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401014
30515	NC_018019	A	6	6	1618109	1618114	100 %	0 %	0 %	0 %	392401015
30516	NC_018019	TGT	2	6	1618136	1618141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401015
30517	NC_018019	A	6	6	1618173	1618178	100 %	0 %	0 %	0 %	392401015
30518	NC_018019	CCG	2	6	1618213	1618218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401015
30519	NC_018019	TGA	2	6	1618234	1618239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401015
30520	NC_018019	GGT	2	6	1618303	1618308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401015
30521	NC_018019	CAC	2	6	1618345	1618350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401015
30522	NC_018019	CAC	2	6	1618405	1618410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401015
30523	NC_018019	GC	3	6	1618426	1618431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30524	NC_018019	TTC	2	6	1618466	1618471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30525	NC_018019	CT	3	6	1618497	1618502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30526	NC_018019	CAG	2	6	1618539	1618544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401016
30527	NC_018019	GA	3	6	1618615	1618620	50 %	0 %	50 %	0 %	392401016
30528	NC_018019	GTT	2	6	1618635	1618640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401016
30529	NC_018019	ATT	2	6	1618686	1618691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392401016
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30531	NC_018019	CG	3	6	1618770	1618775	0 %	0 %	50 %	50 %	392401016
30532	NC_018019	CAG	2	6	1618787	1618792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401016
30533	NC_018019	TGC	2	6	1618805	1618810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401016
30534	NC_018019	CTG	2	6	1618881	1618886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401016
30535	NC_018019	CCGCA	2	10	1618910	1618919	20 %	0 %	20 %	60 %	392401016
30536	NC_018019	GTT	2	6	1618971	1618976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30537	NC_018019	CGT	2	6	1618979	1618984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30538	NC_018019	AGC	2	6	1619090	1619095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401017
30539	NC_018019	CAAG	2	8	1619096	1619103	50 %	0 %	25 %	25 %	392401017
30540	NC_018019	TGC	2	6	1619106	1619111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401017
30541	NC_018019	CGA	2	6	1619245	1619250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401017
30542	NC_018019	GGC	2	6	1619310	1619315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401017
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30544	NC_018019	CTT	2	6	1619346	1619351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401017
30545	NC_018019	GAA	2	6	1619360	1619365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401017
30546	NC_018019	CGC	2	6	1619423	1619428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401017
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30549	NC_018019	AGT	2	6	1619687	1619692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401017
30550	NC_018019	GC	4	8	1619693	1619700	0 %	0 %	50 %	50 %	392401017
30551	NC_018019	CGG	2	6	1619922	1619927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401017
30552	NC_018019	GC	3	6	1619934	1619939	0 %	0 %	50 %	50 %	392401017
30553	NC_018019	GGT	2	6	1619940	1619945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401017
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30555	NC_018019	TCA	2	6	1620041	1620046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401017
30556	NC_018019	CTGG	2	8	1620080	1620087	0 %	25 %	50 %	25 %	392401017
30557	NC_018019	CAG	2	6	1620159	1620164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401017
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30559	NC_018019	GAA	2	6	1620260	1620265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401017
30560	NC_018019	CCA	2	6	1620318	1620323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401017
30561	NC_018019	CTT	2	6	1620327	1620332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401017
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30563	NC_018019	GAC	2	6	1620441	1620446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30564	NC_018019	AAC	2	6	1620481	1620486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30565	NC_018019	A	7	7	1620590	1620596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30566	NC_018019	CT	3	6	1620597	1620602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30567	NC_018019	GCA	2	6	1620745	1620750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30568	NC_018019	A	6	6	1620750	1620755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30569	NC_018019	TCAA	2	8	1620765	1620772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30570	NC_018019	T	6	6	1620860	1620865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30571	NC_018019	TCG	2	6	1620982	1620987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401018
30572	NC_018019	GATCA	2	10	1620988	1620997	40 %	20 %	20 %	20 %	392401018
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30574	NC_018019	GAA	2	6	1621206	1621211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401018
30575	NC_018019	AGCG	2	8	1621228	1621235	25 %	0 %	50 %	25 %	392401018
30576	NC_018019	GTC	2	6	1621241	1621246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401018
30577	NC_018019	ATC	2	6	1621249	1621254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401018
30578	NC_018019	GCTT	2	8	1621259	1621266	0 %	50 %	25 %	25 %	392401018
30579	NC_018019	A	6	6	1621292	1621297	100 %	0 %	0 %	0 %	392401018
30580	NC_018019	A	6	6	1621313	1621318	100 %	0 %	0 %	0 %	392401018
30581	NC_018019	CGGT	2	8	1621333	1621340	0 %	25 %	50 %	25 %	392401018
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30584	NC_018019	CAC	2	6	1621547	1621552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30585	NC_018019	AGGA	2	8	1621603	1621610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30586	NC_018019	AGACA	2	10	1621611	1621620	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30587	NC_018019	GTA	2	6	1621663	1621668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401019
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30590	NC_018019	CAC	2	6	1621775	1621780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401019
30591	NC_018019	ATC	2	6	1621879	1621884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401019
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30595	NC_018019	GCT	2	6	1622132	1622137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401020
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30600	NC_018019	GTT	2	6	1622359	1622364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401020
30601	NC_018019	GA	3	6	1622366	1622371	50 %	0 %	50 %	0 %	392401020
30602	NC_018019	CAG	2	6	1622454	1622459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401020
30603	NC_018019	CTT	2	6	1622472	1622477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401020
30604	NC_018019	AGCT	2	8	1622509	1622516	25 %	25 %	25 %	25 %	392401020
30605	NC_018019	GCG	2	6	1622565	1622570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401020
30606	NC_018019	AT	3	6	1622609	1622614	50 %	50 %	0 %	0 %	392401020
30607	NC_018019	ATA	2	6	1622643	1622648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401020
30608	NC_018019	TG	3	6	1622676	1622681	0 %	50 %	50 %	0 %	392401020
30609	NC_018019	CGT	2	6	1622736	1622741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401020
30610	NC_018019	GCA	2	6	1622756	1622761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401020
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30613	NC_018019	AGCGCA	2	12	1622903	1622914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401020
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30616	NC_018019	TCTTT	2	10	1623074	1623083	0 %	80 %	0 %	20 %	392401020
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