MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26102	NC_018019	ATG	2	6	1375284	1375289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400812
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26117	NC_018019	T	7	7	1376245	1376251	0 %	100 %	0 %	0 %	392400813
26118	NC_018019	CTTCAA	2	12	1376253	1376264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400813
26119	NC_018019	ACC	2	6	1376267	1376272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400813
26120	NC_018019	TCC	2	6	1376286	1376291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400813
26121	NC_018019	GTA	2	6	1376306	1376311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400813
26122	NC_018019	TAC	2	6	1376419	1376424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400813
26123	NC_018019	ATCT	2	8	1376612	1376619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26124	NC_018019	GCA	2	6	1376657	1376662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400814
26125	NC_018019	AGC	2	6	1376758	1376763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400814
26126	NC_018019	GCC	2	6	1376768	1376773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400814
26127	NC_018019	CTT	2	6	1376898	1376903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400814
26128	NC_018019	GAC	2	6	1376906	1376911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400814
26129	NC_018019	TGC	2	6	1376923	1376928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400814
26130	NC_018019	CTTTGA	2	12	1376944	1376955	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392400814
26131	NC_018019	CAG	2	6	1376962	1376967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400814
26132	NC_018019	CGC	2	6	1376977	1376982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400814
26133	NC_018019	TTG	2	6	1377060	1377065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400814
26134	NC_018019	AGC	2	6	1377082	1377087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400814
26135	NC_018019	TAAA	2	8	1377126	1377133	75 %	25 %	0 %	0 %	392400814
26136	NC_018019	TCC	2	6	1377140	1377145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400814
26137	NC_018019	GCG	2	6	1377167	1377172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400814
26138	NC_018019	CT	3	6	1377182	1377187	0 %	50 %	0 %	50 %	392400814
26139	NC_018019	A	6	6	1377358	1377363	100 %	0 %	0 %	0 %	392400814
26140	NC_018019	CAA	2	6	1377368	1377373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400814
26141	NC_018019	ATT	2	6	1377432	1377437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400814
26142	NC_018019	GCT	2	6	1377449	1377454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400814
26143	NC_018019	ACT	2	6	1377464	1377469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400814
26144	NC_018019	CTAGCT	2	12	1377482	1377493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392400814
26145	NC_018019	CGGC	2	8	1377510	1377517	0 %	0 %	50 %	50 %	392400814
26146	NC_018019	GC	3	6	1377516	1377521	0 %	0 %	50 %	50 %	392400814
26147	NC_018019	AAG	2	6	1377570	1377575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400814
26148	NC_018019	GAT	2	6	1377600	1377605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400815
26149	NC_018019	GCA	2	6	1377610	1377615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26150	NC_018019	CTG	2	6	1377620	1377625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26151	NC_018019	CTT	2	6	1377641	1377646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400815
26152	NC_018019	CTT	2	6	1377674	1377679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400815
26153	NC_018019	CAA	2	6	1377717	1377722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400815
26154	NC_018019	ACTT	2	8	1377750	1377757	25 %	50 %	0 %	25 %	392400815
26155	NC_018019	GTC	2	6	1377765	1377770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26156	NC_018019	GCA	2	6	1377790	1377795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26157	NC_018019	GCT	2	6	1377832	1377837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26158	NC_018019	TTTG	2	8	1377843	1377850	0 %	75 %	25 %	0 %	392400815
26159	NC_018019	TCA	2	6	1377907	1377912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400815
26160	NC_018019	GCT	2	6	1377917	1377922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26161	NC_018019	TCA	2	6	1377997	1378002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400815
26162	NC_018019	CAG	2	6	1378127	1378132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26163	NC_018019	ATCAGC	2	12	1378194	1378205	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392400815
26164	NC_018019	TCT	2	6	1378324	1378329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400815
26165	NC_018019	TAC	2	6	1378455	1378460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400815
26166	NC_018019	AGC	2	6	1378482	1378487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26167	NC_018019	TG	3	6	1378618	1378623	0 %	50 %	50 %	0 %	392400815
26168	NC_018019	TTC	2	6	1378707	1378712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400815
26169	NC_018019	CGT	2	6	1378829	1378834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26170	NC_018019	TGTCA	2	10	1378836	1378845	20 %	40 %	20 %	20 %	392400815
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26176	NC_018019	CAG	2	6	1379124	1379129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400815
26177	NC_018019	CATC	2	8	1379147	1379154	25 %	25 %	0 %	50 %	392400815
26178	NC_018019	GCT	2	6	1379227	1379232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400815
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26182	NC_018019	CT	3	6	1379497	1379502	0 %	50 %	0 %	50 %	392400816
26183	NC_018019	GTT	2	6	1379575	1379580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400816
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26185	NC_018019	ACG	2	6	1379628	1379633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400816
26186	NC_018019	CTA	2	6	1379646	1379651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400816
26187	NC_018019	A	6	6	1379789	1379794	100 %	0 %	0 %	0 %	392400816
26188	NC_018019	GAA	2	6	1380118	1380123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26189	NC_018019	TGC	2	6	1380132	1380137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26190	NC_018019	GCA	2	6	1380140	1380145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26191	NC_018019	GCGG	2	8	1380223	1380230	0 %	0 %	75 %	25 %	392400817
26192	NC_018019	TG	3	6	1380241	1380246	0 %	50 %	50 %	0 %	392400817
26193	NC_018019	GTT	3	9	1380290	1380298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400817
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26204	NC_018019	GAT	2	6	1380750	1380755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400817
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26207	NC_018019	GAA	2	6	1380936	1380941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26208	NC_018019	ATA	2	6	1380996	1381001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26209	NC_018019	ACGGT	2	10	1381013	1381022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26210	NC_018019	TTC	2	6	1381046	1381051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400818
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26215	NC_018019	AAC	2	6	1381292	1381297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400818
26216	NC_018019	ACG	2	6	1381334	1381339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400818
26217	NC_018019	T	6	6	1381367	1381372	0 %	100 %	0 %	0 %	392400818
26218	NC_018019	TGC	2	6	1381409	1381414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400818
26219	NC_018019	AGC	2	6	1381459	1381464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400818
26220	NC_018019	AAC	2	6	1381482	1381487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400818
26221	NC_018019	TTC	2	6	1381601	1381606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400818
26222	NC_018019	TAC	2	6	1381637	1381642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400818
26223	NC_018019	ACG	2	6	1381655	1381660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400818
26224	NC_018019	GGTTT	2	10	1381733	1381742	0 %	60 %	40 %	0 %	392400818
26225	NC_018019	TGA	2	6	1381754	1381759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400818
26226	NC_018019	AGC	2	6	1381883	1381888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400818
26227	NC_018019	GCT	2	6	1381929	1381934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400818
26228	NC_018019	AGC	2	6	1381954	1381959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400818
26229	NC_018019	GAA	2	6	1381964	1381969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400818
26230	NC_018019	TACCG	2	10	1381991	1382000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26231	NC_018019	CTT	2	6	1382062	1382067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26232	NC_018019	CAT	2	6	1382092	1382097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26233	NC_018019	ACA	2	6	1382140	1382145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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